Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Gm28838-201ENSMUST00000186338 315 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ArxO35085 Gm29635-201ENSMUST00000187221 315 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ArxO35085 Gm29026-201ENSMUST00000187787 315 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ArxO35085 Gm28797-201ENSMUST00000188543 315 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ArxO35085 Gm28855-201ENSMUST00000188680 315 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ArxO35085 Gm28705-201ENSMUST00000189548 315 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ArxO35085 Gm28924-201ENSMUST00000190012 241 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ArxO35085 1700015G11Rik-204ENSMUST00000190307 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ArxO35085 Gm28939-201ENSMUST00000190351 315 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ArxO35085 Gm28223-201ENSMUST00000190469 315 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ArxO35085 Gm29092-201ENSMUST00000190768 315 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ArxO35085 Gm37961-201ENSMUST00000192729 299 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ArxO35085 Gm44476-201ENSMUST00000196225 91 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
ArxO35085 Kap-202ENSMUST00000203168 464 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ArxO35085 Gm45738-201ENSMUST00000203645 233 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ArxO35085 Hypm-201ENSMUST00000044987 581 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ArxO35085 Olfr661-202ENSMUST00000214876 3790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ArxO35085 Jmjd1c-206ENSMUST00000173689 8609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ArxO35085 Olfr1477-202ENSMUST00000217001 4000 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
ArxO35085 Zfp946-204ENSMUST00000167740 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
ArxO35085 Vmn2r-ps46-201ENSMUST00000172969 2556 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
ArxO35085 Gm43780-201ENSMUST00000196510 3600 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ArxO35085 Vmn1r211-202ENSMUST00000228645 5447 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ArxO35085 Igkv12-98-201ENSMUST00000103327 344 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ArxO35085 Cmah-202ENSMUST00000110391 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ArxO35085 Gm14107-201ENSMUST00000117774 330 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ArxO35085 Rab7b-203ENSMUST00000129905 476 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ArxO35085 Gm281-201ENSMUST00000144914 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ArxO35085 A630050E04Rik-201ENSMUST00000151443 581 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ArxO35085 Scgb2b17-202ENSMUST00000182640 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ArxO35085 Gm19637-201ENSMUST00000185933 579 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ArxO35085 Gm29064-201ENSMUST00000187014 813 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ArxO35085 Gm23370-202ENSMUST00000197008 129 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ArxO35085 Gm45403-201ENSMUST00000209453 276 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ArxO35085 AC167140.1-201ENSMUST00000224710 403 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ArxO35085 Olfr1176-201ENSMUST00000057439 949 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
ArxO35085 Gm22806-201ENSMUST00000082738 136 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ArxO35085 Gm24764-201ENSMUST00000083686 199 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ArxO35085 Gm25651-201ENSMUST00000083782 119 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ArxO35085 Gm26164-201ENSMUST00000083793 104 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ArxO35085 Gm22353-201ENSMUST00000083918 136 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
ArxO35085 Prkdc-201ENSMUST00000023352 12647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
ArxO35085 Pign-205ENSMUST00000186485 6759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ArxO35085 Cp-202ENSMUST00000091309 4029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ArxO35085 Gm43844-201ENSMUST00000202926 5605 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ArxO35085 Gm42446-201ENSMUST00000199783 3284 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ArxO35085 Olfr894-202ENSMUST00000212992 3234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ArxO35085 Cast-208ENSMUST00000223033 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ArxO35085 Igkv14-111-201ENSMUST00000103320 368 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ArxO35085 Snora64-201ENSMUST00000104521 134 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ArxO35085 Tpt1-ps3-201ENSMUST00000121046 519 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ArxO35085 Nell1os-201ENSMUST00000134584 489 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ArxO35085 Gm27896-201ENSMUST00000175162 317 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ArxO35085 Mir7022-201ENSMUST00000183749 61 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ArxO35085 Gm28786-201ENSMUST00000187228 172 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
ArxO35085 AC133189.1-201ENSMUST00000198820 140 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ArxO35085 Gm34648-201ENSMUST00000202460 338 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ArxO35085 Gm44072-201ENSMUST00000203666 383 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ArxO35085 Vmn1r-ps13-201ENSMUST00000204697 134 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ArxO35085 Gm2829-201ENSMUST00000213121 499 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ArxO35085 AC123803.1-201ENSMUST00000216093 189 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ArxO35085 Gm25202-201ENSMUST00000082838 191 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ArxO35085 Mir193a-201ENSMUST00000083461 66 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
ArxO35085 Olfr112-201ENSMUST00000085548 3103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ArxO35085 Olfr873-205ENSMUST00000215540 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
ArxO35085 Ank2-208ENSMUST00000182078 14305 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ArxO35085 Gm14305-202ENSMUST00000108981 1646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ArxO35085 Gm14308-201ENSMUST00000108990 1628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ArxO35085 Olfr1270-206ENSMUST00000217139 4803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ArxO35085 Gm37011-201ENSMUST00000195543 2935 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ArxO35085 Olfr1135-202ENSMUST00000213835 2648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ArxO35085 mt-Nd5-201ENSMUST00000082418 1824 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ArxO35085 Gm26156-201ENSMUST00000116999 123 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ArxO35085 Gm9157-201ENSMUST00000117673 225 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ArxO35085 Gm16106-201ENSMUST00000119187 294 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ArxO35085 Olfr1169-ps1-201ENSMUST00000121437 233 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ArxO35085 Gm26256-201ENSMUST00000122499 186 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ArxO35085 Gm16068-201ENSMUST00000136557 504 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ArxO35085 Gm22037-201ENSMUST00000157280 296 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ArxO35085 Gm23579-201ENSMUST00000158528 103 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ArxO35085 Gm1992-201ENSMUST00000161581 250 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ArxO35085 Gm18520-201ENSMUST00000174783 658 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ArxO35085 Gm6214-201ENSMUST00000178845 541 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ArxO35085 Cypt14-201ENSMUST00000179096 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ArxO35085 Gm32033-201ENSMUST00000193483 339 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ArxO35085 Olfr682-ps1-202ENSMUST00000214399 897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ArxO35085 Olfr1202-203ENSMUST00000217059 1153 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ArxO35085 Gm45815-201ENSMUST00000220241 146 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ArxO35085 AC130829.3-201ENSMUST00000222735 154 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
ArxO35085 Gm33958-201ENSMUST00000222879 450 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ArxO35085 Olfr1202-201ENSMUST00000072057 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ArxO35085 Vmn1r174-202ENSMUST00000228331 9058 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
ArxO35085 2310003L06Rik-201ENSMUST00000007601 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
ArxO35085 9530051G07Rik-201ENSMUST00000127673 4414 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
ArxO35085 Olfr1316-202ENSMUST00000213696 4184 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ArxO35085 Olfr470-203ENSMUST00000220193 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ArxO35085 Olfr164-202ENSMUST00000216157 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
ArxO35085 Gm12235-201ENSMUST00000118596 170 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ArxO35085 Gm11931-201ENSMUST00000121630 447 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
ArxO35085 Gm29247-202ENSMUST00000148542 571 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
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