Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm23137-201ENSMUST00000157559 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ggta1P23336 Klrc1-204ENSMUST00000169545 676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
Ggta1P23336 Gm26622-201ENSMUST00000180520 298 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ggta1P23336 Mir7068-201ENSMUST00000183439 74 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ggta1P23336 Gm27342-201ENSMUST00000183530 109 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ggta1P23336 Gm28755-201ENSMUST00000185773 199 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ggta1P23336 Gm29604-201ENSMUST00000187176 163 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ggta1P23336 9830004L10Rik-202ENSMUST00000188074 687 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Ggta1P23336 Gm29288-201ENSMUST00000191582 901 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ggta1P23336 Ranbp2-ps12-201ENSMUST00000197110 386 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ggta1P23336 Gm4224-201ENSMUST00000211557 1594 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
Ggta1P23336 Gm46389-201ENSMUST00000223199 392 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ggta1P23336 AC109172.1-201ENSMUST00000227503 187 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ggta1P23336 Olfr921-201ENSMUST00000071681 1181 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Ggta1P23336 Gm25796-201ENSMUST00000082645 163 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ggta1P23336 Gm23104-201ENSMUST00000083722 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ggta1P23336 Gm15536-201ENSMUST00000121411 114 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ggta1P23336 Gm15274-201ENSMUST00000131442 291 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ggta1P23336 Gm21979-201ENSMUST00000139887 291 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ggta1P23336 Gm12534-201ENSMUST00000147691 469 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Ggta1P23336 Gm15259-201ENSMUST00000151262 291 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ggta1P23336 Gm24911-201ENSMUST00000157292 136 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ggta1P23336 Gm26348-201ENSMUST00000157528 240 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ggta1P23336 Gm22159-201ENSMUST00000158412 130 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ggta1P23336 Gm4468-201ENSMUST00000170206 294 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ggta1P23336 Gm29460-201ENSMUST00000188607 714 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ggta1P23336 Gm37557-201ENSMUST00000191640 139 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ggta1P23336 Gm7871-201ENSMUST00000195346 618 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ggta1P23336 Gm6639-204ENSMUST00000199182 800 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Ggta1P23336 Mir7217-201ENSMUST00000200304 62 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ggta1P23336 Mir497-201ENSMUST00000200557 84 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ggta1P23336 4930595L18Rik-201ENSMUST00000204069 506 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
Ggta1P23336 CT572985.2-201ENSMUST00000220496 211 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ggta1P23336 Gm26206-201ENSMUST00000082908 110 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ggta1P23336 Gm25008-201ENSMUST00000083809 81 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ggta1P23336 Ifi203-205ENSMUST00000129829 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
Ggta1P23336 Hsf3-205ENSMUST00000179832 1972 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
Ggta1P23336 Olfr1208-203ENSMUST00000214297 2844 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.09
Ggta1P23336 Gm15846-201ENSMUST00000116022 320 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Ggta1P23336 Mir1192-201ENSMUST00000116976 121 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Ggta1P23336 Gm15159-201ENSMUST00000117062 764 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Ggta1P23336 Gm14867-201ENSMUST00000120156 866 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Ggta1P23336 Slc7a12-202ENSMUST00000120484 1010 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Ggta1P23336 Gm16510-201ENSMUST00000153501 249 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Ggta1P23336 Gm22483-201ENSMUST00000157986 274 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Ggta1P23336 Gm25707-201ENSMUST00000175120 96 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Ggta1P23336 Mir5118-201ENSMUST00000175551 67 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Ggta1P23336 Gm27861-201ENSMUST00000183920 214 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Ggta1P23336 1700063O14Rik-201ENSMUST00000187067 492 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
Ggta1P23336 4930449A18Rik-202ENSMUST00000192453 1200 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Ggta1P23336 Gm37062-201ENSMUST00000195028 701 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Ggta1P23336 Igkv2-93-1-201ENSMUST00000196774 272 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Ggta1P23336 Gm19089-201ENSMUST00000197207 613 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Ggta1P23336 Mir378a-201ENSMUST00000198300 66 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Ggta1P23336 Igkv1-108-201ENSMUST00000198926 298 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Ggta1P23336 Gm17893-201ENSMUST00000203017 770 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Ggta1P23336 Gm43979-201ENSMUST00000203179 475 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Ggta1P23336 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Ggta1P23336 Gm32531-201ENSMUST00000209324 373 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Ggta1P23336 Gm45791-201ENSMUST00000212908 352 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Ggta1P23336 Gm18729-201ENSMUST00000217230 621 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Ggta1P23336 Gm25130-201ENSMUST00000082650 156 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Ggta1P23336 Olfr1101-201ENSMUST00000099870 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Ggta1P23336 Olfr1437-202ENSMUST00000207241 3751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Ggta1P23336 Gm5596-201ENSMUST00000207988 2421 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Ggta1P23336 Ifi214-203ENSMUST00000139092 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
Ggta1P23336 Gm43896-201ENSMUST00000203440 2032 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Ggta1P23336 Ifi203-209ENSMUST00000156895 3605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
Ggta1P23336 Gm25094-201ENSMUST00000103992 131 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Ggta1P23336 Gm12871-201ENSMUST00000118758 438 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Ggta1P23336 Gm22083-201ENSMUST00000157586 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Ggta1P23336 Gm22093-201ENSMUST00000158980 111 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Ggta1P23336 Gm20415-201ENSMUST00000172877 423 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Ggta1P23336 Gm18397-201ENSMUST00000176704 587 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Ggta1P23336 Gm21900-201ENSMUST00000179612 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Ggta1P23336 Mir8106-201ENSMUST00000184520 139 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Ggta1P23336 Gm34701-202ENSMUST00000204685 360 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Ggta1P23336 Olfr1439-ps1-201ENSMUST00000207089 824 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Ggta1P23336 AC122924.2-201ENSMUST00000220799 298 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Ggta1P23336 AC157494.1-201ENSMUST00000221127 549 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Ggta1P23336 Sult2a6-201ENSMUST00000076576 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
Ggta1P23336 Olfr1459-201ENSMUST00000078299 1102 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Ggta1P23336 Olfr746-201ENSMUST00000080616 945 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Ggta1P23336 Gm5152-202ENSMUST00000088625 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Ggta1P23336 Olfr995-201ENSMUST00000099924 1113 ntAPPRIS P1 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Ggta1P23336 Gm7173-205ENSMUST00000197180 9412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Ggta1P23336 Snhg14-213ENSMUST00000190666 3708 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Ggta1P23336 Gm44562-201ENSMUST00000207194 1347 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Ggta1P23336 Trbv5-201ENSMUST00000103266 368 ntAPPRIS P1 BASIC2□□□□□ -2.09
Ggta1P23336 Mir344e-201ENSMUST00000104677 66 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Ggta1P23336 Gm22151-201ENSMUST00000116963 58 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Ggta1P23336 Gm12386-201ENSMUST00000117380 688 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Ggta1P23336 Gm14554-201ENSMUST00000119548 661 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Ggta1P23336 Gm14945-201ENSMUST00000119556 1118 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Ggta1P23336 Gm11357-201ENSMUST00000119758 954 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Ggta1P23336 Cyp4a29-ps1-201ENSMUST00000120882 171 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Ggta1P23336 Gm16411-201ENSMUST00000122164 1100 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Ggta1P23336 Gm22339-201ENSMUST00000157718 62 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Ggta1P23336 Gm24010-201ENSMUST00000157731 282 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Ggta1P23336 Vmn2r-ps79-201ENSMUST00000174256 377 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms