Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm23340-201ENSMUST00000158955 123 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Ptges3-ps-201ENSMUST00000160012 480 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r5-201ENSMUST00000164307 1056 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Scgb2b23-ps-202ENSMUST00000167012 516 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Prl3c1-203ENSMUST00000178072 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Gm18855-201ENSMUST00000206689 570 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Gm33501-202ENSMUST00000209983 706 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Gm45247-201ENSMUST00000210757 309 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Prl7d1-201ENSMUST00000021776 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 AC153801.1-201ENSMUST00000217904 947 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Gm16368-201ENSMUST00000222340 435 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Olfr854-201ENSMUST00000072419 948 ntAPPRIS P2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Gm25796-201ENSMUST00000082645 163 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Olfr948-202ENSMUST00000216132 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Olfr1037-203ENSMUST00000216020 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Olfr1112-202ENSMUST00000216772 1443 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Olfr594-202ENSMUST00000214051 2809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps104-201ENSMUST00000099416 1671 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Gm14623-201ENSMUST00000121398 603 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Gm14840-201ENSMUST00000122135 594 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Gm12910-201ENSMUST00000135902 724 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Gm24854-201ENSMUST00000158025 98 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Gm5929-201ENSMUST00000166883 487 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r224-201ENSMUST00000170076 897 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Prol1-201ENSMUST00000170832 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Gm27979-201ENSMUST00000185126 56 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 4921511E07Rik-201ENSMUST00000194790 827 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Gm37418-201ENSMUST00000195031 274 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Gm43316-201ENSMUST00000197252 1295 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Gm43732-201ENSMUST00000200260 511 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Olfr1479-ps1-201ENSMUST00000207752 382 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Olfr1434-203ENSMUST00000208197 1229 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 CR974485.1-201ENSMUST00000222408 402 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Gm22978-201ENSMUST00000082607 160 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r78-202ENSMUST00000228244 7931 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 AL645643.1-201ENSMUST00000222438 3897 ntBASIC1.9□□□□□ -2.1
Col5a3Q9JLI2 Trbv3-201ENSMUST00000103264 455 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Igkv6-13-201ENSMUST00000103395 287 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm14882-201ENSMUST00000117216 218 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm15282-201ENSMUST00000117707 300 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm14292-201ENSMUST00000118761 456 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm16100-201ENSMUST00000120489 231 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm22083-201ENSMUST00000157586 102 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm24174-201ENSMUST00000158933 111 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm17065-201ENSMUST00000165245 239 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm17161-201ENSMUST00000169187 524 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm27155-201ENSMUST00000183716 898 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Mir7052-201ENSMUST00000184821 65 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Igkv13-76-201ENSMUST00000197621 347 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Crs-ps-201ENSMUST00000203723 760 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm45273-201ENSMUST00000211559 281 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Fcf1-201ENSMUST00000021669 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 AL645546.2-201ENSMUST00000224526 265 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm26064-201ENSMUST00000083381 109 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm23850-201ENSMUST00000083830 169 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm19965-201ENSMUST00000179777 3030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Snord71-201ENSMUST00000104361 85 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm13913-201ENSMUST00000121126 260 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm22563-201ENSMUST00000157333 269 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Scarna3b-201ENSMUST00000157533 139 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm27656-201ENSMUST00000185055 80 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm29492-201ENSMUST00000187124 457 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm19123-201ENSMUST00000190716 651 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm5731-201ENSMUST00000190969 481 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Olfr1488-ps1-201ENSMUST00000207436 136 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Olfr274-ps1-201ENSMUST00000216601 595 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm46312-201ENSMUST00000220961 420 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 AC158388.1-201ENSMUST00000225441 256 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm22494-201ENSMUST00000104495 128 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm2066-201ENSMUST00000118046 389 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm2318-201ENSMUST00000119623 639 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm2005-201ENSMUST00000120759 542 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm16363-201ENSMUST00000132460 877 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Klra17-201ENSMUST00000014687 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm22516-201ENSMUST00000158266 124 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm23476-201ENSMUST00000158881 274 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm5168-202ENSMUST00000168002 636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm14819-202ENSMUST00000169396 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm10487-201ENSMUST00000177566 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm7438-201ENSMUST00000177664 639 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm14632-202ENSMUST00000177917 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm7408-201ENSMUST00000178014 639 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm7386-201ENSMUST00000178020 639 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm10058-202ENSMUST00000178152 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm3657-201ENSMUST00000178170 639 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm7415-201ENSMUST00000178205 639 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm7398-201ENSMUST00000178589 639 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm10096-201ENSMUST00000178672 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm7391-201ENSMUST00000178680 639 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm10230-202ENSMUST00000178745 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm2092-201ENSMUST00000178887 639 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm10147-202ENSMUST00000178966 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm5935-202ENSMUST00000178986 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm7375-201ENSMUST00000179232 639 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm2759-201ENSMUST00000179938 639 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm3681-201ENSMUST00000179940 639 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm29347-201ENSMUST00000186695 449 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm37005-201ENSMUST00000193281 1164 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 CAAA01052029.1-201ENSMUST00000218410 271 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Col5a3Q9JLI2 Gm35101-201ENSMUST00000219218 243 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
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