Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Gm16111-201ENSMUST00000162128 285 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 H2al2c-201ENSMUST00000163651 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 H2al2b-201ENSMUST00000168551 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm8114-201ENSMUST00000172225 484 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm28217-201ENSMUST00000188613 648 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm28061-201ENSMUST00000189085 807 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm37428-201ENSMUST00000193886 137 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm36831-201ENSMUST00000196485 631 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm42925-201ENSMUST00000197359 285 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm43007-201ENSMUST00000197618 291 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm15927-204ENSMUST00000206075 372 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm45402-201ENSMUST00000211796 223 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Olfr792-202ENSMUST00000215436 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm20102-201ENSMUST00000222445 220 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 AC154747.1-201ENSMUST00000225265 239 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 AC124746.2-201ENSMUST00000226594 427 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Olfr769-201ENSMUST00000050915 1084 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Olfr832-201ENSMUST00000060601 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Cp-201ENSMUST00000003714 4092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Olfr166-202ENSMUST00000213531 4205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Olfr1211-203ENSMUST00000213412 4173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Olfr1447-203ENSMUST00000216989 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Olfr722-201ENSMUST00000053290 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Olfr194-203ENSMUST00000216519 3705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Ighv16-1-201ENSMUST00000103470 299 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm14897-201ENSMUST00000118213 207 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm14282-201ENSMUST00000119484 240 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm12190-201ENSMUST00000120001 187 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm14852-201ENSMUST00000120065 647 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm3669-202ENSMUST00000127852 397 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm2101-201ENSMUST00000128191 397 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm4128-201ENSMUST00000154338 461 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm2165-205ENSMUST00000155337 397 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm23513-201ENSMUST00000158181 133 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm22530-201ENSMUST00000158820 118 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm23775-201ENSMUST00000158991 249 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Fam184a-206ENSMUST00000169866 501 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm15446-203ENSMUST00000170826 192 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Obox4-ps26-201ENSMUST00000176368 724 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm16430-202ENSMUST00000178145 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm21638-201ENSMUST00000179473 836 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm16405-202ENSMUST00000180150 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm26866-201ENSMUST00000180414 802 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm26871-203ENSMUST00000181060 355 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm27201-201ENSMUST00000183818 416 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm28628-201ENSMUST00000187006 264 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm28629-201ENSMUST00000187309 263 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm20937-202ENSMUST00000189084 811 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm20736-203ENSMUST00000190282 836 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm37353-201ENSMUST00000194497 313 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Mirlet7f-1-201ENSMUST00000198652 89 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Mir691-201ENSMUST00000199719 78 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm44475-201ENSMUST00000204041 424 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm45395-201ENSMUST00000209891 559 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm18854-201ENSMUST00000211196 329 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 AC100590.3-201ENSMUST00000219355 332 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm14390-201ENSMUST00000117505 1695 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm43326-201ENSMUST00000198459 1638 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Olfr837-202ENSMUST00000215699 3758 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Fsip2-203ENSMUST00000143764 21116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Olfr1325-202ENSMUST00000216007 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Rgs1-208ENSMUST00000189061 3841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Olfr789-201ENSMUST00000213236 4235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm14632-201ENSMUST00000101654 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Ighv3-6-201ENSMUST00000103481 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm24160-201ENSMUST00000104594 126 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm11386-201ENSMUST00000117761 347 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm13806-201ENSMUST00000117822 325 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm15014-201ENSMUST00000120742 258 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm23213-201ENSMUST00000122715 313 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm23411-201ENSMUST00000157988 62 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm24850-201ENSMUST00000158029 119 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm22257-201ENSMUST00000158687 301 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm23028-201ENSMUST00000158773 265 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm8338-201ENSMUST00000163928 363 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm17224-201ENSMUST00000171429 500 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Mir5101-201ENSMUST00000175181 83 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Aste1-207ENSMUST00000176940 1151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm4479-201ENSMUST00000178807 171 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 A930005H10Rik-202ENSMUST00000185424 433 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm29064-201ENSMUST00000187014 813 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm38109-201ENSMUST00000195386 181 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm18850-201ENSMUST00000211578 388 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 AC109212.1-201ENSMUST00000215561 427 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Zmynd11-223ENSMUST00000222358 340 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Ap3m1-208ENSMUST00000224016 764 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 AC166830.1-201ENSMUST00000224201 533 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Olfr164-201ENSMUST00000056727 1095 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm10147-201ENSMUST00000075388 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm25205-201ENSMUST00000082841 103 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm23242-201ENSMUST00000083055 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm22577-201ENSMUST00000083731 109 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm22826-201ENSMUST00000083774 165 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Olfr575-201ENSMUST00000084812 957 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Ccdc178-202ENSMUST00000115837 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Olfr1162-202ENSMUST00000183862 4800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Thoc1-201ENSMUST00000025137 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Cp-202ENSMUST00000091309 4029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Gm3234-202ENSMUST00000223301 3250 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Smim18J3QNP2 Zfp534-201ENSMUST00000117638 2885 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms