Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Rpl30-206ENSMUST00000142643 505 ntTSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
TtrP07309 Mup-ps4-201ENSMUST00000151005 539 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TtrP07309 Gm25224-201ENSMUST00000158195 68 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TtrP07309 Gm16311-201ENSMUST00000161939 702 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
TtrP07309 Defa27-201ENSMUST00000167683 282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
TtrP07309 Gm4540-201ENSMUST00000170669 429 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TtrP07309 Olfr180-201ENSMUST00000171656 1154 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.28□□□□□ -2.2
TtrP07309 Vmn1r-ps48-201ENSMUST00000176352 886 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TtrP07309 Mup-ps11-201ENSMUST00000178040 545 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TtrP07309 Mup-ps7-201ENSMUST00000178292 545 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TtrP07309 Mup-ps3-201ENSMUST00000178315 545 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TtrP07309 Gm22776-201ENSMUST00000178634 94 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TtrP07309 Mup-ps8-201ENSMUST00000178663 545 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TtrP07309 Mup-ps9-201ENSMUST00000178847 545 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TtrP07309 Gm23767-201ENSMUST00000179278 94 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TtrP07309 Mup-ps6-201ENSMUST00000179564 545 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TtrP07309 Gm27443-201ENSMUST00000184660 98 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TtrP07309 Gm44477-201ENSMUST00000199661 110 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TtrP07309 Gm7946-201ENSMUST00000203326 958 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TtrP07309 Gm44459-201ENSMUST00000203926 160 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TtrP07309 Gm32531-201ENSMUST00000209324 373 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
TtrP07309 Olfr928-ps1-201ENSMUST00000213313 237 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TtrP07309 Olfr962-ps1-201ENSMUST00000217332 442 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TtrP07309 Olfr746-202ENSMUST00000218546 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
TtrP07309 CT571256.1-201ENSMUST00000226045 585 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TtrP07309 AC113031.4-201ENSMUST00000228381 514 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TtrP07309 Olfr952-201ENSMUST00000073895 1056 ntAPPRIS P1 BASIC1.28□□□□□ -2.2
TtrP07309 Olfr1459-201ENSMUST00000078299 1102 ntAPPRIS P1 BASIC1.28□□□□□ -2.2
TtrP07309 Skint11-201ENSMUST00000079915 820 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
TtrP07309 Olfr746-201ENSMUST00000080616 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.28□□□□□ -2.2
TtrP07309 Gm23939-201ENSMUST00000082880 133 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TtrP07309 Snora33-201ENSMUST00000093556 129 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TtrP07309 Gm21286-201ENSMUST00000098035 545 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TtrP07309 Vmn2r-ps83-201ENSMUST00000173787 2368 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
TtrP07309 Gm19541-201ENSMUST00000184488 2868 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
TtrP07309 Vmn1r78-203ENSMUST00000228664 8100 ntAPPRIS P1 BASIC1.28□□□□□ -2.21
TtrP07309 Klra10-201ENSMUST00000112020 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
TtrP07309 Gm22488-201ENSMUST00000116811 127 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TtrP07309 Gm12871-201ENSMUST00000118758 438 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TtrP07309 Gm12646-201ENSMUST00000119144 238 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TtrP07309 Gm12926-201ENSMUST00000121158 409 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TtrP07309 Gm2012-201ENSMUST00000121900 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
TtrP07309 Gm26256-201ENSMUST00000122499 186 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TtrP07309 Gm14426-201ENSMUST00000128562 249 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
TtrP07309 Gm13184-201ENSMUST00000149932 626 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
TtrP07309 Gm24908-201ENSMUST00000157294 127 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TtrP07309 Gm23718-201ENSMUST00000157350 307 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TtrP07309 Adgrg4-206ENSMUST00000168724 531 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TtrP07309 Gm27991-201ENSMUST00000184804 137 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TtrP07309 Mir7678-201ENSMUST00000185076 71 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TtrP07309 1700040F17Rik-201ENSMUST00000187158 817 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
