Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

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Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Gm25909-201ENSMUST00000157619 121 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm24853-201ENSMUST00000158026 121 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm17183-201ENSMUST00000171170 493 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Mir3965-201ENSMUST00000175570 69 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Vmn1r-ps15-201ENSMUST00000177365 910 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm22290-201ENSMUST00000177655 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm22583-201ENSMUST00000178031 107 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm29023-201ENSMUST00000190543 325 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 AC155839.1-201ENSMUST00000200105 147 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm44726-201ENSMUST00000203427 217 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm44941-201ENSMUST00000204216 627 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm45614-201ENSMUST00000209994 721 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Olfr542-ps1-201ENSMUST00000211706 831 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm39380-201ENSMUST00000214710 192 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm24623-201ENSMUST00000082616 194 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm28634-201ENSMUST00000191087 2613 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Vmn1r66-204ENSMUST00000228086 3013 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Stap1-206ENSMUST00000198435 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Olfr796-202ENSMUST00000214584 3554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Olfr681-204ENSMUST00000215564 4487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Vmn2r-ps46-201ENSMUST00000172969 2556 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Mir19b-1-201ENSMUST00000102301 87 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm24273-201ENSMUST00000102332 164 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm24119-201ENSMUST00000103979 246 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm15399-201ENSMUST00000118055 724 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Hmgb1-ps4-201ENSMUST00000118281 635 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm14049-201ENSMUST00000121009 636 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm11254-201ENSMUST00000122368 653 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 n-R5s32-201ENSMUST00000122495 103 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm11842-201ENSMUST00000130117 556 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm14271-201ENSMUST00000137886 630 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm24666-201ENSMUST00000158937 167 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 BC028528-205ENSMUST00000171519 447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm13698-201ENSMUST00000178325 732 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm13694-202ENSMUST00000178655 732 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm13696-201ENSMUST00000179311 732 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm20873-201ENSMUST00000179410 699 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm13693-202ENSMUST00000179448 732 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm13695-202ENSMUST00000179504 732 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm13697-202ENSMUST00000179552 732 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 RMST_1.1-201ENSMUST00000182623 407 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Npn2-202ENSMUST00000189275 235 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm29365-201ENSMUST00000189461 699 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm20172-201ENSMUST00000193138 1551 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm44349-201ENSMUST00000197048 123 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm42578-201ENSMUST00000199960 194 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm44142-201ENSMUST00000203358 311 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm43899-201ENSMUST00000203675 246 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm44720-201ENSMUST00000206076 260 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm44609-201ENSMUST00000207157 460 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Olfr1086-202ENSMUST00000213198 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Prl2c5-201ENSMUST00000021778 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Olfr1293-ps-203ENSMUST00000217845 3628 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 AC153141.1-201ENSMUST00000218636 501 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 AC158798.1-201ENSMUST00000219714 711 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 AC116589.7-201ENSMUST00000221061 239 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 AC164117.1-201ENSMUST00000221726 239 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 AC120553.1-201ENSMUST00000227313 260 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Zfp709-201ENSMUST00000034259 2181 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Slitrk6-201ENSMUST00000078386 4240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm25792-201ENSMUST00000083289 100 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Zfp711-201ENSMUST00000071814 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Prl7d1-203ENSMUST00000224026 3657 ntAPPRIS P2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 AC153365.1-201ENSMUST00000219016 2031 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm18337-201ENSMUST00000219023 5762 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Ccr3-201ENSMUST00000039171 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Omd-201ENSMUST00000065494 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Csn1s1-205ENSMUST00000197631 1359 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Defb43-201ENSMUST00000100491 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
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Usp38Q8BW70 Gm14364-201ENSMUST00000129209 267 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm11337-201ENSMUST00000144770 335 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm17117-201ENSMUST00000163665 299 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Klra5-204ENSMUST00000169901 792 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm24819-201ENSMUST00000175094 166 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm21874-201ENSMUST00000178374 699 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
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Usp38Q8BW70 Gm24474-201ENSMUST00000220504 469 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 AC155241.1-201ENSMUST00000222709 415 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 AC124400.1-201ENSMUST00000225779 193 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm23377-201ENSMUST00000082943 126 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm32693-201ENSMUST00000196538 2402 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Olfr397-204ENSMUST00000216291 4168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Cyp3a44-201ENSMUST00000067479 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Olfr855-202ENSMUST00000215587 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm14288-201ENSMUST00000109020 3438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Olfr146-203ENSMUST00000214410 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Olfr810-203ENSMUST00000214878 4709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm14518-201ENSMUST00000117351 542 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm15700-201ENSMUST00000139791 821 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm24439-201ENSMUST00000157894 117 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Tshb-202ENSMUST00000170856 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm20462-201ENSMUST00000172623 408 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 4930555M17Rik-201ENSMUST00000176666 402 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm26621-201ENSMUST00000180413 700 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm11395-201ENSMUST00000181011 499 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm26871-203ENSMUST00000181060 355 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Ighv1-40-201ENSMUST00000194231 345 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
Usp38Q8BW70 Gm24350-202ENSMUST00000198309 132 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
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