Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Gm25323-201ENSMUST00000122555 103 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm13794-201ENSMUST00000148637 468 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm23469-201ENSMUST00000157131 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm26358-201ENSMUST00000158215 97 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Vmn2r-ps73-201ENSMUST00000173890 1194 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Mir3471-1-201ENSMUST00000175139 131 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm20648-201ENSMUST00000175815 328 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Olfr421-ps1-201ENSMUST00000179386 1050 ntAPPRIS P1 BASIC0.52□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 1700025F22Rik-204ENSMUST00000181567 578 ntTSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 AC159819.1-201ENSMUST00000213911 328 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 AC123064.2-201ENSMUST00000217758 193 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Lilr4b-211ENSMUST00000219661 1143 ntTSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Sva-201ENSMUST00000024059 651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm24538-201ENSMUST00000082612 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Mir1904-201ENSMUST00000122702 80 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm22842-201ENSMUST00000157709 118 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm7871-201ENSMUST00000195346 618 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm9402-201ENSMUST00000196849 388 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Igkv1-136-201ENSMUST00000200635 297 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm44727-201ENSMUST00000204225 451 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm19855-201ENSMUST00000210145 249 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 AC156795.1-201ENSMUST00000214655 414 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm34983-201ENSMUST00000219484 396 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 AC132384.11-201ENSMUST00000219676 178 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 AC173345.3-201ENSMUST00000221245 1093 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 AC159239.1-201ENSMUST00000221767 603 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Rpl31-ps1-201ENSMUST00000085128 378 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm44897-201ENSMUST00000206187 1341 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Olfr659-202ENSMUST00000214986 4842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Skint10-201ENSMUST00000060327 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm24273-201ENSMUST00000102332 164 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm26478-201ENSMUST00000122611 133 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm25601-201ENSMUST00000158356 105 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm31942-201ENSMUST00000192534 827 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Ranbp2-ps12-201ENSMUST00000197110 386 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm42476-201ENSMUST00000198860 554 ntTSL 3 BASIC0.52□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm22806-201ENSMUST00000082738 136 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Rex2-201ENSMUST00000075775 3993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.52□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 F8-202ENSMUST00000114085 7295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Rpl31-ps22-201ENSMUST00000117961 337 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm14765-201ENSMUST00000121954 326 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm37005-201ENSMUST00000193281 1164 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 1700014F14Rik-201ENSMUST00000199566 197 ntTSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm45678-201ENSMUST00000210509 295 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 AC167229.1-201ENSMUST00000220057 469 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 AC160930.1-201ENSMUST00000227194 337 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm26458-201ENSMUST00000082832 128 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 AC164629.4-201ENSMUST00000218505 3247 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm12760-201ENSMUST00000117861 482 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm13454-201ENSMUST00000118166 483 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Rpl23a-ps13-201ENSMUST00000120350 441 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm13787-201ENSMUST00000120422 168 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm24478-201ENSMUST00000157439 158 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm21409-201ENSMUST00000186110 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.51□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm28641-201ENSMUST00000187783 335 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm43739-201ENSMUST00000198294 307 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 AC115878.1-201ENSMUST00000227247 334 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Olfr784-201ENSMUST00000082342 960 ntAPPRIS P1 BASIC0.51□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm25199-201ENSMUST00000083095 104 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Spink11-201ENSMUST00000097587 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.51□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Olfr1220-201ENSMUST00000099789 1026 ntAPPRIS P1 BASIC0.51□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Olfr1220-202ENSMUST00000099806 1201 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Esp34-202ENSMUST00000178654 1413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.51□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Igkv17-127-201ENSMUST00000103309 341 ntAPPRIS ALT2 BASIC0.51□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Mir292-201ENSMUST00000104847 82 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm24942-201ENSMUST00000158328 114 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Mrps36-ps3-201ENSMUST00000183899 305 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 1810022K09Rik-204ENSMUST00000186870 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.51□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm29552-201ENSMUST00000190548 660 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 CAAA01216754.4-201ENSMUST00000216416 802 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 AC155921.1-201ENSMUST00000216568 3841 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 CT030194.2-201ENSMUST00000225752 379 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Pdcd10-201ENSMUST00000029424 907 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Mir362-201ENSMUST00000093592 65 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm12448-201ENSMUST00000118852 655 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm15212-201ENSMUST00000122403 466 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm25279-201ENSMUST00000122608 133 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm15584-201ENSMUST00000123231 759 ntTSL 2 BASIC0.51□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm25886-201ENSMUST00000157780 114 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm23477-201ENSMUST00000158882 128 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Snord53-201ENSMUST00000175146 78 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm26713-201ENSMUST00000181827 627 ntTSL 1 (best) BASIC0.51□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm27980-201ENSMUST00000184094 169 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm29281-201ENSMUST00000188077 381 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Olfr165-203ENSMUST00000206410 1040 ntAPPRIS P2 BASIC0.51□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 4930598N05Rik-205ENSMUST00000208693 873 ntTSL 1 (best) BASIC0.51□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm40646-201ENSMUST00000218243 490 ntTSL 5 BASIC0.51□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Olfr165-201ENSMUST00000052516 1040 ntAPPRIS ALT1 BASIC0.51□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Olfr868-202ENSMUST00000212999 4233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC0.51□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm11337-201ENSMUST00000144770 335 ntTSL 2 BASIC0.51□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm25447-201ENSMUST00000158997 128 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Mir5127-201ENSMUST00000175295 71 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Mup-ps7-201ENSMUST00000178292 545 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Mir7063-201ENSMUST00000184158 91 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Mir7016-201ENSMUST00000184308 72 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm42672-201ENSMUST00000197821 352 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm43675-201ENSMUST00000199468 1184 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm42807-201ENSMUST00000200141 329 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 Gm44339-201ENSMUST00000200598 84 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
NebE9Q1W3 AC117588.2-201ENSMUST00000228340 311 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
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