Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm26423-201ENSMUST00000104277 128 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm24889-201ENSMUST00000104388 132 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm15760-201ENSMUST00000119553 283 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm16021-201ENSMUST00000121176 219 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm16428-201ENSMUST00000121193 723 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm15167-201ENSMUST00000121997 187 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm13793-201ENSMUST00000124214 438 ntTSL 2 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm23068-201ENSMUST00000158239 293 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm16572-201ENSMUST00000160258 279 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm20542-201ENSMUST00000174582 372 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Clec5a-204ENSMUST00000177178 665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm25198-201ENSMUST00000178574 110 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm29183-201ENSMUST00000188600 790 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 BE692007-203ENSMUST00000189306 362 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm7858-201ENSMUST00000190177 622 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Olfr1482-ps1-201ENSMUST00000207181 178 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm34838-201ENSMUST00000209231 958 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Olfr848-ps1-201ENSMUST00000212241 930 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm45772-201ENSMUST00000212961 240 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm30674-201ENSMUST00000214523 392 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Prl2c5-201ENSMUST00000021778 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 AC149586.1-201ENSMUST00000222647 645 ntTSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 AC133498.1-206ENSMUST00000223254 385 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 AC115289.1-201ENSMUST00000224915 522 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm23136-201ENSMUST00000083425 99 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 AC158979.1-201ENSMUST00000223594 2252 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm43404-201ENSMUST00000200424 2534 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Olfr389-202ENSMUST00000124927 2781 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Olfr617-202ENSMUST00000215755 3000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Ifi213-202ENSMUST00000150649 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm37848-201ENSMUST00000195288 3103 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Olfr849-202ENSMUST00000217273 6140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 AC121598.3-201ENSMUST00000227179 1643 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Chst9-201ENSMUST00000053017 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm23256-201ENSMUST00000102235 110 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm26140-201ENSMUST00000103807 110 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm14558-201ENSMUST00000117458 381 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm15175-201ENSMUST00000117629 132 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm7071-201ENSMUST00000120458 462 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm3669-202ENSMUST00000127852 397 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm2101-201ENSMUST00000128191 397 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm2165-205ENSMUST00000155337 397 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm16569-201ENSMUST00000160526 314 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Ccdc152-201ENSMUST00000165386 798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Mir3470b-201ENSMUST00000175563 126 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm22908-201ENSMUST00000177620 110 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Trav7d-3-201ENSMUST00000179789 402 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm44465-201ENSMUST00000199536 114 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm44941-201ENSMUST00000204216 627 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm44472-201ENSMUST00000204922 943 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm32531-201ENSMUST00000209324 373 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm45273-201ENSMUST00000211559 281 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Olfr1091-ps1-201ENSMUST00000216676 595 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 AC153141.1-201ENSMUST00000218636 501 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 AC115750.1-201ENSMUST00000220441 567 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 AC158395.1-201ENSMUST00000227206 452 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Olfr1095-201ENSMUST00000099874 927 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm14442-201ENSMUST00000119690 1736 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Wnk3-201ENSMUST00000096285 8551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Olfr597-202ENSMUST00000216456 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm18337-201ENSMUST00000219023 5762 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm4224-201ENSMUST00000211557 1594 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Olfr1216-203ENSMUST00000217000 3667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm20557-201ENSMUST00000192871 2794 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 AC154386.1-201ENSMUST00000222753 2871 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Olfr1058-201ENSMUST00000102631 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Ighv15-2-201ENSMUST00000103497 351 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm13504-201ENSMUST00000117490 316 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm15986-201ENSMUST00000122153 400 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 n-R5s80-201ENSMUST00000122596 111 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm23583-201ENSMUST00000158533 289 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Mir6916-201ENSMUST00000184514 63 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Sumo1-203ENSMUST00000185265 532 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Hmgb1-rs16-201ENSMUST00000185927 613 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Snhg14-208ENSMUST00000188262 687 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm45459-201ENSMUST00000209882 442 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm45455-202ENSMUST00000211156 630 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 AC152414.2-201ENSMUST00000219620 537 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm18696-201ENSMUST00000220103 274 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 AC129541.1-201ENSMUST00000226940 523 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Olfr305-201ENSMUST00000069236 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Olfr235-201ENSMUST00000073507 1079 ntAPPRIS P1 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm23093-201ENSMUST00000083450 102 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm813-201ENSMUST00000099663 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm43032-201ENSMUST00000197967 3123 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Prl7d1-203ENSMUST00000224026 3657 ntAPPRIS P2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm15097-202ENSMUST00000112741 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 CT025577.1-201ENSMUST00000220862 2846 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm32693-201ENSMUST00000196538 2402 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Vmn2r75-201ENSMUST00000167830 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm22939-201ENSMUST00000103958 131 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm13625-201ENSMUST00000149283 480 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm24720-201ENSMUST00000157518 166 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm22187-201ENSMUST00000157819 129 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm22538-201ENSMUST00000158169 299 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm24546-201ENSMUST00000158652 102 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Tcrg-C3-201ENSMUST00000164407 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Mir5101-201ENSMUST00000175181 83 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Gm28282-201ENSMUST00000186072 186 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Trim71Q1PSW8 Scgb2b29-ps-201ENSMUST00000187539 331 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms