Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Gm25967-201ENSMUST00000157168 147 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm22561-201ENSMUST00000157331 84 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm23016-201ENSMUST00000158431 62 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm22532-201ENSMUST00000158822 140 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm21746-201ENSMUST00000177612 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm4479-201ENSMUST00000178807 171 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm21726-201ENSMUST00000179654 392 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm26866-201ENSMUST00000180414 802 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm29104-201ENSMUST00000186304 222 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm28299-201ENSMUST00000189908 339 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Traj57-202ENSMUST00000196977 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm43624-201ENSMUST00000197368 180 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Olfr439-ps1-201ENSMUST00000204679 307 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 AC104832.1-201ENSMUST00000222938 550 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Olfr497-201ENSMUST00000076406 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm26056-201ENSMUST00000083043 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm43715-201ENSMUST00000196307 2715 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Vmn2r37-201ENSMUST00000072787 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm45809-201ENSMUST00000211661 3894 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Nlrp9a-202ENSMUST00000108387 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1051-202ENSMUST00000216432 2807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1051-203ENSMUST00000217245 2821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1051-204ENSMUST00000217294 2840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Cbll1-201ENSMUST00000064240 3937 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Tlr7-203ENSMUST00000112164 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1404-202ENSMUST00000216556 3305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 D930036K23Rik-201ENSMUST00000191894 3964 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Igkv4-57-201ENSMUST00000103357 352 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Mir294-201ENSMUST00000104710 84 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm11221-201ENSMUST00000117230 597 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm12787-201ENSMUST00000119234 396 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm24730-201ENSMUST00000158228 117 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Vmn2r-ps55-201ENSMUST00000173834 240 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm20681-201ENSMUST00000176061 503 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm28740-201ENSMUST00000186142 215 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 C230029F24Rik-202ENSMUST00000188673 554 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 BE692007-203ENSMUST00000189306 362 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm29423-207ENSMUST00000189580 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm28506-201ENSMUST00000189937 150 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 6430573P05Rik-201ENSMUST00000192562 508 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Fabp9-203ENSMUST00000193487 486 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm43035-201ENSMUST00000197626 517 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm43083-201ENSMUST00000199594 476 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm42665-201ENSMUST00000202100 586 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm44274-201ENSMUST00000203417 256 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm43932-201ENSMUST00000204499 52 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 E330011O21Rik-203ENSMUST00000210555 455 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm36368-201ENSMUST00000212026 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 AL450317.1-201ENSMUST00000213941 291 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 AC102312.1-201ENSMUST00000217752 475 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 AC153361.2-201ENSMUST00000218188 481 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Lilr4b-211ENSMUST00000219661 1143 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 AC121966.1-201ENSMUST00000221458 282 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm23378-201ENSMUST00000082942 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm25755-201ENSMUST00000083396 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm5670-201ENSMUST00000093546 372 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm22365-201ENSMUST00000093750 117 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm3055-202ENSMUST00000218939 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Zfp781-202ENSMUST00000219144 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Fbxw21-201ENSMUST00000054925 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 4932412D23Rik-203ENSMUST00000142270 4105 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm6325-201ENSMUST00000122015 3114 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Olfr968-202ENSMUST00000216458 4630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Olfr299-202ENSMUST00000217253 4479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1471-204ENSMUST00000217249 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1313-203ENSMUST00000216071 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Lztfl1-201ENSMUST00000026274 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Trbv16-201ENSMUST00000103274 398 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm24889-201ENSMUST00000104388 132 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm11576-201ENSMUST00000117433 417 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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Ssbp4Q3U4B1 Gm15969-201ENSMUST00000151967 236 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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Ssbp4Q3U4B1 Gm17119-201ENSMUST00000163943 280 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm23860-201ENSMUST00000179446 132 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Rpl31-ps7-201ENSMUST00000180629 379 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm27385-201ENSMUST00000184747 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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Ssbp4Q3U4B1 Gm28623-201ENSMUST00000187219 192 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm21135-201ENSMUST00000189023 436 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm37568-201ENSMUST00000191755 364 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm37455-201ENSMUST00000191993 529 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 4930584F24Rik-203ENSMUST00000197091 954 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 4930511M18Rik-201ENSMUST00000197811 679 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm43994-201ENSMUST00000203809 227 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm34811-201ENSMUST00000206580 445 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Gm45600-201ENSMUST00000210828 234 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Nat1-202ENSMUST00000212171 1208 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 AC153564.2-201ENSMUST00000219464 273 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 AC147545.1-201ENSMUST00000227528 108 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 AC163646.2-201ENSMUST00000227962 141 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Olfr769-201ENSMUST00000050915 1084 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Ssbp4Q3U4B1 Defb14-201ENSMUST00000052601 204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
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