Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm6639-204ENSMUST00000199182 800 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 Gm42750-201ENSMUST00000199745 353 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 Gm45456-201ENSMUST00000210841 243 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 Sult3a1-202ENSMUST00000218204 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 Gm25409-201ENSMUST00000083764 131 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 Sult3a1-201ENSMUST00000092597 1047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 AC164297.6-201ENSMUST00000224643 1568 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 Gm14238-201ENSMUST00000120227 323 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 Gm14102-201ENSMUST00000147678 464 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 Gm22929-201ENSMUST00000175517 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 Gm6135-201ENSMUST00000198726 372 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 Gm40662-201ENSMUST00000222208 453 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 CT030254.3-201ENSMUST00000225959 1231 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 Vmn1r20-201ENSMUST00000226808 912 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 Gm44240-201ENSMUST00000204015 2654 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 Gm7171-201ENSMUST00000177413 1349 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 Gm14366-201ENSMUST00000121970 730 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 Gm22839-201ENSMUST00000158436 304 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 Gm22136-201ENSMUST00000158751 268 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 Gm25161-201ENSMUST00000158913 132 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 Gm23190-201ENSMUST00000180307 64 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 Mir6541-201ENSMUST00000183649 110 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 Gm28872-201ENSMUST00000191518 158 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 Gm37523-201ENSMUST00000194901 412 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 Olfr1086-202ENSMUST00000213198 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 Gm37941-201ENSMUST00000192170 2309 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 Gm22516-201ENSMUST00000158266 124 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 Gm9613-201ENSMUST00000171662 196 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 Gm8676-201ENSMUST00000184206 637 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 Olfr893-201ENSMUST00000093867 942 ntAPPRIS P2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 Olfr805-203ENSMUST00000216794 3199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 Olfr1253-204ENSMUST00000215988 6332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Ccdc18Q640L5 Gm12309-201ENSMUST00000119889 182 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Ccdc18Q640L5 Gm14709-201ENSMUST00000121225 304 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Ccdc18Q640L5 AI847159-201ENSMUST00000137728 305 ntTSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Ccdc18Q640L5 Ear10-202ENSMUST00000163652 471 ntAPPRIS P1 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Ccdc18Q640L5 Gm28951-201ENSMUST00000190742 313 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Ccdc18Q640L5 Gm32033-201ENSMUST00000193483 339 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Ccdc18Q640L5 Gm35558-202ENSMUST00000221819 499 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
Ccdc18Q640L5 AC133083.2-201ENSMUST00000222826 272 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Ccdc18Q640L5 Defb10-201ENSMUST00000054162 298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
Ccdc18Q640L5 Olfr138-202ENSMUST00000172843 1769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.02□□□□□ -2.09
Ccdc18Q640L5 Gm25321-201ENSMUST00000122558 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Ccdc18Q640L5 Gm27235-201ENSMUST00000184431 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
Ccdc18Q640L5 Gm23850-201ENSMUST00000083830 169 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Ccdc18Q640L5 Zc3h14-201ENSMUST00000021399 1430 ntTSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
Ccdc18Q640L5 Gm3867-202ENSMUST00000181639 2007 ntTSL 2 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Ccdc18Q640L5 Zfp735-201ENSMUST00000080407 3746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.01□□□□□ -2.09
Ccdc18Q640L5 Gm6429-201ENSMUST00000117144 475 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Ccdc18Q640L5 B230112I24Rik-201ENSMUST00000203953 1229 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Ccdc18Q640L5 AC140285.1-201ENSMUST00000220472 452 ntTSL 3 BASIC2.01□□□□□ -2.09
Ccdc18Q640L5 Gm7065-201ENSMUST00000222150 474 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
Ccdc18Q640L5 Vmn1r75-202ENSMUST00000226622 6638 ntAPPRIS P2 BASIC2□□□□□ -2.09
Ccdc18Q640L5 Gm25506-201ENSMUST00000104339 70 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Ccdc18Q640L5 Gm24895-201ENSMUST00000122742 74 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Ccdc18Q640L5 Gm12238-201ENSMUST00000127764 124 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Ccdc18Q640L5 Sult2a6-202ENSMUST00000184731 664 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Ccdc18Q640L5 Gm43765-201ENSMUST00000196303 893 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Ccdc18Q640L5 Gm43659-201ENSMUST00000200894 628 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Ccdc18Q640L5 Olfr848-ps1-201ENSMUST00000212241 930 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Ccdc18Q640L5 Gm25199-201ENSMUST00000083095 104 ntBASIC2□□□□□ -2.09
Ccdc18Q640L5 Gm21814-203ENSMUST00000203729 1352 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
Ccdc18Q640L5 Gm28647-201ENSMUST00000188416 197 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc18Q640L5 Gm28986-201ENSMUST00000189682 678 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc18Q640L5 Gm44666-201ENSMUST00000208544 391 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
Ccdc18Q640L5 Olfr1135-202ENSMUST00000213835 2648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
Ccdc18Q640L5 Gm44348-201ENSMUST00000200165 122 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Ccdc18Q640L5 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Ccdc18Q640L5 Gm25755-201ENSMUST00000083396 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
Ccdc18Q640L5 Gm22603-201ENSMUST00000157603 96 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Ccdc18Q640L5 Gm44962-201ENSMUST00000206460 279 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Ccdc18Q640L5 Esp3-201ENSMUST00000177574 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccdc18Q640L5 Arhgap5-202ENSMUST00000217820 2332 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccdc18Q640L5 Gm24677-201ENSMUST00000158755 150 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccdc18Q640L5 Gm26741-201ENSMUST00000180473 87 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccdc18Q640L5 Gm37801-201ENSMUST00000194754 274 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccdc18Q640L5 Gm3442-201ENSMUST00000216808 710 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
Ccdc18Q640L5 Gm13640-201ENSMUST00000118445 264 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc18Q640L5 Gm2830-201ENSMUST00000140330 385 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc18Q640L5 Vmn1r-ps14-201ENSMUST00000176859 913 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc18Q640L5 Gm29009-201ENSMUST00000186340 496 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc18Q640L5 Gm42891-201ENSMUST00000199340 281 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc18Q640L5 Olfr184-ps1-201ENSMUST00000205922 516 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc18Q640L5 CT030159.4-201ENSMUST00000221966 395 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc18Q640L5 Gm24445-201ENSMUST00000083981 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc18Q640L5 AC153964.2-201ENSMUST00000217704 2474 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
Ccdc18Q640L5 Gm22658-201ENSMUST00000104196 155 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc18Q640L5 Gm14444-202ENSMUST00000109070 1281 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc18Q640L5 Xlr4e-ps-201ENSMUST00000122102 648 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc18Q640L5 Gm24348-201ENSMUST00000158710 130 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc18Q640L5 Gm37817-201ENSMUST00000195276 434 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc18Q640L5 Gm17935-201ENSMUST00000196649 772 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc18Q640L5 Fcf1-201ENSMUST00000021669 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc18Q640L5 Gm24165-201ENSMUST00000082718 128 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc18Q640L5 4930430A15Rik-201ENSMUST00000028577 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc18Q640L5 Gm24632-201ENSMUST00000122770 323 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc18Q640L5 Gm23893-201ENSMUST00000158106 134 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc18Q640L5 Vmn1r-ps48-201ENSMUST00000176352 886 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Ccdc18Q640L5 AC121114.1-201ENSMUST00000228522 570 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.7 ms