Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Gm6574-201ENSMUST00000120037 362 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm15177-201ENSMUST00000120491 577 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Spink2-203ENSMUST00000121825 643 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm26280-201ENSMUST00000157096 101 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm26348-201ENSMUST00000157528 240 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm22083-201ENSMUST00000157586 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm23025-201ENSMUST00000158769 111 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Rpl30-ps6-201ENSMUST00000163337 348 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm20450-201ENSMUST00000173652 147 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm27161-201ENSMUST00000183960 562 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm6651-201ENSMUST00000189471 271 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm43729-201ENSMUST00000196949 499 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm43264-201ENSMUST00000202284 325 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Olfr795-ps1-201ENSMUST00000205245 763 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 AC157017.2-201ENSMUST00000218354 777 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 AC165146.1-201ENSMUST00000223777 900 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Olfr914-201ENSMUST00000057755 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm25796-201ENSMUST00000082645 163 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm24610-201ENSMUST00000083270 109 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm16261-201ENSMUST00000096813 205 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 AC123052.1-201ENSMUST00000220604 4616 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Ppp1r42-201ENSMUST00000027049 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Mir669p-2-201ENSMUST00000103868 87 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Mir669p-1-201ENSMUST00000103884 87 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm24430-201ENSMUST00000104077 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm12598-201ENSMUST00000117333 830 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm15113-201ENSMUST00000119280 836 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Vmn1r-ps106-201ENSMUST00000120587 824 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm14736-201ENSMUST00000121470 336 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm23886-201ENSMUST00000122684 313 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm25808-201ENSMUST00000122784 284 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Rab7b-203ENSMUST00000129905 476 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm24534-201ENSMUST00000157949 291 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm24210-201ENSMUST00000158263 133 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm17183-201ENSMUST00000171170 493 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm23269-201ENSMUST00000178701 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm11168-204ENSMUST00000179881 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm3852-201ENSMUST00000182781 264 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm28666-201ENSMUST00000186649 274 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm29604-201ENSMUST00000187176 163 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm19641-201ENSMUST00000188432 417 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm37281-201ENSMUST00000192412 439 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm18956-201ENSMUST00000192857 480 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm37732-201ENSMUST00000194377 316 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm37353-201ENSMUST00000194497 313 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm37910-201ENSMUST00000194770 217 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm31230-201ENSMUST00000199725 785 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm7675-201ENSMUST00000208828 686 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Olfr837-201ENSMUST00000212482 1040 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm24313-201ENSMUST00000082561 133 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Olfr814-202ENSMUST00000213742 3798 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm44049-201ENSMUST00000204905 2984 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Vipas39Q8BGQ1 Gm9218-201ENSMUST00000121068 2694 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Mir466k-201ENSMUST00000116774 122 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm12891-201ENSMUST00000119358 240 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm11835-201ENSMUST00000120635 663 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm11819-201ENSMUST00000122192 372 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm11712-201ENSMUST00000129139 367 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm2020-201ENSMUST00000145242 579 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm22225-201ENSMUST00000157358 278 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm16311-201ENSMUST00000161939 702 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm5538-201ENSMUST00000168156 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm17542-201ENSMUST00000169859 99 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm20660-201ENSMUST00000177515 289 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm5709-201ENSMUST00000177879 1165 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm29330-201ENSMUST00000190032 699 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm28098-201ENSMUST00000191361 699 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm17771-201ENSMUST00000194477 1147 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm43230-201ENSMUST00000200980 2129 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm45023-201ENSMUST00000207951 379 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm6012-201ENSMUST00000210821 730 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm45879-201ENSMUST00000212521 392 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm18488-201ENSMUST00000215082 364 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 AC122465.2-201ENSMUST00000221774 354 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 AC144733.1-201ENSMUST00000222893 1289 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Pdcd10-201ENSMUST00000029424 907 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm4945-201ENSMUST00000075152 453 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm37296-201ENSMUST00000192728 2922 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Thoc2-201ENSMUST00000047037 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 AC162910.1-201ENSMUST00000221219 1723 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm22591-201ENSMUST00000104243 106 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm25728-201ENSMUST00000104525 159 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm12393-201ENSMUST00000117084 848 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm14945-201ENSMUST00000119556 1118 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm14301-201ENSMUST00000120181 324 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm14360-201ENSMUST00000120670 393 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm13581-201ENSMUST00000120675 278 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm12748-201ENSMUST00000120763 504 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm11438-201ENSMUST00000121582 189 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm14129-201ENSMUST00000122436 291 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Klra17-201ENSMUST00000014687 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm15564-202ENSMUST00000173605 402 ntTSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm18396-201ENSMUST00000177095 361 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm23568-201ENSMUST00000177960 92 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm24897-201ENSMUST00000179033 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm24829-201ENSMUST00000179245 92 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm27599-201ENSMUST00000183758 174 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 1700108N06Rik-201ENSMUST00000196572 681 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm42578-201ENSMUST00000199960 194 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
Vipas39Q8BGQ1 Gm15235-201ENSMUST00000200572 194 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
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