Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Gm23743-201ENSMUST00000157389 274 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Trav14n-1-201ENSMUST00000177578 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Gm27551-201ENSMUST00000184258 77 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Trav14d-1-202ENSMUST00000187138 340 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Gm38011-201ENSMUST00000193312 279 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Rnu3a-202ENSMUST00000196710 213 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Gm42542-201ENSMUST00000197978 268 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 AC122464.1-201ENSMUST00000202789 770 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Gm44519-201ENSMUST00000206486 122 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Gm44583-201ENSMUST00000207478 281 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Gm45422-201ENSMUST00000211476 246 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 AC160134.1-201ENSMUST00000213450 551 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Gm8274-201ENSMUST00000219820 463 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Vmn1r34-202ENSMUST00000226262 2952 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 AC165953.1-201ENSMUST00000226386 357 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Gm22456-201ENSMUST00000082578 125 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Gm24166-201ENSMUST00000082724 135 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Rnu3a-201ENSMUST00000083936 214 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Vmn2r71-201ENSMUST00000172338 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Gm45393-201ENSMUST00000211634 2631 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Gm37174-201ENSMUST00000194699 3058 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Olfr1348-207ENSMUST00000209029 2696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Gm37236-201ENSMUST00000193670 3249 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 3222401L13Rik-202ENSMUST00000192137 6292 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Olfr513-202ENSMUST00000214670 2029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Ctps2-204ENSMUST00000112301 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Olfr1500-202ENSMUST00000214475 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Gm43047-201ENSMUST00000200089 3460 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Gm44439-201ENSMUST00000203379 3592 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Ermn-201ENSMUST00000090940 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 AC153964.2-201ENSMUST00000217704 2474 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Traj56-201ENSMUST00000103689 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Gm25418-201ENSMUST00000104214 129 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Gm23492-201ENSMUST00000116837 115 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Gm15613-201ENSMUST00000118396 326 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Snhg14-201ENSMUST00000185272 726 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Gm28755-201ENSMUST00000185773 199 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Gm9687-201ENSMUST00000189312 602 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Gm28500-201ENSMUST00000190286 151 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Gm28179-203ENSMUST00000191382 544 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 N4bp2os-201ENSMUST00000201547 235 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 4930487D11Rik-201ENSMUST00000201983 295 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Snhg1-205ENSMUST00000205825 495 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 1700037F03Rik-201ENSMUST00000223032 365 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Rpl26-201ENSMUST00000073471 526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Gm23508-201ENSMUST00000083079 72 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Gm25684-201ENSMUST00000083941 107 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Zfp950-207ENSMUST00000180544 2568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Mcmdc2-203ENSMUST00000125294 2003 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Tmem72-201ENSMUST00000056623 17152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Gm31371-201ENSMUST00000211848 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 6720464F23Rik-201ENSMUST00000193946 3496 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Adam7-201ENSMUST00000022640 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Gm45222-201ENSMUST00000207029 4307 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 4931408C20Rik-201ENSMUST00000097801 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Olfr1243-202ENSMUST00000144885 3148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Olfr1118-202ENSMUST00000216396 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Olfr1489-202ENSMUST00000217182 11140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Ceacam3-201ENSMUST00000108491 3261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Vmn1r1-203ENSMUST00000227629 3654 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 5930435M05Rik-201ENSMUST00000207572 3712 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Olfr390-204ENSMUST00000215161 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Igkv6-17-201ENSMUST00000103391 377 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Gm23013-201ENSMUST00000104146 106 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Gm22657-201ENSMUST00000104197 132 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 n-R5s150-201ENSMUST00000122705 108 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Gm15735-201ENSMUST00000136187 514 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Mir1947-201ENSMUST00000158235 85 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Gm23855-201ENSMUST00000158377 135 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Mir7222-201ENSMUST00000183740 75 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Gm27477-201ENSMUST00000184649 143 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 4930535G08Rik-201ENSMUST00000192017 425 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Gm37123-201ENSMUST00000192994 1171 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Gm43993-201ENSMUST00000203972 247 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Gm32536-201ENSMUST00000205209 445 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Gm45116-201ENSMUST00000207392 275 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Gm17999-201ENSMUST00000211568 542 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Gm5010-201ENSMUST00000213131 260 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 AC241593.2-201ENSMUST00000225099 510 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Gm25818-201ENSMUST00000083282 164 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Gm23453-201ENSMUST00000083326 106 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Gm22826-201ENSMUST00000083774 165 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Gm24163-201ENSMUST00000093660 132 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Gm5248-201ENSMUST00000186108 4046 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Cftr-204ENSMUST00000129452 2835 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Pnpla8-204ENSMUST00000143771 2974 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Zfyve9-203ENSMUST00000106658 5987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Lrrtm4-202ENSMUST00000126005 3733 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Npat-201ENSMUST00000035850 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Atp1b4-202ENSMUST00000115134 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Ccdc66-202ENSMUST00000223689 4262 ntAPPRIS P2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Gm37890-201ENSMUST00000195610 3992 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 B3galt1-202ENSMUST00000112346 4977 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Gm15127-203ENSMUST00000112753 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Gm14878-201ENSMUST00000118167 293 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Gm15537-201ENSMUST00000126677 485 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Fign-203ENSMUST00000131615 9734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Vmn2r89-201ENSMUST00000159611 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 1700058P15Rik-201ENSMUST00000159981 413 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
Gpc1Q9QZF2 Gng2-206ENSMUST00000162425 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms