Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Rpl48-ps1-201ENSMUST00000177147 556 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Sh3bp1P55194 Gm22290-201ENSMUST00000177655 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Sh3bp1P55194 Gm22583-201ENSMUST00000178031 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Sh3bp1P55194 Gm26189-201ENSMUST00000179879 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Sh3bp1P55194 Gm27660-201ENSMUST00000184028 208 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Sh3bp1P55194 Mir6372-201ENSMUST00000185114 109 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Sh3bp1P55194 Gm28163-201ENSMUST00000187099 325 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Sh3bp1P55194 Gm29216-201ENSMUST00000187117 492 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Sh3bp1P55194 Gm17916-203ENSMUST00000189918 324 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Sh3bp1P55194 Gm29276-201ENSMUST00000190453 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Sh3bp1P55194 Gm37658-201ENSMUST00000192672 315 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Sh3bp1P55194 Gm37701-201ENSMUST00000192947 1100 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Sh3bp1P55194 Gm37104-201ENSMUST00000193278 196 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Sh3bp1P55194 Gm18982-201ENSMUST00000198118 529 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Sh3bp1P55194 Gm43067-201ENSMUST00000201580 445 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Sh3bp1P55194 AL669916.3-201ENSMUST00000213855 94 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Sh3bp1P55194 AL669916.6-201ENSMUST00000214610 94 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Sh3bp1P55194 AL669916.4-201ENSMUST00000215976 94 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Sh3bp1P55194 AL669916.1-201ENSMUST00000217640 94 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Sh3bp1P55194 AC116465.1-201ENSMUST00000220324 235 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Sh3bp1P55194 AC164117.2-201ENSMUST00000222090 327 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Sh3bp1P55194 AC161758.2-201ENSMUST00000228513 218 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Sh3bp1P55194 AC158981.3-202ENSMUST00000228906 523 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Sh3bp1P55194 Ear14-201ENSMUST00000049559 468 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Sh3bp1P55194 Gm2710-201ENSMUST00000073196 603 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Sh3bp1P55194 Gm23932-201ENSMUST00000082914 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Sh3bp1P55194 Gm23723-201ENSMUST00000082996 132 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Sh3bp1P55194 Gm25630-201ENSMUST00000084000 162 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Sh3bp1P55194 Gm10161-201ENSMUST00000091506 204 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Sh3bp1P55194 Gm43924-201ENSMUST00000204851 1736 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Sh3bp1P55194 Gm13757-202ENSMUST00000179450 4383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Sh3bp1P55194 Gm34549-201ENSMUST00000207057 1611 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
Sh3bp1P55194 Gm24982-201ENSMUST00000104456 132 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm23530-201ENSMUST00000104564 137 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 n-R5s26-201ENSMUST00000104601 122 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm14810-201ENSMUST00000121628 486 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm25519-201ENSMUST00000158392 127 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Scgb2b23-ps-202ENSMUST00000167012 516 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm22858-201ENSMUST00000174972 76 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm22851-201ENSMUST00000178741 94 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm25074-201ENSMUST00000178782 94 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm26870-201ENSMUST00000181242 1170 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Mir6371-201ENSMUST00000184470 111 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm19193-201ENSMUST00000190263 590 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm43562-201ENSMUST00000196439 238 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm44465-201ENSMUST00000199536 114 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Olfr1482-ps1-201ENSMUST00000207181 178 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 AC157494.1-201ENSMUST00000221127 549 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 AC118639.1-201ENSMUST00000227204 338 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 AC115735.3-201ENSMUST00000227757 513 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm43326-201ENSMUST00000198459 1638 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Olfr1033-205ENSMUST00000218397 3973 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm37903-201ENSMUST00000192122 2381 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm21814-203ENSMUST00000203729 1352 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 AC161254.1-201ENSMUST00000220310 3842 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Olfr1309-202ENSMUST00000214537 4274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 AC164164.1-201ENSMUST00000223245 2340 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm15127-203ENSMUST00000112753 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm22658-201ENSMUST00000104196 155 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Mir1198-201ENSMUST00000116995 121 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm14558-201ENSMUST00000117458 381 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm12649-201ENSMUST00000137509 581 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm13266-201ENSMUST00000141869 579 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm23078-201ENSMUST00000157848 148 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm8906-202ENSMUST00000179375 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm11395-201ENSMUST00000181011 499 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Rpl31-ps21-201ENSMUST00000181182 374 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm8816-201ENSMUST00000182280 1163 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm7858-201ENSMUST00000190177 622 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm28314-201ENSMUST00000191276 345 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm37097-201ENSMUST00000193676 336 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm37587-202ENSMUST00000194935 475 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm30146-201ENSMUST00000206564 605 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 AC162387.1-201ENSMUST00000213369 213 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm33424-201ENSMUST00000222317 257 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Olfr308-201ENSMUST00000044256 1056 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Olfr175-ps1-201ENSMUST00000079955 1169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Snord35b-201ENSMUST00000082833 87 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Mir193a-201ENSMUST00000083461 66 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Mir101b-201ENSMUST00000083622 97 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Mir103-2-201ENSMUST00000083629 86 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 AC115047.2-201ENSMUST00000214421 1848 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Olfr810-203ENSMUST00000214878 4709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Pak3-202ENSMUST00000112863 8657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Vmn1r13-204ENSMUST00000227421 5235 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Olfr789-202ENSMUST00000213992 4421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Tlr3-205ENSMUST00000209772 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Nlrp9a-202ENSMUST00000108387 3336 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Mir669d-2-201ENSMUST00000116854 86 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm14049-201ENSMUST00000121009 636 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm8840-201ENSMUST00000122454 386 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 n-R5s32-201ENSMUST00000122495 103 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm11842-201ENSMUST00000130117 556 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm14254-201ENSMUST00000136371 296 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Rpl31-ps14-201ENSMUST00000143596 378 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm13943-201ENSMUST00000144043 343 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 4930401O12Rik-201ENSMUST00000153175 841 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm24439-201ENSMUST00000157894 117 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm16043-201ENSMUST00000160030 616 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Sh3bp1P55194 Gm21788-201ENSMUST00000177878 543 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
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