Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Trdn-208ENSMUST00000219982 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Gm18432-201ENSMUST00000195568 1451 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Gm22831-201ENSMUST00000102473 109 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Gm25764-201ENSMUST00000104092 134 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Gm13761-201ENSMUST00000117238 807 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Gm12765-201ENSMUST00000117273 615 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Gm11367-201ENSMUST00000117802 120 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Gm13085-201ENSMUST00000118356 171 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Gm14008-201ENSMUST00000120483 274 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Gm14768-201ENSMUST00000122126 678 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Gm22107-201ENSMUST00000122548 100 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 4930517O19Rik-202ENSMUST00000145018 571 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Gm24847-201ENSMUST00000158032 108 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Vmn1r-ps59-201ENSMUST00000172698 199 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Ranbp2-ps10-201ENSMUST00000185097 385 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Gm28399-201ENSMUST00000186221 318 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Gm28572-201ENSMUST00000187444 318 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 4930553J12Rik-202ENSMUST00000187823 851 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Gm37732-201ENSMUST00000194377 316 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Gm45911-201ENSMUST00000211844 601 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 AC160016.1-201ENSMUST00000215589 448 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Gm35371-201ENSMUST00000216204 579 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 AC135019.1-201ENSMUST00000219949 307 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 AC126554.1-201ENSMUST00000222161 271 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 AC117656.1-201ENSMUST00000225826 339 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 AC183096.1-201ENSMUST00000226392 130 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 AC108416.2-201ENSMUST00000226792 367 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 S100a11-201ENSMUST00000029515 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 2610303G11Rik-201ENSMUST00000061643 517 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Gm2710-201ENSMUST00000073196 603 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Prl7a1-202ENSMUST00000095924 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Mcmdc2-203ENSMUST00000125294 2003 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Depdc1a-201ENSMUST00000029825 2920 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1255-202ENSMUST00000214508 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Gm28465-202ENSMUST00000220779 1701 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Olfr194-202ENSMUST00000213228 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Evi2b-201ENSMUST00000179322 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Ankrd28-207ENSMUST00000227863 6616 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Zfp534-201ENSMUST00000117638 2885 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Olfr715-202ENSMUST00000214919 5114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Acsm3-201ENSMUST00000063770 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Mir92b-201ENSMUST00000102300 83 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Gm12982-201ENSMUST00000117408 190 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Gm14627-201ENSMUST00000118931 567 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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Pggt1bQ8BUY9 Gm14581-201ENSMUST00000121726 198 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
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Pggt1bQ8BUY9 Gm11418-201ENSMUST00000156193 626 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Gm24857-201ENSMUST00000158061 310 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Gm10075-201ENSMUST00000162030 545 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 4930505G20Rik-201ENSMUST00000176582 561 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
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Pggt1bQ8BUY9 Gm27490-201ENSMUST00000184754 128 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Trav17-202ENSMUST00000186545 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
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Pggt1bQ8BUY9 Vamp4-208ENSMUST00000194810 600 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Ighv12-1-201ENSMUST00000195542 329 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Gm2189-201ENSMUST00000201419 429 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Gm43101-202ENSMUST00000201733 488 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
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Pggt1bQ8BUY9 AC125543.5-201ENSMUST00000222799 108 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Prl-203ENSMUST00000224228 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
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Pggt1bQ8BUY9 Gm22740-201ENSMUST00000083439 109 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Gm10242-201ENSMUST00000090064 330 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1434-201ENSMUST00000207186 2714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1404-202ENSMUST00000216556 3305 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Gm42870-201ENSMUST00000199355 3470 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 AC158921.1-201ENSMUST00000227861 3468 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Oog1-203ENSMUST00000222332 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Gm7135-202ENSMUST00000191257 1905 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1039-202ENSMUST00000214364 3925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Gm9911-201ENSMUST00000211467 2802 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Gm37848-201ENSMUST00000195288 3103 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Igkv4-57-201ENSMUST00000103357 352 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Gm11576-201ENSMUST00000117433 417 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Gm11813-201ENSMUST00000118586 291 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Gm12871-201ENSMUST00000118758 438 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Gm13868-201ENSMUST00000122411 294 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Etaa1os-201ENSMUST00000140161 550 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
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