Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gm29610-201ENSMUST00000187749 453 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm8599-201ENSMUST00000193033 457 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Trbv11-201ENSMUST00000194354 260 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm44322-201ENSMUST00000196830 115 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 AC133189.1-201ENSMUST00000198820 140 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm43583-201ENSMUST00000199235 303 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Ccl5-201ENSMUST00000035938 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Cyp3a25-201ENSMUST00000068317 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Zfp101-204ENSMUST00000174512 3743 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Olfr235-202ENSMUST00000207969 2447 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Cftr-203ENSMUST00000115406 4341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gm15102-201ENSMUST00000118740 1502 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 4932429P05Rik-201ENSMUST00000113958 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Olfr556-203ENSMUST00000217526 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Zfp970-202ENSMUST00000108952 1569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Olfr1012-203ENSMUST00000214958 3076 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Gprc6a-201ENSMUST00000020062 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Ddx60-202ENSMUST00000093485 5989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Trpc5os-201ENSMUST00000155206 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
Rabgef1Q9JM13 Trav15-1-dv6-1-201ENSMUST00000103653 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Traj31-201ENSMUST00000103710 57 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Znrd1-201ENSMUST00000113669 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm12782-201ENSMUST00000117519 727 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm14768-201ENSMUST00000122126 678 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm26347-201ENSMUST00000157526 131 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm23901-201ENSMUST00000157570 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm23496-201ENSMUST00000157741 248 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm23474-201ENSMUST00000158884 75 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 4930570N18Rik-201ENSMUST00000159273 332 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Obox3-ps7-201ENSMUST00000176465 410 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm22348-201ENSMUST00000178674 79 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm21816-201ENSMUST00000179255 360 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm28097-201ENSMUST00000187333 366 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 4930503O07Rik-201ENSMUST00000193395 578 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm44473-201ENSMUST00000204039 152 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm44073-201ENSMUST00000204173 429 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm44816-201ENSMUST00000206666 477 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm19366-201ENSMUST00000206996 156 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm6240-201ENSMUST00000208014 473 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 AC160134.1-201ENSMUST00000213450 551 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 LOC667541-201ENSMUST00000223408 278 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Rps17-201ENSMUST00000080813 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm23041-201ENSMUST00000083868 106 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Olfr1341-203ENSMUST00000215117 4700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Olfr669-202ENSMUST00000210138 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r47-203ENSMUST00000227811 6792 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm45211-201ENSMUST00000206208 2650 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Olfr32-205ENSMUST00000215659 2998 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm38269-201ENSMUST00000194549 3298 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Olfr1501-202ENSMUST00000208493 4230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Zfp788-201ENSMUST00000045720 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Olfr844-202ENSMUST00000220268 1686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Atp1b4-201ENSMUST00000016471 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Olfr933-202ENSMUST00000216238 4475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm3239-201ENSMUST00000163525 1751 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm26500-201ENSMUST00000101867 106 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm14304-201ENSMUST00000117272 446 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm14541-201ENSMUST00000118985 157 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm14037-201ENSMUST00000120576 313 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm12478-201ENSMUST00000127709 353 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm11195-201ENSMUST00000135030 441 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm22378-201ENSMUST00000157481 111 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm24720-201ENSMUST00000157518 166 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm24348-201ENSMUST00000158710 130 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm25447-201ENSMUST00000158997 128 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm22286-201ENSMUST00000179708 107 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm19503-201ENSMUST00000187109 241 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Olfr511-ps1-201ENSMUST00000207188 217 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm45860-201ENSMUST00000212700 334 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm7422-201ENSMUST00000220115 640 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 AC122367.2-201ENSMUST00000220987 534 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm24856-201ENSMUST00000082809 107 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm25258-201ENSMUST00000083049 107 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm23454-201ENSMUST00000083332 133 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Olfr1313-202ENSMUST00000213577 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm20631-201ENSMUST00000177239 5697 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r14-204ENSMUST00000227768 7005 ntAPPRIS P2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Lin28b-201ENSMUST00000079390 5402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Olfr726-203ENSMUST00000213345 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Eda2r-201ENSMUST00000037353 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r172-201ENSMUST00000038694 9009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm38073-201ENSMUST00000195141 3665 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Slfn8-201ENSMUST00000038141 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Olfr599-202ENSMUST00000214329 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm15002-201ENSMUST00000118406 452 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm12190-201ENSMUST00000120001 187 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm23781-201ENSMUST00000157940 308 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm22177-201ENSMUST00000175002 158 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm24084-201ENSMUST00000175173 137 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm27611-201ENSMUST00000184690 108 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm6105-201ENSMUST00000200580 624 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm10445-201ENSMUST00000203521 762 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm44030-201ENSMUST00000204865 432 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm15927-204ENSMUST00000206075 372 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm17811-201ENSMUST00000206193 387 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm45209-201ENSMUST00000207122 353 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm45651-201ENSMUST00000210857 335 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Gm45879-201ENSMUST00000212521 392 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 CT485612.4-201ENSMUST00000223405 250 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
Rabgef1Q9JM13 Olfr1090-201ENSMUST00000099875 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
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