Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Vmn1r80-205ENSMUST00000227755 10455 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Olfr836-202ENSMUST00000212730 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Omd-201ENSMUST00000065494 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Trav14d-2-201ENSMUST00000103597 276 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Trav8d-2-201ENSMUST00000103605 334 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Trav14n-2-201ENSMUST00000103623 276 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm26396-201ENSMUST00000104093 132 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm14518-201ENSMUST00000117351 542 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm14594-201ENSMUST00000118052 537 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm12803-201ENSMUST00000118907 821 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm14590-201ENSMUST00000118934 537 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Rps13-ps7-201ENSMUST00000122045 368 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm15671-201ENSMUST00000124160 576 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm3669-202ENSMUST00000127852 397 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm2101-201ENSMUST00000128191 397 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm12150-201ENSMUST00000130874 468 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm13794-201ENSMUST00000148637 468 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm2165-205ENSMUST00000155337 397 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm23671-201ENSMUST00000157472 103 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm24240-201ENSMUST00000157785 135 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm22521-201ENSMUST00000158272 134 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm22434-201ENSMUST00000158549 122 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm3470-201ENSMUST00000160819 420 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm15629-201ENSMUST00000161819 476 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm25361-201ENSMUST00000179358 76 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm14596-201ENSMUST00000180268 537 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm14595-201ENSMUST00000180335 537 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm26871-205ENSMUST00000181926 742 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm27905-201ENSMUST00000184005 207 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Trav14-2-202ENSMUST00000184874 276 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 1810022K09Rik-203ENSMUST00000185423 278 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm29185-201ENSMUST00000190578 516 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm9379-201ENSMUST00000196790 646 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm43217-201ENSMUST00000199513 367 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm43101-202ENSMUST00000201733 488 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm44016-201ENSMUST00000203463 164 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm45438-201ENSMUST00000210242 564 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm45273-201ENSMUST00000211559 281 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 AC161054.1-201ENSMUST00000214319 184 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 AC154296.2-201ENSMUST00000214696 545 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 AC171203.1-201ENSMUST00000215363 456 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 AC116460.1-201ENSMUST00000219040 313 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Cycs-ps3-201ENSMUST00000223240 321 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 AC154603.1-201ENSMUST00000224355 313 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 AC098719.1-201ENSMUST00000228920 371 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Lelp1-201ENSMUST00000029535 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Vmn1r230-201ENSMUST00000053974 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm5362-201ENSMUST00000211968 3085 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Vmn1r206-202ENSMUST00000227244 3970 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Vmn1r89-208ENSMUST00000228587 2061 ntAPPRIS P2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Fam111a-203ENSMUST00000144662 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm37788-201ENSMUST00000193958 2705 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Olfr105-ps-202ENSMUST00000215518 3778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm3095-201ENSMUST00000164696 1568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Olfr862-202ENSMUST00000079660 2604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm3259-201ENSMUST00000101015 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm14440-202ENSMUST00000109051 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Zc3h14-201ENSMUST00000021399 1430 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm23175-201ENSMUST00000104371 132 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm14973-201ENSMUST00000117248 255 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm14987-201ENSMUST00000117820 676 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm13692-201ENSMUST00000120774 371 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm15142-201ENSMUST00000121013 856 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm14765-201ENSMUST00000121954 326 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm15733-201ENSMUST00000132957 242 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm24419-201ENSMUST00000157875 332 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm24464-201ENSMUST00000179697 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm22633-201ENSMUST00000179834 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm26189-201ENSMUST00000179879 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm37085-201ENSMUST00000193780 196 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm6510-201ENSMUST00000195916 574 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Tprkb-214ENSMUST00000202803 716 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Crs-ps-201ENSMUST00000203723 760 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm7948-201ENSMUST00000212607 844 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 CT025606.1-201ENSMUST00000218273 324 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Olfr638-202ENSMUST00000218325 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 AC123618.1-201ENSMUST00000220174 360 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 CT025602.1-201ENSMUST00000227281 382 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Ear2-201ENSMUST00000074839 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm10237-201ENSMUST00000078393 273 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 mt-Td-201ENSMUST00000082404 70 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm22977-201ENSMUST00000082615 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Wnk3-205ENSMUST00000184392 5394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm44601-201ENSMUST00000206678 2720 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Olfr267-202ENSMUST00000216719 4050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm37970-201ENSMUST00000193865 1732 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Mctp1-202ENSMUST00000109589 1653 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 AC154634.4-201ENSMUST00000226077 2665 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Nlrp9a-201ENSMUST00000071780 3125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm23577-201ENSMUST00000103950 110 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm22023-201ENSMUST00000104354 130 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Mir669i-201ENSMUST00000117007 127 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm15175-201ENSMUST00000117629 132 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm12156-201ENSMUST00000119188 554 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm9043-201ENSMUST00000119677 314 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm14837-201ENSMUST00000119688 206 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 n-R5s192-201ENSMUST00000122577 119 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm22026-201ENSMUST00000122735 281 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm4916-201ENSMUST00000126139 642 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 4930421P07Rik-201ENSMUST00000147322 399 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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