Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Gm44990-201ENSMUST00000203922 217 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm33501-202ENSMUST00000209983 706 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm17850-201ENSMUST00000210023 1154 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm46124-201ENSMUST00000215223 808 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Olfr1139-ps1-201ENSMUST00000217634 168 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 AC140785.1-201ENSMUST00000217782 383 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 AC138027.1-201ENSMUST00000218324 472 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 AC091764.3-201ENSMUST00000219646 300 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm4921-201ENSMUST00000219804 992 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 1700030L22Rik-202ENSMUST00000222223 704 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 AC147633.1-201ENSMUST00000225134 259 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 AC160930.1-201ENSMUST00000227194 337 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm24490-201ENSMUST00000083803 98 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 D730048I06Rik-201ENSMUST00000034619 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Mir1195-201ENSMUST00000116818 98 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm12640-201ENSMUST00000120097 310 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm25107-201ENSMUST00000122472 129 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm24910-201ENSMUST00000157289 272 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm24922-201ENSMUST00000158511 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm3104-201ENSMUST00000171004 473 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm9944-201ENSMUST00000177649 309 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm28648-201ENSMUST00000190092 343 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm19193-201ENSMUST00000190263 590 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm37062-201ENSMUST00000195028 701 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm43114-201ENSMUST00000198298 343 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 AC124542.1-201ENSMUST00000205588 908 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 AC101677.1-201ENSMUST00000218590 158 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm34276-201ENSMUST00000222558 439 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Olfr769-201ENSMUST00000050915 1084 ntAPPRIS P1 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Efcab9-201ENSMUST00000054327 754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm25856-201ENSMUST00000082786 75 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm24661-201ENSMUST00000083205 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm10203-201ENSMUST00000087348 198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Skint5-203ENSMUST00000170105 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Olfr196-202ENSMUST00000205471 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm22782-201ENSMUST00000104082 132 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Zfp967-201ENSMUST00000108997 417 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Zfp969-201ENSMUST00000109027 417 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Zfp965-203ENSMUST00000109043 417 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm11991-201ENSMUST00000119652 1074 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm11357-201ENSMUST00000119758 954 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm13751-201ENSMUST00000120280 752 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm22957-201ENSMUST00000122511 123 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm23118-201ENSMUST00000122657 187 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 1700036O09Rik-201ENSMUST00000136834 349 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm16510-201ENSMUST00000153501 249 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm26099-201ENSMUST00000157248 109 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm23538-201ENSMUST00000157535 101 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Ccdc152-201ENSMUST00000165386 798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm3111-201ENSMUST00000167426 490 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Fam184a-206ENSMUST00000169866 501 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm24816-201ENSMUST00000175311 151 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Mir3076-201ENSMUST00000175415 60 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Vmn1r-ps142-201ENSMUST00000175707 852 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm25451-201ENSMUST00000177832 121 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm25194-201ENSMUST00000177987 79 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm28347-201ENSMUST00000185380 382 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm29550-201ENSMUST00000185543 285 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm29263-201ENSMUST00000188718 463 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm37892-201ENSMUST00000192018 437 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm19066-201ENSMUST00000193232 1078 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm38316-201ENSMUST00000194838 469 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm19457-201ENSMUST00000200995 448 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm45048-201ENSMUST00000207058 429 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 AC073947.3-201ENSMUST00000215576 766 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm23932-201ENSMUST00000082914 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm10234-201ENSMUST00000089304 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm38071-201ENSMUST00000195792 3378 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Olfr1046-202ENSMUST00000213987 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Olfr855-202ENSMUST00000215587 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Cyp3a41b-201ENSMUST00000075837 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Zfp119a-201ENSMUST00000079642 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm14359-201ENSMUST00000118883 424 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm11358-201ENSMUST00000122310 373 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm23885-201ENSMUST00000122682 294 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm9498-201ENSMUST00000140849 291 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm22839-201ENSMUST00000158436 304 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm16561-201ENSMUST00000163001 192 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm20656-201ENSMUST00000176925 518 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm11168-201ENSMUST00000177722 684 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm11168-202ENSMUST00000178077 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Esp24-201ENSMUST00000180245 207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Rpl31-ps7-201ENSMUST00000180629 379 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Sly-201ENSMUST00000189109 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm43652-201ENSMUST00000196219 675 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Igkv2-105-201ENSMUST00000196931 377 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm43232-201ENSMUST00000201346 364 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm43026-201ENSMUST00000202972 325 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm39469-201ENSMUST00000214845 461 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm9068-201ENSMUST00000217393 455 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 AC134468.1-201ENSMUST00000220869 299 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 AC126673.2-201ENSMUST00000221052 686 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 AC158521.1-201ENSMUST00000225295 660 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 AC183092.2-201ENSMUST00000225542 1153 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 AC170810.3-201ENSMUST00000226177 374 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 AC166344.2-201ENSMUST00000226747 374 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 AC123860.1-201ENSMUST00000228033 481 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Vmn1r184-201ENSMUST00000057123 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm22740-201ENSMUST00000083439 109 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.4 ms