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| Cntn4 | Q69Z26 | Gm38083-201 | ENSMUST00000194758 | 3498 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| Cntn4 | Q69Z26 | AC153526.2-201 | ENSMUST00000218206 | 2031 nt | BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| Cntn4 | Q69Z26 | Trbv5-201 | ENSMUST00000103266 | 368 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
| Cntn4 | Q69Z26 | 2010106E10Rik-202 | ENSMUST00000113412 | 1276 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.85 | □□□□□ -1.95 | | |
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| Cntn4 | Q69Z26 | AC115891.1-201 | ENSMUST00000215798 | 1755 nt | BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
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| Cntn4 | Q69Z26 | Gm22974-201 | ENSMUST00000083301 | 103 nt | BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.95 | | |
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| Cntn4 | Q69Z26 | Vmn1r82-203 | ENSMUST00000227672 | 3651 nt | BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.96 | | |
| Cntn4 | Q69Z26 | Olfr1448-202 | ENSMUST00000213177 | 3979 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.96 | | |
| Cntn4 | Q69Z26 | AC164164.1-201 | ENSMUST00000223245 | 2340 nt | BASIC | 2.84 | □□□□□ -1.96 | | |
| Cntn4 | Q69Z26 | Gm22939-201 | ENSMUST00000103958 | 131 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
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| Cntn4 | Q69Z26 | Gm11352-201 | ENSMUST00000119264 | 517 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
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| Cntn4 | Q69Z26 | Gm24306-201 | ENSMUST00000180229 | 79 nt | BASIC | 2.83 | □□□□□ -1.96 | | |
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| Cntn4 | Q69Z26 | Gm38382-201 | ENSMUST00000193790 | 2499 nt | BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |
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| Cntn4 | Q69Z26 | Gm22023-201 | ENSMUST00000104354 | 130 nt | BASIC | 2.82 | □□□□□ -1.96 | | |