Protein–RNA interactions for Protein: F7CXU4

H2-M1, Histocompatibility 2, M region locus 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M1F7CXU4 Gm44282-201ENSMUST00000203199 190 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
H2-M1F7CXU4 Gm44223-201ENSMUST00000204854 114 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
H2-M1F7CXU4 Gm45232-201ENSMUST00000207811 162 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
H2-M1F7CXU4 AC173482.2-201ENSMUST00000224044 750 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
H2-M1F7CXU4 CT030704.1-201ENSMUST00000227521 699 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
H2-M1F7CXU4 Zfp972-201ENSMUST00000081529 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
H2-M1F7CXU4 Gm23448-201ENSMUST00000083151 104 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
H2-M1F7CXU4 Mir137-201ENSMUST00000083635 73 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
H2-M1F7CXU4 Rpl31-ps1-201ENSMUST00000085128 378 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
H2-M1F7CXU4 Gm5670-201ENSMUST00000093546 372 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
H2-M1F7CXU4 Chst9-201ENSMUST00000053017 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
H2-M1F7CXU4 Gm5141-202ENSMUST00000201047 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
H2-M1F7CXU4 Ccdc18-201ENSMUST00000047677 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Pak3-203ENSMUST00000112864 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm8978-201ENSMUST00000124230 2224 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Olfr811-204ENSMUST00000217571 2399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm43780-201ENSMUST00000196510 3600 ntBASIC2.58□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 AC153526.2-201ENSMUST00000218206 2031 ntBASIC2.58□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Olfr65-203ENSMUST00000214300 2855 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Snord14c-201ENSMUST00000101927 86 ntBASIC2.58□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Traj44-201ENSMUST00000103698 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Olfr379-ps1-201ENSMUST00000117349 934 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm11845-201ENSMUST00000117886 327 ntBASIC2.58□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm14943-201ENSMUST00000118056 546 ntBASIC2.58□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm13510-201ENSMUST00000118659 429 ntBASIC2.58□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 AA413626-201ENSMUST00000121125 494 ntBASIC2.58□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm15986-201ENSMUST00000122153 400 ntBASIC2.58□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm23213-201ENSMUST00000122715 313 ntBASIC2.58□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm3111-201ENSMUST00000167426 490 ntBASIC2.58□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Mir3965-201ENSMUST00000175570 69 ntBASIC2.58□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm22290-201ENSMUST00000177655 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm22583-201ENSMUST00000178031 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm28448-201ENSMUST00000188547 428 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm17771-201ENSMUST00000194477 1147 ntBASIC2.58□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm37850-201ENSMUST00000194573 549 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm43393-201ENSMUST00000200147 194 ntBASIC2.58□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Igkv1-136-201ENSMUST00000200635 297 ntBASIC2.58□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Olfr1470-ps1-201ENSMUST00000208620 949 ntBASIC2.58□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm30534-201ENSMUST00000217928 207 ntBASIC2.58□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm20304-201ENSMUST00000218168 444 ntBASIC2.58□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm24474-201ENSMUST00000220504 469 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 AC130477.2-201ENSMUST00000228158 274 ntBASIC2.58□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Cox7b2-201ENSMUST00000050129 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm23503-201ENSMUST00000083903 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Hif1a-202ENSMUST00000110461 4385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm38706-201ENSMUST00000182397 2617 ntBASIC2.58□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Olfr835-202ENSMUST00000213018 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm42445-201ENSMUST00000196996 2893 ntBASIC2.58□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 AC154386.1-201ENSMUST00000222753 2871 ntBASIC2.58□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Olfr1457-204ENSMUST00000215229 2538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm43032-201ENSMUST00000197967 3123 ntBASIC2.57□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Olfr1225-202ENSMUST00000216961 3231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Olfr1369-ps1-205ENSMUST00000215941 3597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Mir878-201ENSMUST00000104680 78 ntBASIC2.57□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm14448-201ENSMUST00000116383 210 ntBASIC2.57□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Rpl30-ps10-201ENSMUST00000117119 347 ntBASIC2.57□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm12370-201ENSMUST00000117809 604 ntBASIC2.57□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Rpl30-ps3-201ENSMUST00000117928 348 ntBASIC2.57□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm12191-201ENSMUST00000118307 348 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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H2-M1F7CXU4 Gm14271-201ENSMUST00000137886 630 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm15485-201ENSMUST00000149095 258 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm26099-201ENSMUST00000157248 109 ntBASIC2.57□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm22098-201ENSMUST00000157930 85 ntBASIC2.57□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm26041-201ENSMUST00000158148 108 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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H2-M1F7CXU4 Gm22131-201ENSMUST00000178415 94 ntBASIC2.57□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm25670-201ENSMUST00000178423 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm26239-201ENSMUST00000178842 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm24267-201ENSMUST00000179841 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm28541-201ENSMUST00000185206 442 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Fam122c-203ENSMUST00000186314 898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm28811-201ENSMUST00000190650 442 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm37808-201ENSMUST00000192038 442 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Olfr289-ps1-201ENSMUST00000192834 369 ntBASIC2.57□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm38333-201ENSMUST00000193608 604 ntBASIC2.57□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm36551-201ENSMUST00000196787 300 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Igkv15-97-201ENSMUST00000197637 339 ntBASIC2.57□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Igkv1-115-201ENSMUST00000198714 302 ntBASIC2.57□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm43991-201ENSMUST00000203751 274 ntBASIC2.57□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm19252-201ENSMUST00000204705 305 ntBASIC2.57□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm45101-201ENSMUST00000208327 232 ntBASIC2.57□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm2628-201ENSMUST00000218019 426 ntBASIC2.57□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Vmn2r-ps99-201ENSMUST00000221276 1203 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 AC117202.3-201ENSMUST00000228532 310 ntBASIC2.57□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Rpl30-ps8-201ENSMUST00000076166 345 ntBASIC2.57□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm24948-201ENSMUST00000082866 207 ntBASIC2.57□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm24292-201ENSMUST00000082888 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm10343-201ENSMUST00000096279 348 ntBASIC2.57□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Olfr934-202ENSMUST00000214324 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Olfr844-202ENSMUST00000220268 1686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Cdk13-205ENSMUST00000222800 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
H2-M1F7CXU4 Gm12393-201ENSMUST00000117084 848 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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