Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Gm38076-201ENSMUST00000193889 450 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Spocd1B1ASB6 Gm43427-201ENSMUST00000198188 331 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Spocd1B1ASB6 Gm42453-201ENSMUST00000200477 409 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Spocd1B1ASB6 Gm43028-201ENSMUST00000202561 481 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Spocd1B1ASB6 Gm6303-201ENSMUST00000210123 471 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Spocd1B1ASB6 AC153864.2-201ENSMUST00000220424 292 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Spocd1B1ASB6 Gm5548-201ENSMUST00000055878 397 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Spocd1B1ASB6 Gm9795-201ENSMUST00000062156 693 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Spocd1B1ASB6 Gm24817-201ENSMUST00000093672 105 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Spocd1B1ASB6 Gm10509-201ENSMUST00000097384 259 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Spocd1B1ASB6 Elf1-202ENSMUST00000110835 3888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Spocd1B1ASB6 Olfr361-203ENSMUST00000216663 2617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Spocd1B1ASB6 Cd180-201ENSMUST00000022124 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Spocd1B1ASB6 Gm43913-201ENSMUST00000203924 3029 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Spocd1B1ASB6 Slfn10-ps-201ENSMUST00000100716 3621 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Spocd1B1ASB6 BB287469-201ENSMUST00000110149 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Spocd1B1ASB6 Gm4027-201ENSMUST00000164838 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Spocd1B1ASB6 Olfr1143-202ENSMUST00000099852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Spocd1B1ASB6 Gm42524-201ENSMUST00000202881 2214 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Spocd1B1ASB6 Aspn-202ENSMUST00000177948 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Spocd1B1ASB6 Dnah7a-201ENSMUST00000094964 12245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Spocd1B1ASB6 Chl1-201ENSMUST00000066905 7562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Spocd1B1ASB6 Vmn1r172-201ENSMUST00000038694 9009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Spocd1B1ASB6 Gm25560-201ENSMUST00000104606 176 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Spocd1B1ASB6 Mup-ps20-201ENSMUST00000121132 389 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Spocd1B1ASB6 Gm14581-201ENSMUST00000121726 198 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Spocd1B1ASB6 Gm25104-201ENSMUST00000122476 163 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Spocd1B1ASB6 Gm26479-201ENSMUST00000122620 106 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Spocd1B1ASB6 Gm2182-201ENSMUST00000145243 663 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Spocd1B1ASB6 Gm25908-201ENSMUST00000157624 98 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Spocd1B1ASB6 Gm24876-201ENSMUST00000158780 92 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Spocd1B1ASB6 Gm3636-202ENSMUST00000163850 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Spocd1B1ASB6 Cfap97-206ENSMUST00000164504 4521 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Spocd1B1ASB6 Vmn1r-ps83-201ENSMUST00000172677 705 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Spocd1B1ASB6 Gm19774-201ENSMUST00000190667 114 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Spocd1B1ASB6 Gm37461-201ENSMUST00000193929 3704 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Spocd1B1ASB6 Gm8013-201ENSMUST00000200139 462 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Spocd1B1ASB6 Gm44881-201ENSMUST00000205425 367 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Spocd1B1ASB6 Gm19366-201ENSMUST00000206996 156 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Spocd1B1ASB6 Gm44532-201ENSMUST00000207723 2598 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Spocd1B1ASB6 AC153365.1-201ENSMUST00000219016 2031 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Spocd1B1ASB6 AC130536.1-201ENSMUST00000224425 271 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Spocd1B1ASB6 Gm23095-201ENSMUST00000083446 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Spocd1B1ASB6 Elavl4-206ENSMUST00000106601 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
Spocd1B1ASB6 Cd84-205ENSMUST00000155802 3291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Spocd1B1ASB6 Dnah7b-201ENSMUST00000069293 12314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
Spocd1B1ASB6 Vmn2r93-201ENSMUST00000079206 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
