Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Scgb2b23-ps-202ENSMUST00000167012 516 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Gm20794-201ENSMUST00000177626 628 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Gm21776-201ENSMUST00000177676 1083 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Gm21095-201ENSMUST00000177775 498 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Gm20916-201ENSMUST00000178063 498 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Gm21760-201ENSMUST00000179811 498 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Gm21477-201ENSMUST00000179970 498 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Gm21117-201ENSMUST00000180133 498 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Gm20855-201ENSMUST00000180170 498 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Gm20931-201ENSMUST00000180249 498 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Gm20896-201ENSMUST00000180332 498 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Snhg14-203ENSMUST00000185815 670 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Gm28356-202ENSMUST00000187566 858 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Gm20885-201ENSMUST00000190192 654 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Gm36866-201ENSMUST00000193343 657 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Gm36047-201ENSMUST00000193659 657 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Gm20857-201ENSMUST00000194766 657 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Gm20858-201ENSMUST00000195459 657 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Igkv13-73-1-201ENSMUST00000196767 200 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Mir5121-201ENSMUST00000198528 74 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Olfr638-202ENSMUST00000218325 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Gm21007-201ENSMUST00000221024 326 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 AC154271.1-201ENSMUST00000224780 383 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Pdcd10-201ENSMUST00000029424 907 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Gm22247-201ENSMUST00000082476 131 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Gm22979-201ENSMUST00000082609 159 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Gm23249-201ENSMUST00000083369 161 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Pak3-203ENSMUST00000112864 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Vmn1r87-202ENSMUST00000211249 1835 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Olfr896-ps1-202ENSMUST00000215219 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Olfr235-203ENSMUST00000214551 2240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Tlr3-202ENSMUST00000167106 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Omd-201ENSMUST00000065494 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Gm14172-201ENSMUST00000118255 644 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Gm14835-201ENSMUST00000119039 315 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Olfr1103-ps1-201ENSMUST00000119132 937 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Mup-ps10-201ENSMUST00000119626 556 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Gm14982-201ENSMUST00000121102 442 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Gm25102-201ENSMUST00000122479 112 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Gm26424-201ENSMUST00000122530 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Rps15a-ps5-201ENSMUST00000132586 393 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Gm23540-201ENSMUST00000157543 164 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Gm22840-201ENSMUST00000158444 136 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Gm23476-201ENSMUST00000158881 274 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Agmo-205ENSMUST00000160768 741 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Vmn1r77-201ENSMUST00000164446 921 ntAPPRIS P2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Tshb-202ENSMUST00000170856 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Vmn2r-ps58-201ENSMUST00000173044 242 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Gm22716-201ENSMUST00000177596 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Gm27330-201ENSMUST00000184689 132 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Gm36984-201ENSMUST00000192770 235 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Gm43617-201ENSMUST00000196418 606 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Gm42825-201ENSMUST00000198883 723 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Olfr795-ps1-201ENSMUST00000205245 763 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Gm44927-201ENSMUST00000207573 716 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Gm4036-201ENSMUST00000220842 626 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 AC192616.1-201ENSMUST00000221922 132 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 AC155305.1-201ENSMUST00000222207 319 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 AC174797.3-202ENSMUST00000224578 587 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 AC113031.5-201ENSMUST00000227116 606 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 AC166369.1-201ENSMUST00000228126 351 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Tas2r107-201ENSMUST00000065781 1032 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Mir132-201ENSMUST00000083603 66 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Gm24490-201ENSMUST00000083803 98 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Gm25257-201ENSMUST00000083907 110 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Gm37320-201ENSMUST00000192781 4953 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Olfr1097-201ENSMUST00000111576 4705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Tlr3-201ENSMUST00000034056 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Olfr201-202ENSMUST00000216834 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Olfr1033-202ENSMUST00000213865 3664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Vmn1r29-204ENSMUST00000228038 4520 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Cyp3a41a-201ENSMUST00000094111 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Gm14445-201ENSMUST00000117051 1484 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Trbj1-4-201ENSMUST00000103287 51 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Rpl30-ps10-201ENSMUST00000117119 347 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Rpl30-ps3-201ENSMUST00000117928 348 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Gm12191-201ENSMUST00000118307 348 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Gm15497-201ENSMUST00000119137 551 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Gm9703-201ENSMUST00000119573 343 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Rpl30-ps11-201ENSMUST00000119630 345 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Rpl30-ps1-201ENSMUST00000119767 348 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Gm12723-201ENSMUST00000120700 451 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Gm12006-201ENSMUST00000120786 403 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Gm13356-201ENSMUST00000121678 335 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Gm16411-201ENSMUST00000122164 1100 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Gm2830-201ENSMUST00000140330 385 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Gm24910-201ENSMUST00000157289 272 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Gm8338-201ENSMUST00000163928 363 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Olfr756-ps1-201ENSMUST00000173450 928 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Mir3104-201ENSMUST00000174911 63 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Gm26141-201ENSMUST00000175299 126 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Gm26061-201ENSMUST00000175584 108 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Gm21744-201ENSMUST00000178403 662 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Gm24713-201ENSMUST00000178850 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Gm21171-201ENSMUST00000180048 673 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Gm25448-201ENSMUST00000180065 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Rpl31-ps15-201ENSMUST00000181857 375 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Obox4-ps39-201ENSMUST00000184306 628 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Snx5Q9D8U8 Mir6899-201ENSMUST00000184798 64 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.8 ms