Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm12351-201ENSMUST00000118727 292 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Gm15346-201ENSMUST00000143638 475 ntTSL 1 (best) BASIC1.02□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Gm24783-201ENSMUST00000157639 100 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Gm8207-201ENSMUST00000171204 502 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Gm22254-201ENSMUST00000179186 110 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 CT010455.1-201ENSMUST00000218579 413 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Gm3211-201ENSMUST00000172721 304 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Gm27248-201ENSMUST00000184004 166 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Gm19649-201ENSMUST00000201126 822 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Olfr955-201ENSMUST00000073946 945 ntAPPRIS P1 BASIC1.02□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Mir219a-2-201ENSMUST00000083551 97 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 AC153526.2-201ENSMUST00000218206 2031 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Gm14835-201ENSMUST00000119039 315 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Gm13676-201ENSMUST00000122185 591 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Mir6379-201ENSMUST00000183392 115 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Pcdh11x-208ENSMUST00000193899 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 BC051076-202ENSMUST00000199477 2868 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Mir365-2-201ENSMUST00000083555 112 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Gm23040-201ENSMUST00000083869 163 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Gm22353-201ENSMUST00000083918 136 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Sult2a8-203ENSMUST00000168252 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Gm42639-201ENSMUST00000197061 1871 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Ighv3-6-201ENSMUST00000103481 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Dppa1-202ENSMUST00000109227 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.01□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Gm14238-201ENSMUST00000120227 323 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 4933430M04Rik-201ENSMUST00000152726 744 ntTSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Gm24690-201ENSMUST00000157759 97 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Spink10-206ENSMUST00000162511 684 ntTSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Vmn2r-ps75-201ENSMUST00000173251 213 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Mir6389-201ENSMUST00000183661 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 BE692007-201ENSMUST00000186054 954 ntTSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Gm28974-201ENSMUST00000187893 231 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Gm28862-201ENSMUST00000188246 163 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Prl2c5-201ENSMUST00000021778 844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 AC093316.2-201ENSMUST00000220015 172 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 AC144628.2-201ENSMUST00000227374 352 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Gm13331-201ENSMUST00000117500 448 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Xlr4e-ps-201ENSMUST00000122102 648 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Prl2c5-204ENSMUST00000151144 623 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Gm22088-201ENSMUST00000158341 117 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Olfr1468-ps1-201ENSMUST00000207287 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Gm45445-201ENSMUST00000209586 232 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Olfr902-201ENSMUST00000050733 1056 ntAPPRIS P1 BASIC1□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Olfr67-201ENSMUST00000183254 3851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Olfr1112-202ENSMUST00000216772 1443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Olfr1442-203ENSMUST00000208494 3593 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Gm23321-201ENSMUST00000104465 126 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Gm25339-201ENSMUST00000157458 232 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Gm22843-201ENSMUST00000157710 134 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Gm21959-201ENSMUST00000178439 452 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Gm37005-201ENSMUST00000193281 1164 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Smr2-202ENSMUST00000196070 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Gm42623-201ENSMUST00000197225 379 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Gm43994-201ENSMUST00000203809 227 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 AC140254.1-201ENSMUST00000220063 331 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 AC107369.1-201ENSMUST00000227373 860 ntBASIC1□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Mir5098-201ENSMUST00000175320 82 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Gm42891-201ENSMUST00000199340 281 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Olfr496-ps1-201ENSMUST00000208862 915 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Gm45616-201ENSMUST00000211711 319 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Gm34276-201ENSMUST00000222558 439 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 AC027184.1-201ENSMUST00000226991 424 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 AC124456.1-201ENSMUST00000217391 2597 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Olfr1100-202ENSMUST00000117211 2937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Mc2r-201ENSMUST00000052347 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Gm23256-201ENSMUST00000102235 110 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Vmn1r-ps86-201ENSMUST00000174052 547 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Gm23152-201ENSMUST00000175322 116 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Gm37459-202ENSMUST00000195007 563 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Olfr1141-201ENSMUST00000099846 936 ntAPPRIS P1 BASIC0.99□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Gm45265-201ENSMUST00000210852 2497 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Knl1-203ENSMUST00000099542 6525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Olfr611-202ENSMUST00000216074 2301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Gm20557-201ENSMUST00000192871 2794 ntTSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Olfr379-ps1-201ENSMUST00000117349 934 ntAPPRIS P1 BASIC0.98□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Gm11357-201ENSMUST00000119758 954 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Vmn2r-ps79-201ENSMUST00000174256 377 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Gm9830-201ENSMUST00000178509 357 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Gm38316-201ENSMUST00000194838 469 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Eif4e-205ENSMUST00000200100 729 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 CT010454.1-201ENSMUST00000225975 265 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Gm43201-201ENSMUST00000195925 3416 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Gm6486-201ENSMUST00000166202 434 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Gm3027-201ENSMUST00000167579 451 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 AC158803.1-201ENSMUST00000219495 316 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 AC147639.1-201ENSMUST00000224216 661 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Olfr470-201ENSMUST00000073059 945 ntAPPRIS P1 BASIC0.98□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Gm25409-201ENSMUST00000083764 131 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Olfr1431-202ENSMUST00000213759 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Gm9009-201ENSMUST00000117321 326 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Gm24594-201ENSMUST00000122502 99 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Obox4-ps6-201ENSMUST00000176578 724 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Gm44520-201ENSMUST00000205447 802 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Gm3442-201ENSMUST00000216808 710 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 AC116656.1-201ENSMUST00000227040 755 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Olfr8-203ENSMUST00000214952 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Gm43216-201ENSMUST00000196295 1333 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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