Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Gm24769-201ENSMUST00000158506 129 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Gm23005-201ENSMUST00000158950 136 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Gm8580-201ENSMUST00000160295 464 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Gm4468-201ENSMUST00000170206 294 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Gm25194-201ENSMUST00000177987 79 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Gm24925-201ENSMUST00000178157 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Gm27869-201ENSMUST00000184327 122 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Gm44476-201ENSMUST00000196225 91 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Gm43109-201ENSMUST00000198269 753 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Igkv11-114-201ENSMUST00000200013 346 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Gm43026-201ENSMUST00000202972 325 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Olfr989-ps1-201ENSMUST00000214405 912 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 AC153968.2-201ENSMUST00000215579 1140 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 A430103D13Rik-201ENSMUST00000220077 857 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Gm5374-201ENSMUST00000222868 657 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 AC133076.1-201ENSMUST00000228074 484 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Gm23516-201ENSMUST00000093728 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Olfr801-203ENSMUST00000213294 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Gm650-201ENSMUST00000144428 1551 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Skint5-203ENSMUST00000170105 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Gm7173-205ENSMUST00000197180 9412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Gm14594-201ENSMUST00000118052 537 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Gm14590-201ENSMUST00000118934 537 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Sult2a-ps1-201ENSMUST00000120317 341 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Gm12238-201ENSMUST00000127764 124 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Gm16354-201ENSMUST00000155376 150 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Gm26099-201ENSMUST00000157248 109 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Gm22818-201ENSMUST00000157446 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Gm22817-201ENSMUST00000157448 356 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Gm22390-201ENSMUST00000157588 325 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Gm24198-201ENSMUST00000157812 108 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Gm24768-201ENSMUST00000158512 94 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Gm14596-201ENSMUST00000180268 537 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Gm14595-201ENSMUST00000180335 537 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Gm28666-201ENSMUST00000186649 274 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Gm29641-201ENSMUST00000188955 259 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Gm20915-201ENSMUST00000191575 663 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 2810432F15Rik-201ENSMUST00000198632 657 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Gm45368-201ENSMUST00000209323 703 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Cwc15-202ENSMUST00000213913 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 AC153646.1-201ENSMUST00000223229 1279 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 AC117202.3-201ENSMUST00000228532 310 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Olfr769-201ENSMUST00000050915 1084 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Gm24707-201ENSMUST00000082812 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Gm23096-201ENSMUST00000083447 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Mir16-2-201ENSMUST00000083672 95 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Gm24698-201ENSMUST00000083883 130 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Vmn1r87-201ENSMUST00000094827 888 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Olfr561-202ENSMUST00000213432 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 1700006A11Rik-201ENSMUST00000029598 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Olfr681-203ENSMUST00000215517 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Zfp936-201ENSMUST00000072829 1368 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 A930027P06Rik-201ENSMUST00000221298 2975 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Gm3081-201ENSMUST00000193413 3025 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Gm11813-201ENSMUST00000118586 291 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Gm9225-201ENSMUST00000121921 836 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Gm12730-201ENSMUST00000125277 291 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Ppp1r2-ps7-201ENSMUST00000140102 609 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Zfp965-204ENSMUST00000143490 297 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Gm2020-201ENSMUST00000145242 579 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Gm25637-201ENSMUST00000157529 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Gm23538-201ENSMUST00000157535 101 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Gm24959-201ENSMUST00000157924 146 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Gm22666-201ENSMUST00000158717 164 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Gm22664-201ENSMUST00000158719 105 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Gm22011-201ENSMUST00000158790 123 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Gm17162-201ENSMUST00000168538 473 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Gm17054-201ENSMUST00000169811 259 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Gm26195-201ENSMUST00000175035 101 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Mir5118-201ENSMUST00000175551 67 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Gm20698-201ENSMUST00000175657 233 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Zfp950-206ENSMUST00000178819 171 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Gm26189-201ENSMUST00000179879 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Gm37892-201ENSMUST00000192018 437 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Gm19066-201ENSMUST00000193232 1078 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Gm18414-201ENSMUST00000210858 694 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 AL669916.3-201ENSMUST00000213855 94 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Olfr953-ps1-201ENSMUST00000214463 892 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 AL669916.6-201ENSMUST00000214610 94 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 AL669916.4-201ENSMUST00000215976 94 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Gm9068-201ENSMUST00000217393 455 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 AL669916.1-201ENSMUST00000217640 94 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 CR974485.1-201ENSMUST00000222408 402 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 AC154603.1-201ENSMUST00000224355 313 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 AC154506.1-201ENSMUST00000225178 621 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 AC165284.1-201ENSMUST00000228614 458 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Gm10203-201ENSMUST00000087348 198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Gm26342-201ENSMUST00000104557 129 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Gm14020-201ENSMUST00000118165 662 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Gm13482-201ENSMUST00000119842 254 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Gm15112-201ENSMUST00000120152 860 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Gm14694-201ENSMUST00000121856 282 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Gm23111-201ENSMUST00000122652 105 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Gm13200-201ENSMUST00000138802 258 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Gm16510-201ENSMUST00000153501 249 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Gm22560-201ENSMUST00000157332 120 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Gm22563-201ENSMUST00000157333 269 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Gm25863-201ENSMUST00000158249 329 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Gm16584-201ENSMUST00000159267 189 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Usp27Q8CEG8 Gm24757-201ENSMUST00000176987 371 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.4 ms