Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 AC165146.1-201ENSMUST00000223777 900 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 AC147639.1-201ENSMUST00000224216 661 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 AC133598.3-201ENSMUST00000224322 568 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm25739-201ENSMUST00000082886 107 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Mir320-201ENSMUST00000083594 82 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Crisp3-201ENSMUST00000026499 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Olfr781-202ENSMUST00000204108 1304 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm25647-201ENSMUST00000101832 78 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm25823-201ENSMUST00000101995 78 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm15116-201ENSMUST00000122248 663 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm22839-201ENSMUST00000158436 304 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm26029-201ENSMUST00000158659 132 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Mir1264-201ENSMUST00000175381 86 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm24220-201ENSMUST00000177753 79 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm25988-201ENSMUST00000177759 79 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm23471-201ENSMUST00000177886 79 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm26488-201ENSMUST00000178225 79 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm23449-201ENSMUST00000179208 79 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm25221-201ENSMUST00000180051 79 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 4930521E06Rik-201ENSMUST00000186732 905 ntTSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm17946-201ENSMUST00000186856 538 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm42750-201ENSMUST00000199745 353 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm44348-201ENSMUST00000200165 122 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps6-201ENSMUST00000201079 934 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Olfr729-201ENSMUST00000061020 972 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Olfr815-201ENSMUST00000071557 951 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Olfr340-201ENSMUST00000072854 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm37331-201ENSMUST00000192367 3375 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm15161-201ENSMUST00000117340 387 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm12392-201ENSMUST00000118014 938 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm12926-201ENSMUST00000121158 409 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm25047-201ENSMUST00000122667 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm24656-201ENSMUST00000177548 132 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm38238-201ENSMUST00000194334 346 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 AC117232.1-201ENSMUST00000197964 119 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm36546-201ENSMUST00000206372 230 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm44555-201ENSMUST00000209008 148 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm45368-201ENSMUST00000209323 703 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Olfr369-ps1-201ENSMUST00000212589 836 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm34276-201ENSMUST00000222558 439 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 AC161572.1-201ENSMUST00000227486 640 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm15421-201ENSMUST00000051985 443 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Igkv17-121-201ENSMUST00000103315 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 n-R5s26-201ENSMUST00000104601 122 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm14444-202ENSMUST00000109070 1281 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm15090-201ENSMUST00000118787 1196 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm13080-201ENSMUST00000120556 420 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm15115-201ENSMUST00000121145 264 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm15089-201ENSMUST00000122332 1196 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm24002-201ENSMUST00000158456 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Spink10-206ENSMUST00000162511 684 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm3173-203ENSMUST00000166848 396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm15564-202ENSMUST00000173605 402 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Mir3473c-201ENSMUST00000175262 81 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm25525-201ENSMUST00000177701 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm26178-201ENSMUST00000177706 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm22995-201ENSMUST00000179670 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm25672-201ENSMUST00000180111 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm26916-201ENSMUST00000183304 352 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Mir6240-201ENSMUST00000184281 117 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm38171-201ENSMUST00000195716 478 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm44476-201ENSMUST00000196225 91 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm44665-201ENSMUST00000205381 251 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm45341-201ENSMUST00000210850 1104 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
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Col5a3Q9JLI2 Il1f8-201ENSMUST00000028363 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm23520-201ENSMUST00000093736 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r185-204ENSMUST00000227411 4928 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Olfr785-201ENSMUST00000204402 2014 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Olfr1487-204ENSMUST00000216688 2038 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Arhgap5-201ENSMUST00000110725 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Iglv3-201ENSMUST00000103751 381 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Olfr1186-201ENSMUST00000121619 1090 ntAPPRIS P1 BASIC1.86□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r-ps14-201ENSMUST00000176859 913 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm18415-201ENSMUST00000177464 647 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm21409-201ENSMUST00000186110 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm28191-201ENSMUST00000189112 211 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm17987-201ENSMUST00000206902 603 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm44585-201ENSMUST00000207150 607 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 CT030159.4-201ENSMUST00000221966 395 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 AC134254.4-201ENSMUST00000223086 370 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 CT025525.2-201ENSMUST00000227743 423 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 AC123860.1-201ENSMUST00000228033 481 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Olfr868-202ENSMUST00000212999 4233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Cpa3-201ENSMUST00000001921 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm5937-201ENSMUST00000119715 643 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm12587-201ENSMUST00000120180 427 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm14986-201ENSMUST00000121262 1002 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm21865-201ENSMUST00000177713 498 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm8676-201ENSMUST00000184206 637 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm18341-201ENSMUST00000197538 622 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm45048-201ENSMUST00000207058 429 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 CT009696.1-201ENSMUST00000215745 256 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 AC147545.1-201ENSMUST00000227528 108 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Olfr851-201ENSMUST00000064582 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Olfr619-201ENSMUST00000098196 1124 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm13231-201ENSMUST00000119218 2850 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm14404-201ENSMUST00000119117 1660 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
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