Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Mir6402-201ENSMUST00000183406 80 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Ms4a4a-201ENSMUST00000188995 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm6651-201ENSMUST00000189471 271 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm29423-207ENSMUST00000189580 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm8747-201ENSMUST00000195392 751 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm5034-201ENSMUST00000199115 634 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm15235-201ENSMUST00000200572 194 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm7624-201ENSMUST00000209702 435 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm45400-201ENSMUST00000211603 653 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Olfr175-ps1-202ENSMUST00000215069 1201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 AC166113.1-201ENSMUST00000225258 475 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 AC123656.2-201ENSMUST00000226726 227 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm9845-201ENSMUST00000056409 598 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Olfr779-201ENSMUST00000069063 390 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm23645-201ENSMUST00000083228 108 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm22739-201ENSMUST00000083437 160 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Prl2b1-201ENSMUST00000091678 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Olfr218-203ENSMUST00000216603 3623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Ogn-201ENSMUST00000021822 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Olfr1448-202ENSMUST00000213177 3979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm43896-201ENSMUST00000203440 2032 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Rictor-201ENSMUST00000061656 9312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Olfr629-202ENSMUST00000213906 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm14825-201ENSMUST00000113538 701 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm13339-201ENSMUST00000120651 510 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm12876-201ENSMUST00000120975 408 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm14765-201ENSMUST00000121954 326 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm15899-201ENSMUST00000128586 238 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm16354-201ENSMUST00000155376 150 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm23592-201ENSMUST00000157859 117 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm10719-203ENSMUST00000179272 675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm23190-201ENSMUST00000180307 64 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm28591-201ENSMUST00000185259 183 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm29452-201ENSMUST00000187996 313 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm28860-201ENSMUST00000188103 313 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm37353-201ENSMUST00000194497 313 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Ranbp2-ps11-201ENSMUST00000197185 387 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Mir3073b-201ENSMUST00000199383 60 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm44824-201ENSMUST00000207021 229 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm44657-201ENSMUST00000208568 450 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Nat1-202ENSMUST00000212171 1208 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 AC154506.1-201ENSMUST00000225178 621 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 AC122341.1-201ENSMUST00000227291 560 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Olfr364-ps1-203ENSMUST00000217298 2894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Olfr109-203ENSMUST00000214938 5550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm45159-201ENSMUST00000208630 25241 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Olfr218-202ENSMUST00000215844 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm43881-201ENSMUST00000203051 2530 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm22115-201ENSMUST00000103976 133 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm23923-201ENSMUST00000104108 133 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm23609-201ENSMUST00000104542 127 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm26473-201ENSMUST00000116763 127 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm14811-201ENSMUST00000117070 117 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm12053-201ENSMUST00000119022 252 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm12897-201ENSMUST00000120341 250 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm13775-201ENSMUST00000153865 751 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm23332-201ENSMUST00000157424 275 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm26406-201ENSMUST00000158503 124 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Pcgf1-204ENSMUST00000176089 492 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm26335-201ENSMUST00000178449 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm24464-201ENSMUST00000179697 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Mir6386-201ENSMUST00000183558 104 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm42924-201ENSMUST00000197261 185 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm29848-201ENSMUST00000203107 295 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm44208-201ENSMUST00000205199 421 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm44927-201ENSMUST00000207573 716 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 AC153141.1-201ENSMUST00000218636 501 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 AC120553.1-201ENSMUST00000227313 260 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 AC144628.2-201ENSMUST00000227374 352 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm24533-201ENSMUST00000083138 196 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Olfr298-202ENSMUST00000213223 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Mroh9-201ENSMUST00000096608 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Tfpi-203ENSMUST00000111711 3968 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 AC125223.3-201ENSMUST00000223588 2067 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Olfr913-201ENSMUST00000081095 2441 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 D030040B21Rik-201ENSMUST00000181371 2788 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Ifi203-202ENSMUST00000081216 3610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Vmn2r75-201ENSMUST00000167830 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Evi2b-201ENSMUST00000179322 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Vmn1r121-201ENSMUST00000105197 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Vmn1r77-201ENSMUST00000164446 921 ntAPPRIS P2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Sumo1-203ENSMUST00000185265 532 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm20832-201ENSMUST00000189076 665 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm30638-201ENSMUST00000195570 656 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm18433-202ENSMUST00000195682 196 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm36728-201ENSMUST00000195782 665 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm43475-201ENSMUST00000196673 400 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm19089-201ENSMUST00000197207 613 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Mirlet7f-1-201ENSMUST00000198652 89 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Olfr1401-ps1-201ENSMUST00000202296 211 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Olfr908-201ENSMUST00000215139 932 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 AC116589.7-201ENSMUST00000221061 239 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 AC164117.1-201ENSMUST00000221726 239 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 AC116589.3-202ENSMUST00000221770 649 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 AC116589.6-201ENSMUST00000222252 649 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm16368-201ENSMUST00000222340 435 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 AC122393.1-201ENSMUST00000226570 319 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 AC157572.3-201ENSMUST00000227288 303 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Olfr166-203ENSMUST00000216465 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Thoc1-201ENSMUST00000025137 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
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