TtrP07309 Gm19694-201ENSMUST00000192364 505 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TtrP07309 Gm7299-201ENSMUST00000194441 581 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
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TtrP07309 Gm18340-201ENSMUST00000196342 609 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TtrP07309 Gm42924-201ENSMUST00000197261 185 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TtrP07309 Gm43578-201ENSMUST00000201250 459 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TtrP07309 Gm44693-201ENSMUST00000208141 460 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
TtrP07309 Cenpk-201ENSMUST00000022227 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
TtrP07309 AC101945.1-201ENSMUST00000226734 466 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TtrP07309 Vmn1r229-201ENSMUST00000076759 921 ntAPPRIS P1 BASIC1.27□□□□□ -2.21
TtrP07309 Gm24406-201ENSMUST00000083026 128 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TtrP07309 Gm24412-201ENSMUST00000083426 109 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TtrP07309 Obp1a-201ENSMUST00000088201 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
TtrP07309 Gm24817-201ENSMUST00000093672 105 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TtrP07309 Gm43753-201ENSMUST00000196539 3309 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
TtrP07309 Olfr1018-202ENSMUST00000214416 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
TtrP07309 Adam29-201ENSMUST00000053441 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
TtrP07309 Olfr869-201ENSMUST00000213024 1783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
TtrP07309 AL645643.1-201ENSMUST00000222438 3897 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TtrP07309 Vmn1r178-203ENSMUST00000226489 2644 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TtrP07309 Gm7237-201ENSMUST00000148435 1401 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
TtrP07309 Igkv17-127-201ENSMUST00000103309 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
TtrP07309 Gm14401-203ENSMUST00000108970 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.26□□□□□ -2.21
TtrP07309 Gm12814-201ENSMUST00000117091 846 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
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TtrP07309 Dnaic1-202ENSMUST00000119127 500 ntTSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
TtrP07309 Gm12607-201ENSMUST00000120724 493 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TtrP07309 Scgb2b22-ps-201ENSMUST00000121947 340 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TtrP07309 Gm12865-201ENSMUST00000137353 326 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
TtrP07309 Gm23473-201ENSMUST00000158883 116 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TtrP07309 Olfr421-ps1-201ENSMUST00000179386 1050 ntAPPRIS P1 BASIC1.26□□□□□ -2.21
TtrP07309 Scgb2b14-ps-201ENSMUST00000189424 336 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TtrP07309 Gm33866-201ENSMUST00000196911 289 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TtrP07309 Gm45365-201ENSMUST00000209489 256 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TtrP07309 Olfr955-201ENSMUST00000073946 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.26□□□□□ -2.21
TtrP07309 Gm23727-201ENSMUST00000083352 164 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
TtrP07309 Olfr791-202ENSMUST00000217228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
TtrP07309 Olfr389-203ENSMUST00000215418 3417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
TtrP07309 Hsf3-202ENSMUST00000119035 2691 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
TtrP07309 Olfr1105-202ENSMUST00000215978 3012 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
TtrP07309 Vmn1r75-203ENSMUST00000226855 6548 ntAPPRIS P2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
TtrP07309 Trbv5-201ENSMUST00000103266 368 ntAPPRIS P1 BASIC1.25□□□□□ -2.21
TtrP07309 Cyp4a29-ps1-201ENSMUST00000120882 171 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TtrP07309 Gm15223-201ENSMUST00000120989 826 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TtrP07309 Gm24478-201ENSMUST00000157439 158 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TtrP07309 Gm17063-201ENSMUST00000168135 456 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TtrP07309 Olfr758-ps1-201ENSMUST00000173901 841 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TtrP07309 Mir6916-201ENSMUST00000184514 63 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
TtrP07309 Gm37550-201ENSMUST00000193230 463 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
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