Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm22143-201ENSMUST00000157401 203 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
H2-Eb1P04230 Gm24210-201ENSMUST00000158263 133 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
H2-Eb1P04230 Gm24771-201ENSMUST00000158508 137 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
H2-Eb1P04230 Gm6788-201ENSMUST00000166459 270 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
H2-Eb1P04230 Vmn1r-ps27-201ENSMUST00000174619 985 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
H2-Eb1P04230 Gm27379-201ENSMUST00000183730 123 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
H2-Eb1P04230 Mir6382-201ENSMUST00000184055 110 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
H2-Eb1P04230 Gm37754-201ENSMUST00000194406 452 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
H2-Eb1P04230 Gm37743-201ENSMUST00000194645 376 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
H2-Eb1P04230 Gm43722-201ENSMUST00000196054 124 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
H2-Eb1P04230 Gm44393-201ENSMUST00000197418 138 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
H2-Eb1P04230 Gm42947-201ENSMUST00000198230 675 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
H2-Eb1P04230 Gm43600-201ENSMUST00000202134 223 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
H2-Eb1P04230 Gm44478-201ENSMUST00000204875 114 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
H2-Eb1P04230 Gm45387-201ENSMUST00000209792 632 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
H2-Eb1P04230 Gm45382-201ENSMUST00000210607 151 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
H2-Eb1P04230 AC117688.1-201ENSMUST00000213142 832 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
H2-Eb1P04230 AC091260.1-201ENSMUST00000216112 229 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
H2-Eb1P04230 Gm19326-201ENSMUST00000219818 326 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
H2-Eb1P04230 Zfp706-205ENSMUST00000228275 481 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
H2-Eb1P04230 1700010L04Rik-201ENSMUST00000032872 330 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
H2-Eb1P04230 Olfr951-201ENSMUST00000078531 945 ntAPPRIS P2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
H2-Eb1P04230 Gm9972-201ENSMUST00000069051 1533 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
H2-Eb1P04230 Olfr937-202ENSMUST00000215049 2259 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.02
H2-Eb1P04230 Gm13212-202ENSMUST00000105739 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
H2-Eb1P04230 Vmn1r78-202ENSMUST00000228244 7931 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.02
H2-Eb1P04230 Olfr1463-202ENSMUST00000207246 2315 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
H2-Eb1P04230 Mir682-201ENSMUST00000102281 96 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 Igkv2-109-201ENSMUST00000103322 374 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 Gm24670-201ENSMUST00000104154 132 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 Gm12636-201ENSMUST00000117395 624 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 Gm13510-201ENSMUST00000118659 429 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 Gm11943-201ENSMUST00000119473 327 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 Gm16021-201ENSMUST00000121176 219 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 Gm15466-201ENSMUST00000122299 333 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 Serf1-202ENSMUST00000129014 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 Gm22563-201ENSMUST00000157333 269 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 Gm24475-201ENSMUST00000157435 143 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 Gm23137-201ENSMUST00000157559 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 Gm24958-201ENSMUST00000158009 97 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 Vmn1r-ps85-201ENSMUST00000173029 890 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 Mir6386-201ENSMUST00000183558 104 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 Gm28282-201ENSMUST00000186072 186 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 Gm29184-201ENSMUST00000190038 334 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 Gm28466-201ENSMUST00000190678 659 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 Gm18692-201ENSMUST00000193047 511 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 Gm37479-201ENSMUST00000194169 3841 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 Gm42425-201ENSMUST00000197756 565 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 Gm44324-201ENSMUST00000198517 135 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 Gm43955-201ENSMUST00000204332 142 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 Olfr861-ps1-201ENSMUST00000212783 928 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 AC132384.11-201ENSMUST00000219676 178 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 AC134468.1-201ENSMUST00000220869 299 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 AC192334.2-201ENSMUST00000223087 1091 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 AC117202.3-201ENSMUST00000228532 310 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 Tas2r131-201ENSMUST00000082085 1036 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 n-R5s176-201ENSMUST00000082683 109 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 Gm25582-201ENSMUST00000083412 110 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 Mir19a-201ENSMUST00000083482 82 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 Gm22578-201ENSMUST00000083730 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 Rpl31-ps1-201ENSMUST00000085128 378 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 Vdac3-ps1-201ENSMUST00000099736 853 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 Olfr847-202ENSMUST00000216839 2385 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 Olfr811-204ENSMUST00000217571 2399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 Olfr1228-202ENSMUST00000215447 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 Olfr347-202ENSMUST00000216882 3385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 Tlr7-201ENSMUST00000060719 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 Gm42482-201ENSMUST00000198904 1947 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 Gm17146-201ENSMUST00000108464 372 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 Gm26473-201ENSMUST00000116763 127 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 Rpl23a-ps13-201ENSMUST00000120350 441 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 Gm5287-201ENSMUST00000120666 598 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 Gm22718-201ENSMUST00000122701 315 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 Gm15671-201ENSMUST00000124160 576 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 Gm26041-201ENSMUST00000158148 108 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 Gm22947-201ENSMUST00000158559 91 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 Gm25365-201ENSMUST00000158852 121 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 Gm21828-201ENSMUST00000178050 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 Gm21866-201ENSMUST00000178428 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 Gm21725-201ENSMUST00000178519 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 Gm21800-201ENSMUST00000178559 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 Gm21852-201ENSMUST00000179125 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 Gm21764-201ENSMUST00000179219 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 Gm21891-201ENSMUST00000179284 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 Gm21904-201ENSMUST00000179522 543 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 Mir7013-201ENSMUST00000183540 72 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 Gm29185-201ENSMUST00000190578 516 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 Gm37279-201ENSMUST00000194630 338 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 Gm42805-201ENSMUST00000196158 276 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 Gm43284-201ENSMUST00000200103 253 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 Igkv1-136-201ENSMUST00000200635 297 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 Gm44961-201ENSMUST00000207450 196 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 Gm45522-201ENSMUST00000210784 166 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 CT572985.2-201ENSMUST00000220496 211 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 AC161572.1-201ENSMUST00000227486 640 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 Olfr1454-201ENSMUST00000073732 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 Gm24707-201ENSMUST00000082812 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 Gm24948-201ENSMUST00000082866 207 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 Gm23645-201ENSMUST00000083228 108 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
H2-Eb1P04230 Olfr895-201ENSMUST00000093864 951 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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