Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 4930555M17Rik-201ENSMUST00000176666 402 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm8906-202ENSMUST00000179375 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Ifi213-205ENSMUST00000180215 643 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm27374-201ENSMUST00000183660 81 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm29296-201ENSMUST00000188146 320 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 2610044O15Rik8-203ENSMUST00000188757 413 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm44609-201ENSMUST00000207157 460 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm39147-201ENSMUST00000211376 465 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1086-202ENSMUST00000213198 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1064-ps1-201ENSMUST00000213670 600 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm46194-201ENSMUST00000218136 320 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 AC139376.1-201ENSMUST00000220056 1250 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 AC124489.2-201ENSMUST00000223930 589 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 AC115289.1-201ENSMUST00000224915 522 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 AC167669.1-201ENSMUST00000224932 384 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 AC118639.1-201ENSMUST00000227204 338 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Sprr2i-201ENSMUST00000047264 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Olfr474-201ENSMUST00000054434 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Stfa3-201ENSMUST00000068182 412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Ifi208-201ENSMUST00000085876 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Olfr629-202ENSMUST00000213906 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Samd9l-201ENSMUST00000120087 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm3239-201ENSMUST00000163525 1751 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Rictor-201ENSMUST00000061656 9312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Vmn1r79-203ENSMUST00000227530 5581 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Olfr986-203ENSMUST00000216720 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm2026-201ENSMUST00000109007 1621 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Pak3-205ENSMUST00000112868 8163 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Igkv3-7-201ENSMUST00000103399 299 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Trav6-7-dv9-201ENSMUST00000103638 379 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Traj24-201ENSMUST00000103717 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm12805-201ENSMUST00000117305 1048 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm14670-201ENSMUST00000117327 337 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm13331-201ENSMUST00000117500 448 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm11253-201ENSMUST00000118486 201 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm14008-201ENSMUST00000120483 274 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm14581-201ENSMUST00000121726 198 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm14271-201ENSMUST00000137886 630 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm23078-201ENSMUST00000157848 148 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm22766-201ENSMUST00000158372 99 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Klra5-204ENSMUST00000169901 792 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm20462-201ENSMUST00000172623 408 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Vmn1r-ps15-201ENSMUST00000177365 910 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm28072-202ENSMUST00000190486 352 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm36816-202ENSMUST00000205197 504 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm45427-201ENSMUST00000209572 1253 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Scoc-204ENSMUST00000212449 280 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 AC153141.1-201ENSMUST00000218636 501 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 AC155241.1-201ENSMUST00000222709 415 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 AC134254.5-201ENSMUST00000223436 400 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 AC123656.2-201ENSMUST00000226726 227 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 AC108416.2-201ENSMUST00000226792 367 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 AC122341.1-201ENSMUST00000227291 560 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm25792-201ENSMUST00000083289 100 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm23848-201ENSMUST00000083826 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1156-201ENSMUST00000099842 1076 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
Ssbp4Q3U4B1 Gm44438-201ENSMUST00000204388 3236 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Uty-208ENSMUST00000154004 4267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 2810403D21Rik-202ENSMUST00000124329 1660 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Ighv3-5-201ENSMUST00000103479 299 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm24376-201ENSMUST00000104399 127 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm23532-201ENSMUST00000104569 112 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm24831-201ENSMUST00000116778 126 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm11386-201ENSMUST00000117761 347 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm9119-201ENSMUST00000118866 495 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm11429-201ENSMUST00000119089 144 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm16428-201ENSMUST00000121193 723 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm26020-201ENSMUST00000122729 183 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm22491-201ENSMUST00000157190 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm20794-201ENSMUST00000177626 628 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm25314-201ENSMUST00000178810 79 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm24713-201ENSMUST00000178850 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm25448-201ENSMUST00000180065 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm11395-201ENSMUST00000181011 499 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Rpl31-ps21-201ENSMUST00000181182 374 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm8816-201ENSMUST00000182280 1163 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm27445-201ENSMUST00000184484 72 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm29009-201ENSMUST00000186340 496 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Ighv1-40-201ENSMUST00000194231 345 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Igkv11-118-201ENSMUST00000199448 346 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm45826-201ENSMUST00000212226 265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 AC153977.1-201ENSMUST00000219416 506 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 AC112935.1-201ENSMUST00000227603 250 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Spag11b-201ENSMUST00000039075 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Defb19-201ENSMUST00000053180 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 n-R5s94-201ENSMUST00000082573 119 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm24623-201ENSMUST00000082616 194 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm24037-201ENSMUST00000082871 180 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm15292-201ENSMUST00000098895 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1325-203ENSMUST00000216108 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Tlr3-205ENSMUST00000209772 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 AC104897.1-201ENSMUST00000222638 3628 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Cyp3a44-201ENSMUST00000067479 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm43896-201ENSMUST00000203440 2032 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 AC153887.2-201ENSMUST00000219160 3838 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Vmn1r219-204ENSMUST00000228113 5639 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 CT025577.1-201ENSMUST00000220862 2846 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm20939-201ENSMUST00000108007 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1168-202ENSMUST00000215996 2322 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Ssbp4Q3U4B1 Gm18337-201ENSMUST00000219023 5762 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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