Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Cyp3a44-201ENSMUST00000067479 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm42862-201ENSMUST00000197494 2621 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm12934-201ENSMUST00000119221 343 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Slc7a12-203ENSMUST00000120801 1069 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm16373-201ENSMUST00000129517 303 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm15969-201ENSMUST00000151967 236 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm26000-201ENSMUST00000157991 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm25898-201ENSMUST00000158303 106 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps86-201ENSMUST00000174052 547 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps48-201ENSMUST00000176352 886 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm21954-201ENSMUST00000179544 51 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm21798-201ENSMUST00000180105 261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm27921-201ENSMUST00000183968 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm9541-201ENSMUST00000188409 502 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm19641-201ENSMUST00000188432 417 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm29433-201ENSMUST00000191241 253 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm38127-201ENSMUST00000191978 468 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 4921527H02Rik-202ENSMUST00000196005 947 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 AC139754.1-201ENSMUST00000219418 950 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 CT010456.2-201ENSMUST00000222665 1053 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm23096-201ENSMUST00000083447 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Olfr833-ps1-201ENSMUST00000086493 913 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm42664-201ENSMUST00000199417 3239 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Mir804-201ENSMUST00000103251 95 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm24984-201ENSMUST00000104454 133 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm13273-201ENSMUST00000119737 159 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm15508-201ENSMUST00000160330 325 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm20417-201ENSMUST00000174784 425 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm28383-201ENSMUST00000187563 139 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm29262-201ENSMUST00000190084 196 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm37228-201ENSMUST00000193574 331 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm17937-201ENSMUST00000197908 742 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm45034-201ENSMUST00000206831 482 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm45741-201ENSMUST00000212661 152 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 AC126673.2-201ENSMUST00000221052 686 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 AC174797.4-201ENSMUST00000225510 347 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm24917-201ENSMUST00000083935 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Igkv13-84-201ENSMUST00000103339 347 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm22019-201ENSMUST00000104359 96 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Igkv13-85-201ENSMUST00000114212 347 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps109-201ENSMUST00000119308 725 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm14588-201ENSMUST00000119895 172 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm23587-201ENSMUST00000157658 84 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Atp2b4-208ENSMUST00000167348 243 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Adgrg4-206ENSMUST00000168724 531 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps76-201ENSMUST00000173876 739 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm7135-201ENSMUST00000187538 675 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm43619-201ENSMUST00000197267 914 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm43193-201ENSMUST00000197732 441 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm31532-201ENSMUST00000203555 767 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 AC132104.1-201ENSMUST00000213615 260 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 AC160061.1-201ENSMUST00000217766 533 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm18039-201ENSMUST00000217816 728 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 AC117588.2-201ENSMUST00000228340 311 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Tas2r140-201ENSMUST00000095391 1000 ntAPPRIS P1 BASIC1.83□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 1700006A11Rik-201ENSMUST00000029598 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm6913-201ENSMUST00000100019 348 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm24951-201ENSMUST00000102182 109 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm25526-201ENSMUST00000104332 132 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm15087-201ENSMUST00000117465 1172 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm9440-201ENSMUST00000119667 539 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm15584-201ENSMUST00000123231 759 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm6788-201ENSMUST00000166459 270 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm24154-201ENSMUST00000175261 130 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm28011-201ENSMUST00000184097 175 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm28951-201ENSMUST00000190742 313 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 9430083B18Rik-201ENSMUST00000191908 863 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm32033-201ENSMUST00000193483 339 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm37102-201ENSMUST00000195740 1105 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm43345-201ENSMUST00000199484 269 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm40292-201ENSMUST00000202383 553 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 AC154264.1-201ENSMUST00000216064 386 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 AC122901.2-201ENSMUST00000216926 285 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 AC157017.1-201ENSMUST00000220148 364 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Olfr1141-201ENSMUST00000099846 936 ntAPPRIS P1 BASIC1.82□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm44240-201ENSMUST00000204015 2654 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 AC153966.1-201ENSMUST00000220106 3764 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm22658-201ENSMUST00000104196 155 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm15526-201ENSMUST00000112504 204 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Olfr595-ps1-201ENSMUST00000118180 954 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm12105-201ENSMUST00000120846 779 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm23167-201ENSMUST00000157155 103 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Mir1954-201ENSMUST00000175595 86 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm25598-201ENSMUST00000179031 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm7909-201ENSMUST00000182688 614 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm29277-201ENSMUST00000185226 602 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm29089-201ENSMUST00000186209 602 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm37193-201ENSMUST00000193087 513 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm43070-201ENSMUST00000196938 415 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 AC160970.1-201ENSMUST00000219311 475 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Olfr893-201ENSMUST00000093867 942 ntAPPRIS P2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm18751-201ENSMUST00000185777 2013 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm20756-201ENSMUST00000201080 1595 ntTSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm45518-201ENSMUST00000210776 2583 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Mir19b-1-201ENSMUST00000102301 87 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm26421-201ENSMUST00000104279 132 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm16359-201ENSMUST00000124511 289 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
Col5a3Q9JLI2 Gm15632-201ENSMUST00000135936 246 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
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