Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm15878-201ENSMUST00000127561 306 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm12238-201ENSMUST00000127764 124 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 4930401O12Rik-201ENSMUST00000153175 841 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Vmn2r-ps70-201ENSMUST00000174636 302 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Vmn1r-ps149-201ENSMUST00000176997 183 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm10267-202ENSMUST00000181652 341 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Obox4-ps39-201ENSMUST00000184306 628 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm28314-201ENSMUST00000191276 345 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm37568-201ENSMUST00000191755 364 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm36984-201ENSMUST00000192770 235 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm38154-201ENSMUST00000195444 340 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm18551-201ENSMUST00000195594 642 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm18982-201ENSMUST00000198118 529 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm43470-202ENSMUST00000198573 227 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm43732-201ENSMUST00000200260 511 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm10400-201ENSMUST00000203920 3835 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm44657-201ENSMUST00000208568 450 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm45438-201ENSMUST00000210242 564 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm45686-201ENSMUST00000210259 460 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm45860-201ENSMUST00000212700 334 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Olfr114-202ENSMUST00000214871 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Rpl26-ps6-201ENSMUST00000216693 434 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 AC170810.3-201ENSMUST00000226177 374 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 AC166344.2-201ENSMUST00000226747 374 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Spag11b-201ENSMUST00000039075 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Olfr967-201ENSMUST00000069561 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm10025-201ENSMUST00000079568 372 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 n-R5s40-201ENSMUST00000082475 124 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm26055-201ENSMUST00000083038 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm25755-201ENSMUST00000083396 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Mir323-201ENSMUST00000083683 86 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm25628-201ENSMUST00000084002 105 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 AC121598.3-201ENSMUST00000227179 1643 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 AC157570.1-201ENSMUST00000218052 3778 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 4930430A15Rik-201ENSMUST00000028577 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm37479-201ENSMUST00000194169 3841 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm21032-201ENSMUST00000208108 2578 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 AC125223.3-201ENSMUST00000223588 2067 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm12156-201ENSMUST00000119188 554 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm13482-201ENSMUST00000119842 254 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm14428-201ENSMUST00000120408 822 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm13862-201ENSMUST00000121220 197 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Xlr4e-ps-201ENSMUST00000122102 648 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm7209-201ENSMUST00000122339 333 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm26027-201ENSMUST00000122725 268 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm14951-201ENSMUST00000143622 570 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm25637-201ENSMUST00000157529 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm23865-201ENSMUST00000157723 97 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm24532-201ENSMUST00000157951 286 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm24771-201ENSMUST00000158508 137 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm25490-201ENSMUST00000158734 130 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm16289-201ENSMUST00000162079 183 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm17162-201ENSMUST00000168538 473 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Mir6386-201ENSMUST00000183558 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm27817-201ENSMUST00000184302 233 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm29550-201ENSMUST00000185543 285 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 1700022E09Rik-202ENSMUST00000188342 387 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm28650-201ENSMUST00000188413 411 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm19641-201ENSMUST00000188432 417 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm36966-201ENSMUST00000192217 413 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 4930449A18Rik-202ENSMUST00000192453 1200 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm19066-201ENSMUST00000193232 1078 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Igkv13-73-1-201ENSMUST00000196767 200 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm44391-201ENSMUST00000198490 93 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm6135-201ENSMUST00000198726 372 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm31230-201ENSMUST00000199725 785 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm43239-201ENSMUST00000200131 201 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm44295-201ENSMUST00000203805 437 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm44526-201ENSMUST00000204664 121 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm44174-201ENSMUST00000205022 141 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 AC124542.1-201ENSMUST00000205588 908 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm36159-201ENSMUST00000206737 549 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Olfr1470-ps1-201ENSMUST00000208620 949 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm6012-201ENSMUST00000210821 730 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 AC155923.1-201ENSMUST00000215676 356 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm20304-201ENSMUST00000218168 444 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Trdn-207ENSMUST00000219931 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm24474-201ENSMUST00000220504 469 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm17890-201ENSMUST00000221419 757 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 AC156560.1-201ENSMUST00000221425 256 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 1700030L22Rik-202ENSMUST00000222223 704 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 AC165146.1-201ENSMUST00000223777 900 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 AC167192.4-201ENSMUST00000224087 993 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 AC154603.1-201ENSMUST00000224355 313 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 AC116656.1-201ENSMUST00000227040 755 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm26206-201ENSMUST00000082908 110 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm24490-201ENSMUST00000083803 98 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm5670-201ENSMUST00000093546 372 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm14445-201ENSMUST00000117051 1484 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm13212-202ENSMUST00000105739 3595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Sult2a8-203ENSMUST00000168252 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm42659-201ENSMUST00000196955 1754 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Cyp3a44-201ENSMUST00000067479 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 AC154481.2-201ENSMUST00000222526 3175 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 C030005K15Rik-201ENSMUST00000166373 1882 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Adam29-201ENSMUST00000053441 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Snord116l9-201ENSMUST00000101891 94 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm26504-201ENSMUST00000102033 94 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Igkv2-109-201ENSMUST00000103322 374 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms