Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Gm24234-201ENSMUST00000104316 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Cldn34-ps-201ENSMUST00000145498 600 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Gm23312-201ENSMUST00000158774 102 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Gm24664-201ENSMUST00000158939 100 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 1700027A15Rik-203ENSMUST00000188793 423 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Gm38180-201ENSMUST00000192381 395 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Gm44485-201ENSMUST00000199569 137 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Zfp85-202ENSMUST00000144183 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Gm29325-201ENSMUST00000190705 2528 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Gm43164-201ENSMUST00000202529 2128 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Abi3bp-202ENSMUST00000096012 4387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Olfr1191-ps1-201ENSMUST00000120598 4677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Adam5-205ENSMUST00000209935 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Vmn2r100-201ENSMUST00000166081 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Olfr1200-202ENSMUST00000217588 4996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Olfr270-201ENSMUST00000095084 2204 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Olfr164-202ENSMUST00000216157 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Pfpl-201ENSMUST00000168148 3918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Gm45235-201ENSMUST00000208016 4465 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Gm11931-201ENSMUST00000121630 447 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Gm15962-201ENSMUST00000124184 750 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Gm22315-201ENSMUST00000158010 143 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Gm3851-201ENSMUST00000168653 318 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Gm27940-201ENSMUST00000184449 98 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Mir376a-201ENSMUST00000197584 68 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 AC091783.5-201ENSMUST00000224928 671 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 AC115735.2-201ENSMUST00000227135 351 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Gm43010-201ENSMUST00000195993 2878 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 BC003331-204ENSMUST00000097547 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Inpp4b-209ENSMUST00000172031 8067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Gm5615-201ENSMUST00000098900 2348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Gm42659-201ENSMUST00000196955 1754 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 CT025577.1-201ENSMUST00000220862 2846 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Vmn1r195-202ENSMUST00000228711 3056 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Obscn-202ENSMUST00000047441 24175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Epha7-201ENSMUST00000029964 6746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Acer3-201ENSMUST00000033020 11340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 A830019L24Rik-201ENSMUST00000197226 1652 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Slfn10-ps-201ENSMUST00000100716 3621 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Nlrp4f-204ENSMUST00000221659 3551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Vmn1r52-207ENSMUST00000228394 3069 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Cftr-201ENSMUST00000045706 6303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Olfr875-202ENSMUST00000215128 2039 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Klhl13-201ENSMUST00000035973 2996 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 4930579C12Rik-202ENSMUST00000187015 3676 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Elavl2-202ENSMUST00000102799 3840 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Gm23319-201ENSMUST00000104467 131 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Rps15a-ps8-201ENSMUST00000117914 387 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Gm12640-201ENSMUST00000120097 310 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Gm16351-201ENSMUST00000142008 250 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Gm22321-201ENSMUST00000157152 104 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Gm25224-201ENSMUST00000158195 68 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Gm17100-201ENSMUST00000168963 272 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Gm13249-201ENSMUST00000177803 345 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Gm13144-201ENSMUST00000179385 345 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Gm26701-201ENSMUST00000181571 234 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Gm4035-202ENSMUST00000190684 526 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Gm7182-201ENSMUST00000193351 732 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Gm37636-201ENSMUST00000193583 359 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Hcfc1r1-ps2-201ENSMUST00000199379 339 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 AC132344.1-201ENSMUST00000221289 376 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Gm26457-201ENSMUST00000082678 78 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Mir338-201ENSMUST00000083666 98 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Mapk10-204ENSMUST00000112848 6761 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Olfr1311-202ENSMUST00000213602 2631 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Gm43009-201ENSMUST00000199979 3566 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Olfr1223-201ENSMUST00000217342 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Gcc2-208ENSMUST00000162860 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Gm26500-201ENSMUST00000101867 106 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Igkv6-13-201ENSMUST00000103395 287 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Gm23709-201ENSMUST00000104364 130 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Gm13096-201ENSMUST00000127752 251 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Gm23466-201ENSMUST00000157133 106 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Gm23743-201ENSMUST00000157389 274 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Gm22531-201ENSMUST00000158819 140 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Gm1992-201ENSMUST00000161581 250 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Gm17186-201ENSMUST00000171742 456 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Gm23638-201ENSMUST00000175073 126 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Gm23158-201ENSMUST00000175076 126 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Gm27896-201ENSMUST00000175162 317 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Gm22907-201ENSMUST00000175198 126 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Gm22625-201ENSMUST00000175382 126 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Gm22875-201ENSMUST00000175449 126 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Gm25197-201ENSMUST00000175516 126 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Gm27857-201ENSMUST00000176930 126 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Gm26268-201ENSMUST00000177685 126 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Gm23681-201ENSMUST00000178821 126 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Gm27233-201ENSMUST00000184030 307 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Gm37601-201ENSMUST00000194922 394 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Gm18991-201ENSMUST00000209225 746 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Gm45778-201ENSMUST00000211959 153 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Gm7065-201ENSMUST00000222150 474 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 AC173345.2-201ENSMUST00000222795 153 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 AC183092.1-201ENSMUST00000224301 153 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 n-R5s7-201ENSMUST00000083755 121 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Vmn2r101-201ENSMUST00000171914 2574 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Olfr1331-203ENSMUST00000216589 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Olfr351-202ENSMUST00000213676 3426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Gm609-201ENSMUST00000114585 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Clcn1Q64347 Olfr556-203ENSMUST00000217526 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.5 ms