Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Mir21a-201ENSMUST00000083521 92 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Smg9Q9DB90 March1-202ENSMUST00000072482 3953 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Smg9Q9DB90 Olfr213-202ENSMUST00000220008 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Smg9Q9DB90 Gm26869-201ENSMUST00000181241 3523 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Smg9Q9DB90 Elavl4-205ENSMUST00000106600 3799 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Smg9Q9DB90 Macc1-201ENSMUST00000048880 3818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Smg9Q9DB90 Matr3-201ENSMUST00000166793 6262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Smg9Q9DB90 Gm38010-201ENSMUST00000192592 2784 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Smg9Q9DB90 Olfr920-201ENSMUST00000074740 5711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Smg9Q9DB90 Usf3-204ENSMUST00000169582 12604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Smg9Q9DB90 AC165106.3-201ENSMUST00000228191 3843 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Smg9Q9DB90 Cfap97-206ENSMUST00000164504 4521 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Smg9Q9DB90 Mir551b-201ENSMUST00000102165 98 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Smg9Q9DB90 Elavl2-208ENSMUST00000107120 4191 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Smg9Q9DB90 Gm13504-201ENSMUST00000117490 316 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Smg9Q9DB90 Gm24905-201ENSMUST00000158129 104 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Smg9Q9DB90 4930473D10Rik-201ENSMUST00000161975 487 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Smg9Q9DB90 Trim30b-205ENSMUST00000171830 2771 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Smg9Q9DB90 Gm26219-201ENSMUST00000175216 71 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Smg9Q9DB90 1700010I02Rik-202ENSMUST00000188525 430 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Smg9Q9DB90 Gm28612-201ENSMUST00000189214 416 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Smg9Q9DB90 Gm38259-201ENSMUST00000194602 3534 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Smg9Q9DB90 Trav7-5-201ENSMUST00000200609 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Smg9Q9DB90 Gm43978-201ENSMUST00000203491 451 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Smg9Q9DB90 Olfr1012-203ENSMUST00000214958 3076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Smg9Q9DB90 AC121942.2-201ENSMUST00000223824 600 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Smg9Q9DB90 AC123533.1-201ENSMUST00000227782 446 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Smg9Q9DB90 Nlrp4b-201ENSMUST00000047809 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Smg9Q9DB90 Gpr141-201ENSMUST00000065335 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Smg9Q9DB90 Gm7381-201ENSMUST00000098958 300 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Smg9Q9DB90 AY512915-203ENSMUST00000159937 3650 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 Ccser2-201ENSMUST00000067700 7334 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 Ulbp1-203ENSMUST00000218087 5959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 Sbno1-201ENSMUST00000065263 10071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 Chl1-203ENSMUST00000203830 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 Oog1-201ENSMUST00000095509 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 1700008H02Rik-201ENSMUST00000201220 1684 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 Vmn1r34-205ENSMUST00000227332 3075 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 Igkv14-100-201ENSMUST00000103325 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 Gm22269-201ENSMUST00000104002 130 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 Gm25967-201ENSMUST00000157168 147 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 Gm26347-201ENSMUST00000157526 131 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 Gm25220-201ENSMUST00000157546 95 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 Gm38064-201ENSMUST00000194032 444 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 Gm37617-201ENSMUST00000194309 159 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 Gm37417-201ENSMUST00000195257 454 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 Gm43001-202ENSMUST00000199076 192 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 CT010449.1-201ENSMUST00000220624 153 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 Sprr2e-201ENSMUST00000068399 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 Slco1b2-201ENSMUST00000042812 3307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 Prrc2c-210ENSMUST00000182660 11502 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 Ak9-201ENSMUST00000173494 6968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 Gm38260-201ENSMUST00000193573 3995 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 Olfr1535-202ENSMUST00000217519 3959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 Vmn1r217-202ENSMUST00000227110 9888 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 Gria2-201ENSMUST00000075316 10371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 Abcg3-202ENSMUST00000130644 2668 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 Gm42659-201ENSMUST00000196955 1754 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 Gm38106-201ENSMUST00000194107 2534 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 Adgrv1-201ENSMUST00000095585 19338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 Olfr1109-203ENSMUST00000217066 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 Olfr32-204ENSMUST00000215153 3117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 Olfr1223-201ENSMUST00000217342 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 Olfr459-203ENSMUST00000214976 3770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 Fam122b-202ENSMUST00000114838 3536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 Gm23472-201ENSMUST00000101806 191 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 Trbj1-4-201ENSMUST00000103287 51 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 Ighv15-2-201ENSMUST00000103497 351 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 Gm13343-201ENSMUST00000116474 105 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 Gm13321-201ENSMUST00000117101 400 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 Gm11204-201ENSMUST00000122438 147 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 Gm15350-201ENSMUST00000135138 569 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 Gm12325-201ENSMUST00000135553 320 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 1700123O12Rik-203ENSMUST00000145856 425 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 Gm25386-201ENSMUST00000157814 288 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 Nron-204ENSMUST00000158971 370 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 Mir669k-201ENSMUST00000177742 127 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 Gm24497-201ENSMUST00000177868 191 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 Mir466b-1-201ENSMUST00000177988 82 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 Gm25673-201ENSMUST00000179957 127 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 Gm27477-201ENSMUST00000184649 143 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 Gm27760-201ENSMUST00000185048 114 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 Gm43193-201ENSMUST00000197732 441 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 AC165293.1-201ENSMUST00000219669 329 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 AC160756.1-201ENSMUST00000227266 235 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 Defb50-201ENSMUST00000078879 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 Gm23444-201ENSMUST00000082922 191 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 n-R5s167-201ENSMUST00000083227 121 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 Gm23454-201ENSMUST00000083332 133 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 Gm23042-201ENSMUST00000083866 101 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 Gm26314-201ENSMUST00000083891 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 Steap2-209ENSMUST00000164219 10089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 Ndst4-205ENSMUST00000174648 4996 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 Cast-208ENSMUST00000223033 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 Zfhx4-205ENSMUST00000176383 13500 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 Gm43185-201ENSMUST00000197507 2775 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 Elavl4-206ENSMUST00000106601 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 6720464F23Rik-201ENSMUST00000193946 3496 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 Gm44109-201ENSMUST00000204514 1954 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
Smg9Q9DB90 Synpr-207ENSMUST00000223583 3362 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.7 ms