Spocd1B1ASB6 Pkhd1l1-203ENSMUST00000209244 12949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Spocd1B1ASB6 Gm45557-201ENSMUST00000210004 1651 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Spocd1B1ASB6 Ptprz1-201ENSMUST00000090568 8068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Spocd1B1ASB6 Gm25169-201ENSMUST00000104190 129 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Spocd1B1ASB6 Gm24792-201ENSMUST00000104286 128 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Spocd1B1ASB6 Gm15846-201ENSMUST00000116022 320 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Spocd1B1ASB6 Gm15151-201ENSMUST00000117106 177 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Spocd1B1ASB6 Gm22314-201ENSMUST00000158007 281 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Spocd1B1ASB6 Gm27510-201ENSMUST00000158214 64 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Spocd1B1ASB6 Gm7568-203ENSMUST00000161626 415 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Spocd1B1ASB6 Gm26779-201ENSMUST00000181101 551 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Spocd1B1ASB6 Gm27476-201ENSMUST00000183366 104 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Spocd1B1ASB6 Gm27695-201ENSMUST00000184301 91 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Spocd1B1ASB6 Gm19503-201ENSMUST00000187109 241 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Spocd1B1ASB6 Gm36946-201ENSMUST00000192706 435 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Spocd1B1ASB6 Gm37732-201ENSMUST00000194377 316 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Spocd1B1ASB6 Gm43284-201ENSMUST00000200103 253 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Spocd1B1ASB6 Gm25203-202ENSMUST00000200458 216 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Spocd1B1ASB6 CT030242.2-201ENSMUST00000221588 148 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Spocd1B1ASB6 AC126253.2-201ENSMUST00000226518 205 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Spocd1B1ASB6 AC172751.1-201ENSMUST00000226887 440 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Spocd1B1ASB6 Gm9805-201ENSMUST00000055305 171 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Spocd1B1ASB6 Olfr294-201ENSMUST00000078588 1008 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Spocd1B1ASB6 Gm25203-201ENSMUST00000082842 215 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Spocd1B1ASB6 Gm23041-201ENSMUST00000083868 106 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Spocd1B1ASB6 Eif1-ps1-201ENSMUST00000086606 330 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Spocd1B1ASB6 Gm7381-201ENSMUST00000098958 300 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Spocd1B1ASB6 Olfr986-204ENSMUST00000218134 3487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Spocd1B1ASB6 Gm37742-201ENSMUST00000193263 3979 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Spocd1B1ASB6 Gm37879-201ENSMUST00000193112 1995 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Spocd1B1ASB6 Olfr149-202ENSMUST00000215192 2806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Spocd1B1ASB6 Olfr1126-202ENSMUST00000213366 1827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Spocd1B1ASB6 Gm3623-201ENSMUST00000173643 2747 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Spocd1B1ASB6 Vmn2r7-202ENSMUST00000161972 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Spocd1B1ASB6 Rmi1-202ENSMUST00000224479 4212 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Spocd1B1ASB6 Ocrl-202ENSMUST00000115013 2910 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Spocd1B1ASB6 Olfr418-202ENSMUST00000213420 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Spocd1B1ASB6 Nbeal1-203ENSMUST00000160834 15731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Spocd1B1ASB6 Olfr597-202ENSMUST00000216456 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Spocd1B1ASB6 Gm26147-201ENSMUST00000104479 114 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Spocd1B1ASB6 Gm16242-201ENSMUST00000117741 334 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Spocd1B1ASB6 Junos-205ENSMUST00000130684 614 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Spocd1B1ASB6 4930451E10Rik-201ENSMUST00000130840 409 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Spocd1B1ASB6 Gm22059-201ENSMUST00000157544 104 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Spocd1B1ASB6 Gm26036-201ENSMUST00000158149 144 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Spocd1B1ASB6 Gm23197-201ENSMUST00000158809 112 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Spocd1B1ASB6 Gm23816-201ENSMUST00000179617 132 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Spocd1B1ASB6 Hmgb1-rs16-201ENSMUST00000185927 613 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Spocd1B1ASB6 Gm28118-201ENSMUST00000185957 294 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Spocd1B1ASB6 Gm43730-201ENSMUST00000199863 372 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Spocd1B1ASB6 4930431L21Rik-202ENSMUST00000200253 624 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Spocd1B1ASB6 Gm45772-201ENSMUST00000212961 240 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Spocd1B1ASB6 AC159896.1-201ENSMUST00000215264 215 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
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