Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm26897-201ENSMUST00000180627 93 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Snhg14-204ENSMUST00000185890 756 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm37098-201ENSMUST00000192290 244 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Trdv3-201ENSMUST00000198551 309 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Mir6962-201ENSMUST00000199512 63 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Cycs-ps3-201ENSMUST00000223240 321 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r178-202ENSMUST00000226450 2880 ntAPPRIS P1 BASIC1.8□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm3081-201ENSMUST00000193413 3025 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm43960-201ENSMUST00000204249 5020 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm7171-201ENSMUST00000177413 1349 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm15108-201ENSMUST00000116160 803 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm13714-201ENSMUST00000117313 221 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm11268-201ENSMUST00000118347 267 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm15111-201ENSMUST00000122142 878 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm23783-201ENSMUST00000157941 102 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm23053-201ENSMUST00000175136 96 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm37337-201ENSMUST00000192601 993 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 AC133654.1-201ENSMUST00000228411 672 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm24144-201ENSMUST00000082632 111 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm22507-201ENSMUST00000082773 160 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Olfr810-201ENSMUST00000091986 1006 ntAPPRIS P1 BASIC1.8□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Zfp37-202ENSMUST00000129511 1691 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Olfr1051-202ENSMUST00000216432 2807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Olfr1051-204ENSMUST00000217294 2840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 AC123052.1-201ENSMUST00000220604 4616 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Olfr969-202ENSMUST00000213266 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Traj40-201ENSMUST00000103702 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm12137-201ENSMUST00000119565 346 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Fau-ps1-201ENSMUST00000119675 252 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm12313-201ENSMUST00000121347 421 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm15488-201ENSMUST00000121682 670 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Mup-ps15-201ENSMUST00000121741 539 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm13409-201ENSMUST00000122072 546 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm23760-201ENSMUST00000158350 116 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm24677-201ENSMUST00000158755 150 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm17538-201ENSMUST00000168236 327 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Klra5-204ENSMUST00000169901 792 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Mir7021-201ENSMUST00000197026 63 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm43431-201ENSMUST00000198577 340 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Fam24a-202ENSMUST00000207439 711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 AC154276.2-201ENSMUST00000227707 309 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm26176-201ENSMUST00000083795 105 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Tlr8-202ENSMUST00000112170 3431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm37661-201ENSMUST00000191863 1550 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm25416-201ENSMUST00000104221 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm24280-201ENSMUST00000104237 134 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm15382-201ENSMUST00000118011 537 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm14940-201ENSMUST00000119309 495 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm12512-201ENSMUST00000119620 217 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm14577-201ENSMUST00000121134 256 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm14736-201ENSMUST00000121470 336 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm11575-201ENSMUST00000122243 228 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm23190-201ENSMUST00000180307 64 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm10925-201ENSMUST00000189941 678 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm29341-201ENSMUST00000190179 370 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm42454-201ENSMUST00000196805 1181 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm44274-201ENSMUST00000203417 256 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Olfr1439-ps1-201ENSMUST00000207089 824 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 AC158392.1-201ENSMUST00000223720 1069 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 AL590614.1-201ENSMUST00000226037 268 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm23846-201ENSMUST00000083835 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Olfr8-203ENSMUST00000214952 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r87-202ENSMUST00000211249 1835 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm23336-201ENSMUST00000117023 123 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm12697-201ENSMUST00000118008 667 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm11693-201ENSMUST00000119625 565 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm24592-201ENSMUST00000122505 106 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r18-201ENSMUST00000164732 1087 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Mir5099-201ENSMUST00000175257 74 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm24417-201ENSMUST00000178123 79 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm24653-201ENSMUST00000178541 79 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm25934-201ENSMUST00000178642 79 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm20915-201ENSMUST00000191575 663 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm30275-202ENSMUST00000198124 416 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm44656-201ENSMUST00000208428 490 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm18645-202ENSMUST00000212222 760 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 CT010498.1-201ENSMUST00000225382 546 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm10780-201ENSMUST00000099459 285 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm3867-202ENSMUST00000181639 2007 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Ighv1-4-201ENSMUST00000103493 351 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm24630-201ENSMUST00000122768 106 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm15274-201ENSMUST00000131442 291 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm21979-201ENSMUST00000139887 291 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm15259-201ENSMUST00000151262 291 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm26181-201ENSMUST00000157687 106 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm25185-201ENSMUST00000157754 96 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm25971-201ENSMUST00000158953 286 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm21809-201ENSMUST00000178495 468 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm6113-201ENSMUST00000180319 639 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 1700101O22Rik-201ENSMUST00000187396 339 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Sprr2g-202ENSMUST00000189634 651 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 B230110G15Rik-201ENSMUST00000190868 772 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm37778-201ENSMUST00000191732 190 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm38141-201ENSMUST00000192540 317 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm44332-201ENSMUST00000203712 433 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 Gm45490-201ENSMUST00000210084 742 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 CAAA01090811.1-201ENSMUST00000216828 277 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
Col5a3Q9JLI2 AC167202.1-201ENSMUST00000219027 331 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
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