Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21497-201ENSMUST00000189455 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20890-201ENSMUST00000189518 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21477-202ENSMUST00000189543 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 2810025M15Rik-203ENSMUST00000189791 251 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29110-201ENSMUST00000189924 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20814-201ENSMUST00000190173 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29573-201ENSMUST00000190291 919 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 Sly-202ENSMUST00000190292 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21650-202ENSMUST00000190551 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20905-201ENSMUST00000190782 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20817-201ENSMUST00000191123 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20843-202ENSMUST00000191305 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21258-202ENSMUST00000191553 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29866-201ENSMUST00000191675 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm31571-201ENSMUST00000192521 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21366-201ENSMUST00000192892 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43096-201ENSMUST00000196173 421 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm19253-201ENSMUST00000204279 307 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 Klra13-ps-204ENSMUST00000205252 640 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
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Ccdc88cQ6VGS5 Eif1-ps2-201ENSMUST00000221990 339 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 AC168062.3-201ENSMUST00000227025 165 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 mt-Co2-201ENSMUST00000082405 684 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11228-201ENSMUST00000143796 2013 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 Tlr7-202ENSMUST00000112161 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr594-202ENSMUST00000214051 2809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm38255-201ENSMUST00000194910 2996 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1177-ps-202ENSMUST00000216713 2821 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm11898-201ENSMUST00000117161 385 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm16412-201ENSMUST00000121602 273 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm14707-201ENSMUST00000152793 398 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 Mir1927-201ENSMUST00000158579 109 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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Ccdc88cQ6VGS5 Esp8-201ENSMUST00000171813 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm43675-201ENSMUST00000199468 1184 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm37566-201ENSMUST00000192363 4355 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm22208-201ENSMUST00000122658 110 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm2930-201ENSMUST00000170403 474 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr180-201ENSMUST00000171656 1154 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr306-ps1-201ENSMUST00000174677 743 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm21894-201ENSMUST00000179631 546 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm27233-201ENSMUST00000184030 307 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18667-201ENSMUST00000186523 484 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm20896-202ENSMUST00000188585 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43468-201ENSMUST00000199769 397 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 AC121844.1-201ENSMUST00000218706 137 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm34276-201ENSMUST00000222558 439 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 AC154484.1-201ENSMUST00000227311 771 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r75-201ENSMUST00000057229 918 ntAPPRIS P2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 Tas2r124-201ENSMUST00000076150 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 Stfa2l1-201ENSMUST00000079184 414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 Gm23448-201ENSMUST00000083151 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccdc88cQ6VGS5 1700017N19Rik-207ENSMUST00000190708 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
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