Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm20869-201ENSMUST00000188958 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm21173-201ENSMUST00000189238 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm20870-201ENSMUST00000189315 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm20903-201ENSMUST00000189346 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm21209-202ENSMUST00000189354 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm20937-203ENSMUST00000189422 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm21497-201ENSMUST00000189455 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm20843-202ENSMUST00000191305 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 AL772271.1-201ENSMUST00000196848 65 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm19395-201ENSMUST00000219618 646 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 1700011B04Rik-211ENSMUST00000222690 394 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Mir423-201ENSMUST00000083584 109 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Vmn1r28-202ENSMUST00000227805 10892 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm24060-201ENSMUST00000157494 95 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm26349-201ENSMUST00000157530 130 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm5916-201ENSMUST00000168452 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm17727-201ENSMUST00000171898 643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Vmn1r-ps86-201ENSMUST00000174052 547 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm27522-201ENSMUST00000183949 230 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm45023-201ENSMUST00000207951 379 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Olfr1324-203ENSMUST00000219631 1152 ntAPPRIS P2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Olfr1324-201ENSMUST00000050044 1152 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Olfr914-201ENSMUST00000057755 951 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Olfr385-201ENSMUST00000071553 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Olfr143-202ENSMUST00000213129 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm37566-201ENSMUST00000192363 4355 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Mir667-201ENSMUST00000102441 92 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Mir1192-201ENSMUST00000116976 121 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm26713-201ENSMUST00000181827 627 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm29009-201ENSMUST00000186340 496 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm29740-201ENSMUST00000193182 655 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm6135-201ENSMUST00000198726 372 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm44727-201ENSMUST00000204225 451 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm7675-201ENSMUST00000208828 686 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Olfr496-ps1-201ENSMUST00000208862 915 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 1700111E14Rik-201ENSMUST00000031863 908 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Olfr1008-201ENSMUST00000054868 942 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 AC115047.2-201ENSMUST00000214421 1848 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm14823-201ENSMUST00000117698 238 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm9225-201ENSMUST00000121921 836 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm13782-201ENSMUST00000149515 352 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm26101-201ENSMUST00000157246 105 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm17655-201ENSMUST00000167969 255 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm8161-201ENSMUST00000168739 481 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm22131-201ENSMUST00000178415 94 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm25120-201ENSMUST00000180148 79 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Obox4-ps3-201ENSMUST00000183474 520 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm37732-201ENSMUST00000194377 316 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm44300-201ENSMUST00000196792 121 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Gm44533-201ENSMUST00000207782 268 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Vmn1r78-203ENSMUST00000228664 8100 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Olfr389-203ENSMUST00000215418 3417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 AW554918-203ENSMUST00000100131 1684 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
OtofQ9ESF1 Olfr722-201ENSMUST00000053290 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.09
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OtofQ9ESF1 Vma21-ps-201ENSMUST00000114578 306 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
OtofQ9ESF1 Gm15760-201ENSMUST00000119553 283 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
OtofQ9ESF1 Gm8080-201ENSMUST00000122046 1155 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
OtofQ9ESF1 Vmn2r-ps62-201ENSMUST00000174119 616 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
OtofQ9ESF1 Mir6352-201ENSMUST00000184495 116 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
OtofQ9ESF1 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
OtofQ9ESF1 Gm37979-201ENSMUST00000193065 712 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
OtofQ9ESF1 Gm37579-201ENSMUST00000194291 142 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
OtofQ9ESF1 Olfr1142-ps1-201ENSMUST00000213624 805 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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OtofQ9ESF1 AC140451.2-202ENSMUST00000226156 574 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
OtofQ9ESF1 Vmn1r85-201ENSMUST00000094829 927 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
OtofQ9ESF1 Olfr1467-202ENSMUST00000215096 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
OtofQ9ESF1 A930027P06Rik-201ENSMUST00000221298 2975 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
OtofQ9ESF1 Olfr835-202ENSMUST00000213018 2690 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
OtofQ9ESF1 Arhgap5-202ENSMUST00000217820 2332 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
OtofQ9ESF1 Gm13359-201ENSMUST00000119000 695 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
OtofQ9ESF1 Gm12721-201ENSMUST00000120621 268 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
OtofQ9ESF1 1700046C09Rik-201ENSMUST00000139973 543 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
OtofQ9ESF1 Gm22099-201ENSMUST00000157925 123 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
OtofQ9ESF1 AU040972-201ENSMUST00000165610 1042 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
OtofQ9ESF1 Mir6402-201ENSMUST00000183406 80 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
OtofQ9ESF1 Gm43562-201ENSMUST00000196439 238 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
OtofQ9ESF1 Gm44478-201ENSMUST00000204875 114 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
OtofQ9ESF1 AC147256.1-201ENSMUST00000221589 626 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
OtofQ9ESF1 Snora69-201ENSMUST00000083708 131 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
OtofQ9ESF1 Tas2r140-201ENSMUST00000095391 1000 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
OtofQ9ESF1 Gm4855-201ENSMUST00000192270 1967 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
OtofQ9ESF1 Gm15314-201ENSMUST00000120740 1887 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
OtofQ9ESF1 Olfr561-202ENSMUST00000213432 2498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
OtofQ9ESF1 Olfr1218-202ENSMUST00000213609 3760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
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