Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Rgs13-202ENSMUST00000111941 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Olfr776-202ENSMUST00000213512 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Ranbp2-201ENSMUST00000003310 9608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Olfr135-202ENSMUST00000213217 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Tlr3-202ENSMUST00000167106 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Slc16a7-206ENSMUST00000211781 10981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Snord116l9-201ENSMUST00000101891 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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Cldn19Q9ET38 Gm9850-201ENSMUST00000117916 227 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm2066-201ENSMUST00000118046 389 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm14292-201ENSMUST00000118761 456 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm12042-201ENSMUST00000120479 301 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm25621-201ENSMUST00000157223 114 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Eif3s6-ps2-201ENSMUST00000163304 219 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm5168-202ENSMUST00000168002 636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm2930-201ENSMUST00000170403 474 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm20513-201ENSMUST00000174074 537 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
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Cldn19Q9ET38 Gm25350-201ENSMUST00000177849 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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Cldn19Q9ET38 Gm23446-201ENSMUST00000177977 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Snord116l4-201ENSMUST00000177982 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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Cldn19Q9ET38 Gm24711-201ENSMUST00000178062 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm24609-201ENSMUST00000178166 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm23265-201ENSMUST00000178321 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm22812-201ENSMUST00000178329 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Snord116l3-201ENSMUST00000178370 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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Cldn19Q9ET38 Gm24760-201ENSMUST00000178530 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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Cldn19Q9ET38 Snord116l2-201ENSMUST00000178675 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm26270-201ENSMUST00000178690 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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Cldn19Q9ET38 Gm23313-201ENSMUST00000178931 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Snord116l17-201ENSMUST00000178936 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm23089-201ENSMUST00000178947 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm5935-202ENSMUST00000178986 639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm24897-201ENSMUST00000179033 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Snord116l10-201ENSMUST00000179053 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm24153-201ENSMUST00000179280 94 ntBASIC2.55□□□□□ -2
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Cldn19Q9ET38 Gm21028-201ENSMUST00000179470 123 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
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Cldn19Q9ET38 Olfr1206-202ENSMUST00000216950 3303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 AC162910.1-201ENSMUST00000221219 1723 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 AC154506.1-201ENSMUST00000225178 621 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 AC137902.2-201ENSMUST00000227989 576 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 S100a11-201ENSMUST00000029515 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 mt-Co2-201ENSMUST00000082405 684 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Olfr1477-202ENSMUST00000217001 4000 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm44679-201ENSMUST00000207202 2908 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Zfp984-201ENSMUST00000105734 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Zfp979-201ENSMUST00000037565 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.55□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm4224-201ENSMUST00000211557 1594 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Hormad1-202ENSMUST00000090797 1511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm7237-201ENSMUST00000148435 1401 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Mir682-201ENSMUST00000102281 96 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm13329-201ENSMUST00000117063 265 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm12814-201ENSMUST00000117091 846 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm15399-201ENSMUST00000118055 724 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm11456-201ENSMUST00000121070 256 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 1700119I11Rik-201ENSMUST00000122270 336 ntTSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm23118-201ENSMUST00000122657 187 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm25808-201ENSMUST00000122784 284 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm24922-201ENSMUST00000158511 102 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm25365-201ENSMUST00000158852 121 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Tcrg-C3-201ENSMUST00000164407 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm24757-201ENSMUST00000176987 371 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm27659-201ENSMUST00000183472 98 ntBASIC2.54□□□□□ -2
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Cldn19Q9ET38 Gm44476-201ENSMUST00000196225 91 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm42665-201ENSMUST00000202100 586 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm45687-201ENSMUST00000209454 155 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm45427-201ENSMUST00000209572 1253 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm45678-201ENSMUST00000210509 295 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Cldn19Q9ET38 Gm33680-201ENSMUST00000219336 576 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
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