Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm8200-201ENSMUST00000122390 222 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm16084-201ENSMUST00000148122 620 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm22277-201ENSMUST00000157204 277 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm23829-201ENSMUST00000157392 270 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm25428-201ENSMUST00000157608 114 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm22328-201ENSMUST00000158074 112 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Rpl31-ps18-201ENSMUST00000180885 377 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Rp31-ps19-201ENSMUST00000180929 353 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm27834-201ENSMUST00000183427 125 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Scgb3a2-203ENSMUST00000189750 578 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm9696-202ENSMUST00000191541 830 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm38270-201ENSMUST00000192721 407 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm43604-201ENSMUST00000199799 705 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Dnajc5g-202ENSMUST00000201740 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm38944-201ENSMUST00000208218 512 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm33958-201ENSMUST00000222879 450 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 AC164297.3-201ENSMUST00000224238 94 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Znrd1as-201ENSMUST00000040177 976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Sprr2e-201ENSMUST00000068399 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm5265-201ENSMUST00000076828 342 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Olfr1459-201ENSMUST00000078299 1102 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 mt-Atp8-201ENSMUST00000082407 204 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm23928-201ENSMUST00000082469 145 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm26497-201ENSMUST00000083146 107 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Mir202-201ENSMUST00000083568 72 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm26329-201ENSMUST00000093723 110 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Vmn2r48-201ENSMUST00000165611 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Vmn2r51-201ENSMUST00000094863 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Olfr1440-208ENSMUST00000217062 7484 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Clhc1-204ENSMUST00000208530 2062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Polk-202ENSMUST00000091387 2382 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm14305-202ENSMUST00000108981 1646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Olfr992-203ENSMUST00000214895 2222 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Olfr128-202ENSMUST00000216440 3644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 2310001H17Rik-203ENSMUST00000181517 3981 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Vmn1r69-201ENSMUST00000163658 2558 ntAPPRIS P2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm31371-201ENSMUST00000211848 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 AC135119.1-201ENSMUST00000227935 3717 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Snora64-201ENSMUST00000104521 134 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Mir466h-201ENSMUST00000104748 81 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm14537-201ENSMUST00000117464 599 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm12686-201ENSMUST00000120546 397 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm6565-201ENSMUST00000121217 438 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm15212-201ENSMUST00000122403 466 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm22389-201ENSMUST00000158193 301 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Mir5134-201ENSMUST00000175529 78 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Mir3620-201ENSMUST00000184710 61 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm27899-201ENSMUST00000184715 64 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm28304-201ENSMUST00000185977 312 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm5372-201ENSMUST00000187540 409 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm29256-201ENSMUST00000189094 312 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm28484-201ENSMUST00000190606 312 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm44349-201ENSMUST00000197048 123 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Rpl18a-ps3-201ENSMUST00000198938 171 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm43067-201ENSMUST00000201580 445 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 4930487D11Rik-201ENSMUST00000201983 295 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm44881-201ENSMUST00000205425 367 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 2200007N16Rik-201ENSMUST00000206367 238 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Olfr1478-ps1-201ENSMUST00000208393 391 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 AC125374.2-201ENSMUST00000214278 162 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 AC154328.1-201ENSMUST00000225875 307 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm6361-201ENSMUST00000091031 435 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Vmn2r75-201ENSMUST00000167830 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Olfr843-202ENSMUST00000214019 7499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Dnah12-201ENSMUST00000022433 12009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Dnah6-203ENSMUST00000114040 12513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
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ptchd1Q14B62 Gm45792-201ENSMUST00000207795 4268 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
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ptchd1Q14B62 Gm22453-201ENSMUST00000122801 318 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
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ptchd1Q14B62 Gm9376-201ENSMUST00000171107 729 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm7958-201ENSMUST00000178255 468 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm7950-201ENSMUST00000179633 468 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm27477-201ENSMUST00000184649 143 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm28710-201ENSMUST00000186866 489 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm29610-201ENSMUST00000187749 453 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm42695-201ENSMUST00000199445 818 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 2400006E01Rik-203ENSMUST00000199633 643 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm45879-201ENSMUST00000212521 392 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 AC158395.1-201ENSMUST00000227206 452 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 AC122397.2-201ENSMUST00000227422 686 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm10088-201ENSMUST00000074116 423 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Pip-201ENSMUST00000075351 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm22358-201ENSMUST00000082877 122 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm23510-201ENSMUST00000083083 163 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm24457-201ENSMUST00000083196 105 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm25482-201ENSMUST00000083225 107 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm25188-201ENSMUST00000083913 122 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 A630033H20Rik-201ENSMUST00000067249 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Olfr1493-ps1-201ENSMUST00000207208 1777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Klra2-201ENSMUST00000032306 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Btbd35f12-201ENSMUST00000178827 1908 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
ptchd1Q14B62 Gm37899-201ENSMUST00000193116 8717 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
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