Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 AC134420.1-201ENSMUST00000227027 289 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Olfr474-201ENSMUST00000054434 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Gm4987-201ENSMUST00000078326 408 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Gm26107-201ENSMUST00000083972 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Fbxw21-201ENSMUST00000054925 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 B020011L13Rik-201ENSMUST00000188801 2879 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 4930533N22Rik-201ENSMUST00000206433 3509 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Gm11782-201ENSMUST00000131675 2804 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1234-203ENSMUST00000137692 3827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Gm43736-201ENSMUST00000196377 2281 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Vmn2r49-201ENSMUST00000108550 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Vmn2r47-201ENSMUST00000170131 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Gm3584-201ENSMUST00000173822 2565 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Gm15902-202ENSMUST00000219623 3477 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Scai-201ENSMUST00000038874 10709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Fam71d-205ENSMUST00000219551 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Gm45848-201ENSMUST00000212932 1871 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Neb-203ENSMUST00000075301 21456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Gm24987-201ENSMUST00000104453 134 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Gm10563-201ENSMUST00000115821 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Gm24831-201ENSMUST00000116778 126 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Gm14355-201ENSMUST00000117352 264 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Gm14001-201ENSMUST00000118847 247 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Gm11429-201ENSMUST00000119089 144 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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Pggt1bQ8BUY9 Gm15142-201ENSMUST00000121013 856 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Gm11229-201ENSMUST00000121993 437 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Gm14333-201ENSMUST00000130484 264 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Ssxb6-201ENSMUST00000138642 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Gm21814-201ENSMUST00000144085 291 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 4930511O05Rik-201ENSMUST00000155912 391 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Gm22722-201ENSMUST00000157467 132 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Gm23755-201ENSMUST00000157578 343 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Gm22833-201ENSMUST00000158292 132 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Gt(ROSA)26Sor-204ENSMUST00000167415 551 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Vmn1r-ps31-201ENSMUST00000174112 238 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Spin2g-201ENSMUST00000178425 687 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Gm21978-201ENSMUST00000179696 377 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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Pggt1bQ8BUY9 Gm28930-201ENSMUST00000189525 437 ntTSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
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Pggt1bQ8BUY9 AL450317.1-201ENSMUST00000213941 291 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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Pggt1bQ8BUY9 AC121966.1-201ENSMUST00000221458 282 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
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Pggt1bQ8BUY9 Hamp-201ENSMUST00000062620 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
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Pggt1bQ8BUY9 Vmn2r90-201ENSMUST00000169805 2592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1226-204ENSMUST00000215987 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
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Pggt1bQ8BUY9 Gm35835-202ENSMUST00000216984 3350 ntTSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Thoc1-201ENSMUST00000025137 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
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Pggt1bQ8BUY9 Gm5358-201ENSMUST00000212814 353 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
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Pggt1bQ8BUY9 CT571268.1-201ENSMUST00000222320 407 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 AC154788.1-201ENSMUST00000225003 340 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 AC118639.1-201ENSMUST00000227204 338 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Gm5416-201ENSMUST00000089628 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Olfr561-201ENSMUST00000098217 1071 ntAPPRIS P1 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Postn-203ENSMUST00000107985 3205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 4930467E23Rik-201ENSMUST00000098909 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Olfr1309-202ENSMUST00000214537 4274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Gm5362-201ENSMUST00000211968 3085 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Vmn2r23-201ENSMUST00000172391 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 AC155830.1-201ENSMUST00000220050 3836 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
Pggt1bQ8BUY9 Glra2-201ENSMUST00000058787 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
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