Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Gm37167-201ENSMUST00000194946 396 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Mir3969-201ENSMUST00000197106 92 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Gm30928-202ENSMUST00000206881 271 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Olfr1217-202ENSMUST00000213669 3839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 AC123944.2-201ENSMUST00000215290 382 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Scml2-203ENSMUST00000077375 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Gm6145-206ENSMUST00000211251 2850 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Olfr78-204ENSMUST00000217123 4695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Pum2-209ENSMUST00000168361 6226 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Gm19950-204ENSMUST00000208167 4196 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Chd9-202ENSMUST00000109614 11565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 AC162908.1-201ENSMUST00000219164 4563 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Olfr1467-202ENSMUST00000215096 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 AC113059.3-201ENSMUST00000217423 2777 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Gm6162-201ENSMUST00000194870 2930 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Olfr893-202ENSMUST00000211975 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Gm45304-201ENSMUST00000210303 2828 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Olfr124-202ENSMUST00000215168 4497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Senp7-203ENSMUST00000089362 4825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Pign-206ENSMUST00000187537 4006 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Snord64-201ENSMUST00000104003 67 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Gm12125-201ENSMUST00000117261 736 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Gm12854-201ENSMUST00000128518 297 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Gm12150-201ENSMUST00000130874 468 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Gm22729-201ENSMUST00000158088 129 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Gm24084-201ENSMUST00000175173 137 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Gm20643-201ENSMUST00000177284 322 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Gm3086-202ENSMUST00000221248 310 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Gm35732-201ENSMUST00000221737 356 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Gm7665-201ENSMUST00000076710 297 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Gm23928-201ENSMUST00000082469 145 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Gm22454-201ENSMUST00000082583 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Gm25139-201ENSMUST00000083247 210 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Gm26314-201ENSMUST00000083891 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Olfr606-202ENSMUST00000214631 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Acsm3-204ENSMUST00000106528 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Slc22a30-203ENSMUST00000120540 2598 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Olfr733-204ENSMUST00000216195 3669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Vmn2r1-201ENSMUST00000029406 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Bmp15-201ENSMUST00000024049 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Vmn1r175-202ENSMUST00000228383 2878 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 F13a1-201ENSMUST00000037491 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 9430025C20Rik-201ENSMUST00000068663 2115 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Glcci1-203ENSMUST00000161494 3248 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Gm42600-201ENSMUST00000202081 3588 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Ktn1-209ENSMUST00000187262 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Rnf213-202ENSMUST00000131035 16716 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Olfr129-202ENSMUST00000216476 5275 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Gm43197-201ENSMUST00000201493 2583 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Atp7a-201ENSMUST00000055941 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Gucy2f-201ENSMUST00000042530 8122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Ktn1-207ENSMUST00000186761 3902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Ccr5-202ENSMUST00000111442 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Igkv10-94-201ENSMUST00000103330 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Ighv16-1-201ENSMUST00000103470 299 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Trav16d-dv11-201ENSMUST00000103606 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Gm23577-201ENSMUST00000103950 110 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Gm15772-201ENSMUST00000118533 438 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Gm11718-201ENSMUST00000119942 537 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Gm23788-201ENSMUST00000122535 106 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Gm23184-201ENSMUST00000122594 131 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Gm25621-201ENSMUST00000157223 114 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Gm22215-201ENSMUST00000157558 96 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Gm22326-201ENSMUST00000158897 351 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Vmn2r-ps58-201ENSMUST00000173044 242 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Gm22411-201ENSMUST00000175462 126 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Gm22002-201ENSMUST00000175622 125 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Gm24520-201ENSMUST00000179510 110 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Gm27365-201ENSMUST00000184041 177 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Rpl18a-ps2-201ENSMUST00000197158 174 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Gm42542-201ENSMUST00000197978 268 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 N4bp2os-201ENSMUST00000201547 235 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 CT030170.6-201ENSMUST00000221149 550 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 AC126939.3-201ENSMUST00000226061 166 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 AC165953.1-201ENSMUST00000226386 357 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Dph3b-ps-201ENSMUST00000076359 246 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Gm23302-201ENSMUST00000082710 100 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 n-R5s62-201ENSMUST00000082780 96 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Olfr361-203ENSMUST00000216663 2617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Rgsl1-201ENSMUST00000124558 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Olfr365-202ENSMUST00000213969 5333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Kcnt2-203ENSMUST00000120796 3540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Utp14b-201ENSMUST00000053760 7393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Fgf14-202ENSMUST00000095529 3608 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Gm45129-201ENSMUST00000208444 2224 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Atf2-207ENSMUST00000112017 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Traj50-201ENSMUST00000103693 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Gm6071-201ENSMUST00000119561 440 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Gm11644-201ENSMUST00000119735 150 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Gm11785-201ENSMUST00000120165 601 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 n-R5s192-201ENSMUST00000122577 119 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Gm29104-201ENSMUST00000186304 222 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Slamf7-203ENSMUST00000192195 3975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Gm42666-201ENSMUST00000201954 152 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Gm44199-201ENSMUST00000205219 739 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Gm44583-201ENSMUST00000207478 281 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Chrnb3-203ENSMUST00000211104 3241 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 Gm16419-201ENSMUST00000221057 625 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 AC157772.2-201ENSMUST00000228202 259 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Irx5Q9JKQ4 AC127371.1-202ENSMUST00000228923 306 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.8 ms