Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Gm19118-201ENSMUST00000222554 98 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Gm24041-201ENSMUST00000083115 156 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Wdr66-207ENSMUST00000170536 3679 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Impg1-201ENSMUST00000085289 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Trp63-205ENSMUST00000115306 4691 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Ifit1bl2-202ENSMUST00000112463 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Ift80-202ENSMUST00000107812 4063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Olfr905-202ENSMUST00000214377 4429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Gm37357-201ENSMUST00000192386 3123 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Nlrp1c-ps-201ENSMUST00000171546 3457 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Ndst3-203ENSMUST00000132112 4460 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Efcab5-201ENSMUST00000108400 4654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Kdm4c-202ENSMUST00000077851 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Olfr835-202ENSMUST00000213018 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Olfr921-202ENSMUST00000213958 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Slc5a12-202ENSMUST00000111026 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Kif20a-201ENSMUST00000166044 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Slc38a6-208ENSMUST00000153941 3927 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Slc26a3-201ENSMUST00000001254 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Olfr1278-205ENSMUST00000215210 6901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Sult1b1-202ENSMUST00000117455 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Ralgapa2-205ENSMUST00000131824 5624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Nkrf-201ENSMUST00000057093 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Igkv4-92-201ENSMUST00000103332 351 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Gm3086-201ENSMUST00000110560 620 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Gm15803-201ENSMUST00000120118 394 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Prp2-202ENSMUST00000178961 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Gm26435-201ENSMUST00000179026 107 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Mir6344-201ENSMUST00000183462 104 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Gm27855-201ENSMUST00000184122 128 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Olfr1421-ps1-201ENSMUST00000208900 208 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Gm26326-201ENSMUST00000083070 129 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Cfap44-201ENSMUST00000099742 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Gm43824-201ENSMUST00000199042 2588 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Gm16092-201ENSMUST00000161449 2405 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Med12l-204ENSMUST00000164225 10264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Krba1-204ENSMUST00000114572 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Tph1-201ENSMUST00000049298 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Tnik-211ENSMUST00000161964 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Aox1-201ENSMUST00000001027 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Vmn1r86-202ENSMUST00000226604 6378 ntAPPRIS P2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Frmpd4-201ENSMUST00000112145 7924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Vmn2r90-201ENSMUST00000169805 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Cfap57-202ENSMUST00000081921 3750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Olfr1356-202ENSMUST00000205100 3023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Fam160a1-201ENSMUST00000094148 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Tm9sf4-201ENSMUST00000089027 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Clasp1-204ENSMUST00000178710 7566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Sgcg-201ENSMUST00000077954 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Ryr2-202ENSMUST00000170156 16813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Ryr2-201ENSMUST00000021750 16814 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Sulf1-201ENSMUST00000088585 4630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Prom1-208ENSMUST00000179059 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Ighv1-54-201ENSMUST00000103525 377 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Gm25419-201ENSMUST00000104215 191 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Gm11874-201ENSMUST00000117437 130 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Gm12469-201ENSMUST00000117623 207 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Gm22034-201ENSMUST00000157283 134 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Gm23700-201ENSMUST00000158842 102 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Mir6371-201ENSMUST00000184470 111 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 AC132221.1-201ENSMUST00000220577 3841 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Gm23238-201ENSMUST00000083007 164 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 n-R5s183-201ENSMUST00000083939 115 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Psd4-202ENSMUST00000102942 11265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Dlg1-204ENSMUST00000115196 3418 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Gm26786-201ENSMUST00000180410 6243 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Nin-202ENSMUST00000085314 9675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Wdr72-205ENSMUST00000215440 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Scaper-202ENSMUST00000214747 5231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Ncor1-205ENSMUST00000101067 7243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Mei1-204ENSMUST00000189540 3718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Olfr845-202ENSMUST00000213344 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Olfr250-202ENSMUST00000216168 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Rnf180-202ENSMUST00000224011 3785 ntAPPRIS P2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Olfr303-203ENSMUST00000215532 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Dlgap5-208ENSMUST00000180299 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Olfr1326-ps1-201ENSMUST00000059880 3637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Cd209e-201ENSMUST00000033888 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Trdn-208ENSMUST00000219982 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Muc5ac-202ENSMUST00000155534 10752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Usp25-201ENSMUST00000023580 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Nudcd1-206ENSMUST00000227843 5077 ntAPPRIS P2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Zfp804b-201ENSMUST00000164784 3924 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Usp37-201ENSMUST00000044260 7111 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Rab3c-201ENSMUST00000167824 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Abca17-202ENSMUST00000121226 5317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Trbv15-201ENSMUST00000103273 370 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Gm25407-201ENSMUST00000104102 134 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Mir6414-201ENSMUST00000183685 82 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Gm29093-201ENSMUST00000187366 409 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Gm42716-203ENSMUST00000197140 259 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Gm32381-201ENSMUST00000203192 476 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 AC238676.3-201ENSMUST00000223042 154 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 n-R5s182-201ENSMUST00000083889 107 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Olfr374-202ENSMUST00000210435 8718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 P2ry10-201ENSMUST00000053375 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Syt4-201ENSMUST00000025110 3901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Arhgap15-201ENSMUST00000055776 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 2700049A03Rik-201ENSMUST00000045907 4507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
Hoxd11P23813 Olfr698-202ENSMUST00000214306 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
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