Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Gm4076-201ENSMUST00000179230 965 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 Gm3543-202ENSMUST00000179947 231 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 Gm29516-201ENSMUST00000190402 468 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 Gtpbp4-ps7-201ENSMUST00000197059 297 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 Gm15235-201ENSMUST00000200572 194 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 Olfr929-ps1-201ENSMUST00000216338 585 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 AC101677.1-201ENSMUST00000218590 158 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 AC122341.1-201ENSMUST00000227291 560 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 Gm23615-201ENSMUST00000082602 65 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 Vmn1r76-202ENSMUST00000226300 8189 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 Olfr116-202ENSMUST00000216128 4477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 Gm3867-202ENSMUST00000181639 2007 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 Gm20172-201ENSMUST00000193138 1551 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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Cldn8Q9Z260 Vmn1r29-205ENSMUST00000228909 4658 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 Olfr1206-202ENSMUST00000216950 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 Gm25088-201ENSMUST00000101803 79 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 Gm22270-201ENSMUST00000104034 132 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 Gm24126-201ENSMUST00000104111 106 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 Gm23744-201ENSMUST00000104231 149 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 Rpl30-ps3-201ENSMUST00000117928 348 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 Gm14841-201ENSMUST00000121067 758 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 Gm16428-201ENSMUST00000121193 723 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 Gm13274-202ENSMUST00000137624 271 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 Gm15008-201ENSMUST00000147429 460 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 Gm13794-201ENSMUST00000148637 468 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 Gm23600-201ENSMUST00000157260 71 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 Gm23078-201ENSMUST00000157848 148 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 Gm22416-201ENSMUST00000158590 88 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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Cldn8Q9Z260 Gm29185-201ENSMUST00000190578 516 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 Igkv13-73-1-201ENSMUST00000196767 200 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 Gm32531-201ENSMUST00000209324 373 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 AC174457.1-201ENSMUST00000215932 226 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 Gm30534-201ENSMUST00000217928 207 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 Gm22061-201ENSMUST00000082557 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 Ifi203-202ENSMUST00000081216 3610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 Gpr174-201ENSMUST00000101294 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
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Cldn8Q9Z260 Gm22496-201ENSMUST00000104493 88 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 Hmgb3-ps-201ENSMUST00000162465 601 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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Cldn8Q9Z260 Gm25451-201ENSMUST00000177832 121 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 Gm23568-201ENSMUST00000177960 92 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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Cldn8Q9Z260 Gm24713-201ENSMUST00000178850 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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Cldn8Q9Z260 Mir6363-201ENSMUST00000184880 114 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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Cldn8Q9Z260 Gm28113-201ENSMUST00000188280 229 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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Cldn8Q9Z260 Gm18635-201ENSMUST00000199020 1060 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 AC162934.3-201ENSMUST00000223015 841 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 Gm29687-201ENSMUST00000223022 879 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
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Cldn8Q9Z260 Prl7a1-202ENSMUST00000095924 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 Vmn1r185-208ENSMUST00000228004 5682 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 Olfr1463-202ENSMUST00000207246 2315 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 Olfr420-202ENSMUST00000213748 3806 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 Gm9972-201ENSMUST00000069051 1533 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
Cldn8Q9Z260 Olfr1240-202ENSMUST00000216123 4603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.01
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Cldn8Q9Z260 AA413626-201ENSMUST00000121125 494 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Cldn8Q9Z260 Gm7209-201ENSMUST00000122339 333 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Cldn8Q9Z260 Serf1-202ENSMUST00000129014 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
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Cldn8Q9Z260 Gm22792-201ENSMUST00000157225 133 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Cldn8Q9Z260 Snrpe-203ENSMUST00000166291 360 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Cldn8Q9Z260 Gm6788-201ENSMUST00000166459 270 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Cldn8Q9Z260 BC028528-205ENSMUST00000171519 447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
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Cldn8Q9Z260 Gm37946-201ENSMUST00000192064 347 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Cldn8Q9Z260 Gm37850-201ENSMUST00000194573 549 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Cldn8Q9Z260 AC154296.1-201ENSMUST00000198150 67 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Cldn8Q9Z260 Gm34648-201ENSMUST00000202460 338 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Cldn8Q9Z260 Gm45101-201ENSMUST00000208327 232 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Cldn8Q9Z260 Gm45678-201ENSMUST00000210509 295 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Cldn8Q9Z260 AC115289.1-201ENSMUST00000224915 522 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Cldn8Q9Z260 AC125223.1-203ENSMUST00000225304 498 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Cldn8Q9Z260 Olfr1102-201ENSMUST00000055129 1063 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Cldn8Q9Z260 Gm24948-201ENSMUST00000082866 207 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
Cldn8Q9Z260 Olfr1454-202ENSMUST00000213806 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
Cldn8Q9Z260 Tlr7-201ENSMUST00000060719 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
Cldn8Q9Z260 Zfp988-201ENSMUST00000148762 2800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Cldn8Q9Z260 Olfr786-202ENSMUST00000204529 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Cldn8Q9Z260 Mir542-201ENSMUST00000102186 85 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Cldn8Q9Z260 Ighv3-3-201ENSMUST00000103476 296 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
Cldn8Q9Z260 Gm23128-201ENSMUST00000104257 132 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
Cldn8Q9Z260 Snora36b-201ENSMUST00000104383 132 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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