Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Gm43493-201ENSMUST00000199837 202 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Gm43979-201ENSMUST00000203179 475 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Gm44049-201ENSMUST00000204905 2984 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Klra13-ps-204ENSMUST00000205252 640 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Olfr1464-ps1-201ENSMUST00000208760 923 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Gm45455-202ENSMUST00000211156 630 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Olfr528-ps1-201ENSMUST00000211655 728 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 AC132221.1-201ENSMUST00000220577 3841 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 AC140451.2-202ENSMUST00000226156 574 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 AC154532.2-201ENSMUST00000228947 598 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 1700111E14Rik-201ENSMUST00000031863 908 ntTSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 n-R5s197-201ENSMUST00000083302 119 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Olfr1164-201ENSMUST00000099834 1112 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Cyp3a44-201ENSMUST00000067479 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Gm15314-201ENSMUST00000120740 1887 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Olfr803-202ENSMUST00000204641 2385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r29-204ENSMUST00000228038 4520 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Gm44679-201ENSMUST00000207202 2908 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Gm14731-201ENSMUST00000119216 376 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Gm14588-201ENSMUST00000119895 172 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Gm8080-201ENSMUST00000122046 1155 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Gm23867-201ENSMUST00000122649 274 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Serf1-202ENSMUST00000129014 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Mup-ps4-201ENSMUST00000151005 539 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Gm24959-201ENSMUST00000157924 146 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Gm22159-201ENSMUST00000158412 130 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Gm24552-201ENSMUST00000158646 103 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Gm17064-201ENSMUST00000167690 452 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Gm26870-202ENSMUST00000181572 1143 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Olfr289-ps1-201ENSMUST00000192834 369 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Igkv13-61-1-201ENSMUST00000198255 296 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Gm17893-201ENSMUST00000203017 770 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 AC127302.1-201ENSMUST00000215973 1111 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 CT573422.1-201ENSMUST00000216655 405 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 AC091764.1-201ENSMUST00000218029 132 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 AC141895.1-201ENSMUST00000218141 273 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 AC155927.1-201ENSMUST00000220114 1200 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 CT030187.1-201ENSMUST00000220605 252 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 AC154552.4-201ENSMUST00000222171 151 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Tas2r106-201ENSMUST00000076756 927 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Olfr954-201ENSMUST00000080329 945 ntAPPRIS P2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Gm25126-201ENSMUST00000083343 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Cpne9Q1RLL3 Knl1-202ENSMUST00000028802 7800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
Cpne9Q1RLL3 Gm37895-201ENSMUST00000192448 4550 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Cpne9Q1RLL3 Olfr1201-203ENSMUST00000216213 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Cpne9Q1RLL3 Gm5127-201ENSMUST00000101296 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
Cpne9Q1RLL3 Olfr902-202ENSMUST00000213105 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Cpne9Q1RLL3 Catsper4-202ENSMUST00000105878 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
Cpne9Q1RLL3 Gm12878-201ENSMUST00000118744 332 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Cpne9Q1RLL3 Gm11357-201ENSMUST00000119758 954 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Cpne9Q1RLL3 Gm14913-201ENSMUST00000120011 1093 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Cpne9Q1RLL3 Gm15061-201ENSMUST00000121076 1046 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Cpne9Q1RLL3 Gm12956-201ENSMUST00000122184 414 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Cpne9Q1RLL3 Gm23387-201ENSMUST00000158586 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Cpne9Q1RLL3 Vmn2r-ps118-201ENSMUST00000176785 908 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Cpne9Q1RLL3 Gm24754-201ENSMUST00000177997 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Cpne9Q1RLL3 Gm21732-201ENSMUST00000179309 1083 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Cpne9Q1RLL3 Mir6338-201ENSMUST00000183389 109 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Cpne9Q1RLL3 Mir6371-201ENSMUST00000184470 111 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Cpne9Q1RLL3 Gm37081-201ENSMUST00000192034 196 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Cpne9Q1RLL3 Gm37732-201ENSMUST00000194377 316 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Cpne9Q1RLL3 Gm37993-201ENSMUST00000195301 988 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Cpne9Q1RLL3 Gm43901-201ENSMUST00000203247 453 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Cpne9Q1RLL3 Gm18268-201ENSMUST00000208445 943 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Cpne9Q1RLL3 Gm18414-201ENSMUST00000210858 694 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Cpne9Q1RLL3 AC154552.5-201ENSMUST00000222352 207 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Cpne9Q1RLL3 CT030184.1-201ENSMUST00000222393 416 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Cpne9Q1RLL3 AC123533.1-201ENSMUST00000227782 446 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Cpne9Q1RLL3 Gm23932-201ENSMUST00000082914 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Cpne9Q1RLL3 Gm10234-201ENSMUST00000089304 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r69-201ENSMUST00000163658 2558 ntAPPRIS P2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Cpne9Q1RLL3 Olfr857-202ENSMUST00000212013 2306 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Cpne9Q1RLL3 Gm15176-201ENSMUST00000117734 135 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cpne9Q1RLL3 Gm14669-201ENSMUST00000118841 250 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cpne9Q1RLL3 Gm14411-201ENSMUST00000121798 914 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cpne9Q1RLL3 Gm13096-201ENSMUST00000127752 251 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Cpne9Q1RLL3 4933411O13Rik-202ENSMUST00000140815 370 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Cpne9Q1RLL3 Prl2c5-204ENSMUST00000151144 623 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Cpne9Q1RLL3 Gm25391-201ENSMUST00000157342 134 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cpne9Q1RLL3 Gm17061-201ENSMUST00000163167 499 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cpne9Q1RLL3 Gm17164-201ENSMUST00000169013 506 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cpne9Q1RLL3 Vmn1r-ps86-201ENSMUST00000174052 547 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cpne9Q1RLL3 Gm5224-201ENSMUST00000183060 350 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cpne9Q1RLL3 Gm44477-201ENSMUST00000199661 110 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cpne9Q1RLL3 Gm44966-201ENSMUST00000208096 157 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cpne9Q1RLL3 Gm17850-201ENSMUST00000210023 1154 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cpne9Q1RLL3 Sult3a2-202ENSMUST00000223295 930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Cpne9Q1RLL3 AC129017.1-201ENSMUST00000228363 270 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
Cpne9Q1RLL3 Klra7-201ENSMUST00000032286 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
Cpne9Q1RLL3 Olfr1313-203ENSMUST00000216071 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Cpne9Q1RLL3 Olfr1177-ps-202ENSMUST00000216713 2821 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
Cpne9Q1RLL3 Zfp160-201ENSMUST00000088811 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
Cpne9Q1RLL3 Ppp1r3a-201ENSMUST00000045096 6965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
Cpne9Q1RLL3 Gm14404-201ENSMUST00000119117 1660 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Cpne9Q1RLL3 Olfr847-202ENSMUST00000216839 2385 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
Cpne9Q1RLL3 Gm26154-201ENSMUST00000102339 96 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Cpne9Q1RLL3 Gm22494-201ENSMUST00000104495 128 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Cpne9Q1RLL3 Gm14566-201ENSMUST00000118915 321 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Cpne9Q1RLL3 Gm12640-201ENSMUST00000120097 310 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.5 ms