Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Gm43675-201ENSMUST00000199468 1184 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
Ccdc18Q640L5 Gm45367-201ENSMUST00000210171 347 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
Ccdc18Q640L5 Gm45789-201ENSMUST00000213038 364 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
Ccdc18Q640L5 AC101945.1-201ENSMUST00000226734 466 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
Ccdc18Q640L5 Gm15443-201ENSMUST00000118947 820 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc18Q640L5 Gm14867-201ENSMUST00000120156 866 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc18Q640L5 Gm22565-201ENSMUST00000175540 69 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc18Q640L5 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc18Q640L5 AC153936.1-201ENSMUST00000219874 395 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc18Q640L5 AC155167.3-201ENSMUST00000226349 217 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc18Q640L5 AC168062.2-201ENSMUST00000228907 422 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc18Q640L5 1110057P08Rik-201ENSMUST00000089097 465 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc18Q640L5 Tas2r121-201ENSMUST00000095395 918 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc18Q640L5 Gm4224-201ENSMUST00000211557 1594 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc18Q640L5 Gm42639-201ENSMUST00000197061 1871 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc18Q640L5 Gm37598-201ENSMUST00000194506 1301 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc18Q640L5 Gm11352-201ENSMUST00000119264 517 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc18Q640L5 Gm11556-201ENSMUST00000120751 288 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc18Q640L5 Gm11404-201ENSMUST00000120872 494 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc18Q640L5 Mir6371-201ENSMUST00000184470 111 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc18Q640L5 Gm22897-201ENSMUST00000197860 128 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc18Q640L5 Igkv15-102-201ENSMUST00000197885 287 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc18Q640L5 Gm44634-201ENSMUST00000206119 152 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc18Q640L5 AC155927.1-201ENSMUST00000220114 1200 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccdc18Q640L5 Gm15001-201ENSMUST00000117657 795 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccdc18Q640L5 Cyp3a25-202ENSMUST00000138870 513 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccdc18Q640L5 Gm23469-201ENSMUST00000157131 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccdc18Q640L5 Gm24813-201ENSMUST00000175310 84 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccdc18Q640L5 Snhg14-208ENSMUST00000188262 687 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccdc18Q640L5 Gm43739-201ENSMUST00000198294 307 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccdc18Q640L5 Gm45435-201ENSMUST00000211147 475 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccdc18Q640L5 Gm20756-201ENSMUST00000201080 1595 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccdc18Q640L5 Gm6923-201ENSMUST00000118343 406 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccdc18Q640L5 Gm25341-201ENSMUST00000157461 268 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccdc18Q640L5 Tspy-ps-202ENSMUST00000172304 321 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccdc18Q640L5 4921511E07Rik-201ENSMUST00000194790 827 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccdc18Q640L5 Gm36546-201ENSMUST00000206372 230 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccdc18Q640L5 AC102312.1-201ENSMUST00000217752 475 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccdc18Q640L5 Olfr6-204ENSMUST00000219365 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccdc18Q640L5 Olfr820-202ENSMUST00000214917 4701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccdc18Q640L5 Homer1-205ENSMUST00000109492 1533 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccdc18Q640L5 Gm13331-201ENSMUST00000117500 448 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccdc18Q640L5 Gm12372-201ENSMUST00000121654 768 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccdc18Q640L5 Gm22963-201ENSMUST00000157960 91 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccdc18Q640L5 Gm20948-201ENSMUST00000211091 449 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccdc18Q640L5 AC124456.1-201ENSMUST00000217391 2597 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccdc18Q640L5 Olfr379-ps1-201ENSMUST00000117349 934 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccdc18Q640L5 Gm17113-201ENSMUST00000170118 171 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccdc18Q640L5 Gm11395-201ENSMUST00000181011 499 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccdc18Q640L5 Mir211-201ENSMUST00000083651 106 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccdc18Q640L5 Olfr987-203ENSMUST00000216347 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccdc18Q640L5 Vmn2r-ps83-201ENSMUST00000173787 2368 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccdc18Q640L5 Olfr1109-202ENSMUST00000214636 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccdc18Q640L5 Gm15161-201ENSMUST00000117340 387 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccdc18Q640L5 Gm24942-201ENSMUST00000158328 114 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccdc18Q640L5 Gm25715-201ENSMUST00000158627 125 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccdc18Q640L5 Gm45715-201ENSMUST00000206991 434 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccdc18Q640L5 AC117198.1-201ENSMUST00000217080 651 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccdc18Q640L5 AC157654.1-201ENSMUST00000224130 820 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccdc18Q640L5 1700019M22Rik-201ENSMUST00000073560 354 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccdc18Q640L5 Mir10b-201ENSMUST00000083566 68 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Ccdc18Q640L5 Tecrl-201ENSMUST00000053543 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 Gm14894-201ENSMUST00000117170 270 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 Gm15404-201ENSMUST00000141811 364 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 Gm27636-201ENSMUST00000184528 122 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 Gm29322-201ENSMUST00000185378 582 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 Gm37449-201ENSMUST00000193016 270 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 Gm37340-201ENSMUST00000193124 759 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 Gm18658-201ENSMUST00000195558 270 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 Cycs-ps3-201ENSMUST00000223240 321 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 Mucl1-202ENSMUST00000226484 758 ntAPPRIS P5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 AC160550.1-201ENSMUST00000228659 181 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 mt-Nd4l-201ENSMUST00000084013 297 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 Tslrn1-201ENSMUST00000129479 747 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 Gm24288-201ENSMUST00000157630 144 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 Scgb2b16-ps-201ENSMUST00000188720 333 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 Gm28151-201ENSMUST00000189404 951 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 Gm28169-201ENSMUST00000190342 345 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 Gm43729-201ENSMUST00000196949 499 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 Gm44818-201ENSMUST00000206608 358 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 Gm18892-201ENSMUST00000217628 881 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 Gm18751-201ENSMUST00000185777 2013 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 Gm14322-201ENSMUST00000108942 1074 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 Gm27233-201ENSMUST00000184030 307 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 Gm37021-201ENSMUST00000195835 663 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 Igkv13-61-1-201ENSMUST00000198255 296 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 Gm5317-201ENSMUST00000204445 847 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 AC133156.1-202ENSMUST00000227284 363 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 Stfa1-201ENSMUST00000042097 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 V1ra8-201ENSMUST00000078371 890 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 Olfr727-201ENSMUST00000079142 1035 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 Olfr1193-201ENSMUST00000081697 957 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 Gm14327-201ENSMUST00000099001 192 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 Gm45577-201ENSMUST00000210206 2287 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 Gm42671-201ENSMUST00000198013 1604 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 Gm25416-201ENSMUST00000104221 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 Gm25787-201ENSMUST00000104709 92 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 Gm14041-201ENSMUST00000150181 276 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Ccdc18Q640L5 Gm25971-201ENSMUST00000158953 286 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.5 ms