Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Olfr791-201ENSMUST00000057477 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Olfr1459-201ENSMUST00000078299 1102 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm22061-201ENSMUST00000082557 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm22508-201ENSMUST00000082772 110 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 4930595M18Rik-201ENSMUST00000080083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm38071-201ENSMUST00000195792 3378 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Olfr218-202ENSMUST00000215844 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm24127-201ENSMUST00000104110 130 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm25728-201ENSMUST00000104525 159 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Clec1b-202ENSMUST00000112079 455 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm11460-201ENSMUST00000118200 361 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm8217-201ENSMUST00000119136 465 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm14417-201ENSMUST00000120036 1074 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm13424-201ENSMUST00000122301 354 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm22452-201ENSMUST00000122804 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm15671-201ENSMUST00000124160 576 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm22766-201ENSMUST00000158372 99 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm8871-202ENSMUST00000168945 549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm26195-201ENSMUST00000175035 101 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Mir3965-201ENSMUST00000175570 69 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm21828-201ENSMUST00000178050 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm23619-201ENSMUST00000178411 94 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm21866-201ENSMUST00000178428 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm21725-201ENSMUST00000178519 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm21800-201ENSMUST00000178559 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm25474-201ENSMUST00000179052 94 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm21852-201ENSMUST00000179125 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm22047-201ENSMUST00000179176 94 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm21764-201ENSMUST00000179219 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm21891-201ENSMUST00000179284 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm21904-201ENSMUST00000179522 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm28648-201ENSMUST00000190092 343 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm29516-201ENSMUST00000190402 468 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm45192-201ENSMUST00000206749 283 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 AC153957.1-201ENSMUST00000215235 229 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm3442-201ENSMUST00000216808 710 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Klra6-201ENSMUST00000074056 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Spata45-201ENSMUST00000077889 432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Zfp972-201ENSMUST00000081529 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 n-R5s37-201ENSMUST00000082533 118 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm25796-201ENSMUST00000082645 163 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm22622-201ENSMUST00000082870 129 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm26494-201ENSMUST00000083154 143 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm24493-201ENSMUST00000083805 143 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm23848-201ENSMUST00000083826 106 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Spata31-201ENSMUST00000070216 3232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm816-201ENSMUST00000191156 2456 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm22658-201ENSMUST00000104196 155 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Mir465c-2-201ENSMUST00000104757 81 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Rpl10-ps4-201ENSMUST00000117120 286 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm11358-201ENSMUST00000122310 373 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm25052-201ENSMUST00000122661 158 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 n-R5s216-201ENSMUST00000122755 112 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm25294-201ENSMUST00000122791 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm13793-201ENSMUST00000124214 438 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Ssxb6-201ENSMUST00000138642 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm26280-201ENSMUST00000157096 101 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm25153-201ENSMUST00000157118 156 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm22560-201ENSMUST00000157332 120 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm24959-201ENSMUST00000157924 146 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm22098-201ENSMUST00000157930 85 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm26041-201ENSMUST00000158148 108 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 4930473D10Rik-201ENSMUST00000161975 487 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Snord116l12-201ENSMUST00000179816 94 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Ranbp2-ps3-201ENSMUST00000183549 388 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm27505-201ENSMUST00000185071 110 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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Ccl20O89093 Gm29232-201ENSMUST00000189100 297 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
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Ccl20O89093 Smr2-201ENSMUST00000087043 676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Mir465c-1-201ENSMUST00000093560 81 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Ogn-201ENSMUST00000021822 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Vmn1r75-206ENSMUST00000228463 6508 ntAPPRIS P2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm42801-201ENSMUST00000202562 2865 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm43663-201ENSMUST00000198643 1505 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Vmn1r29-204ENSMUST00000228038 4520 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm13343-201ENSMUST00000116474 105 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm13756-201ENSMUST00000117618 222 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm15175-201ENSMUST00000117629 132 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm15282-201ENSMUST00000117707 300 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm11356-201ENSMUST00000118974 192 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm14765-201ENSMUST00000121954 326 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm12443-201ENSMUST00000122308 323 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm25706-201ENSMUST00000157828 247 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm16561-201ENSMUST00000163001 192 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm24925-201ENSMUST00000178157 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm27869-201ENSMUST00000184327 122 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm28595-201ENSMUST00000186223 437 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm43016-201ENSMUST00000196628 3150 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Mir7232-201ENSMUST00000197929 74 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 4930404A12Rik-201ENSMUST00000199356 726 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccl20O89093 Gm31752-201ENSMUST00000199456 856 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
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