Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm24670-201ENSMUST00000104154 132 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm12393-201ENSMUST00000117084 848 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm12782-201ENSMUST00000117519 727 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm6574-201ENSMUST00000120037 362 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm13443-201ENSMUST00000120770 555 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm11384-201ENSMUST00000121376 303 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm15529-201ENSMUST00000121833 994 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm23886-201ENSMUST00000122684 313 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 5330434G04Rik-201ENSMUST00000130264 511 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm22755-201ENSMUST00000157143 100 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm22849-201ENSMUST00000157713 307 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm22733-201ENSMUST00000158094 91 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm24210-201ENSMUST00000158263 133 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm23352-201ENSMUST00000158428 64 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Vmn2r-ps111-201ENSMUST00000161565 241 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Tcrg-C3-201ENSMUST00000164407 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Vmn2r-ps79-201ENSMUST00000174256 377 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Mir5136-201ENSMUST00000175573 76 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm26502-201ENSMUST00000177732 94 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Snord116l13-201ENSMUST00000177737 94 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm21095-201ENSMUST00000177775 498 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm25350-201ENSMUST00000177849 94 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Snord116l15-201ENSMUST00000177940 94 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm23446-201ENSMUST00000177977 94 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Snord116l4-201ENSMUST00000177982 94 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm26201-201ENSMUST00000178047 94 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm24711-201ENSMUST00000178062 94 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm20916-201ENSMUST00000178063 498 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm24609-201ENSMUST00000178166 94 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm23265-201ENSMUST00000178321 94 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm22812-201ENSMUST00000178329 94 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Snord116l3-201ENSMUST00000178370 94 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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Ccl20O89093 Gm25155-201ENSMUST00000178450 94 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm24760-201ENSMUST00000178530 94 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm22285-201ENSMUST00000178576 94 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm22417-201ENSMUST00000178656 94 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Snord116l2-201ENSMUST00000178675 94 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm26270-201ENSMUST00000178690 94 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Snord116l16-201ENSMUST00000178777 94 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm23313-201ENSMUST00000178931 94 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Snord116l17-201ENSMUST00000178936 94 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm23089-201ENSMUST00000178947 94 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Snord116l10-201ENSMUST00000179053 94 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm24153-201ENSMUST00000179280 94 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm25597-201ENSMUST00000179388 94 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Snord116l1-201ENSMUST00000179518 94 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm25816-201ENSMUST00000179764 94 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm21760-201ENSMUST00000179811 498 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Snord116l8-201ENSMUST00000179889 94 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Snord116l7-201ENSMUST00000179895 94 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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Ccl20O89093 Gm26188-201ENSMUST00000179963 94 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm21477-201ENSMUST00000179970 498 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm21117-201ENSMUST00000180133 498 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm20855-201ENSMUST00000180170 498 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm26433-201ENSMUST00000180227 94 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm20931-201ENSMUST00000180249 498 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Snord116l11-201ENSMUST00000180312 94 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm20896-201ENSMUST00000180332 498 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm22128-201ENSMUST00000180346 94 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm27379-201ENSMUST00000183730 123 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm19193-201ENSMUST00000190263 590 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm34599-201ENSMUST00000198924 288 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 4930459L07Rik-201ENSMUST00000199751 420 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm42665-201ENSMUST00000202100 586 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Crs-ps-201ENSMUST00000203723 760 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm44609-201ENSMUST00000207157 460 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm18414-201ENSMUST00000210858 694 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm36445-205ENSMUST00000211729 1100 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm46193-201ENSMUST00000219399 364 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 AC132384.11-201ENSMUST00000219676 178 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
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Ccl20O89093 Gm22507-201ENSMUST00000082773 160 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Olfr794-202ENSMUST00000204820 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Hormad1-202ENSMUST00000090797 1511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
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Ccl20O89093 Esp34-201ENSMUST00000173055 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Esp34-202ENSMUST00000178654 1413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm13757-202ENSMUST00000179450 4383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Olfr1107-202ENSMUST00000214049 4388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm43924-201ENSMUST00000204851 1736 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm43896-201ENSMUST00000203440 2032 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Mir682-201ENSMUST00000102281 96 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Dppa1-202ENSMUST00000109227 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm11352-201ENSMUST00000119264 517 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
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Ccl20O89093 Gm13356-201ENSMUST00000121678 335 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm13406-201ENSMUST00000121991 256 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm13656-201ENSMUST00000123829 345 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm22792-201ENSMUST00000157225 133 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm23642-201ENSMUST00000157858 258 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm22947-201ENSMUST00000158559 91 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm9593-201ENSMUST00000166034 469 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Scgb2b23-ps-202ENSMUST00000167012 516 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm17186-201ENSMUST00000171742 456 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm22716-201ENSMUST00000177596 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm26779-201ENSMUST00000181101 551 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
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