Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm12878-201ENSMUST00000118744 332 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Gm14669-201ENSMUST00000118841 250 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Gm5937-201ENSMUST00000119715 643 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 1700036O09Rik-201ENSMUST00000136834 349 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Gm14211-201ENSMUST00000152250 408 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Gm22947-201ENSMUST00000158559 91 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Gm16289-201ENSMUST00000162079 183 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Gm17119-201ENSMUST00000163943 280 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Arpp19-211ENSMUST00000170310 899 ntTSL 3 BASIC2.56□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Gm20415-201ENSMUST00000172877 423 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r-ps61-201ENSMUST00000173771 822 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Gm29192-201ENSMUST00000190942 377 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Gm43301-201ENSMUST00000198918 778 ntTSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Gm43587-201ENSMUST00000199590 204 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Gm44477-201ENSMUST00000199661 110 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Gm17893-201ENSMUST00000203017 770 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Nat1-202ENSMUST00000212171 1208 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Olfr953-ps1-201ENSMUST00000214463 892 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Gm18252-203ENSMUST00000215855 757 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 AC123533.1-201ENSMUST00000227782 446 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Pmch-201ENSMUST00000048621 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.56□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Olfr820-201ENSMUST00000059244 1061 ntAPPRIS P1 BASIC2.56□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Gm26128-201ENSMUST00000083170 110 ntBASIC2.56□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Gm37479-201ENSMUST00000194169 3841 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Gm23691-201ENSMUST00000101878 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Zcchc9-ps-201ENSMUST00000117884 786 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Gm6923-201ENSMUST00000118343 406 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Gm7869-201ENSMUST00000121457 1322 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Gm12956-201ENSMUST00000122184 414 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Gm11842-201ENSMUST00000130117 556 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Gm15969-201ENSMUST00000151967 236 ntTSL 3 BASIC2.55□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Gm23032-201ENSMUST00000157995 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Obox4-ps3-201ENSMUST00000183474 520 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Gm38213-201ENSMUST00000193203 173 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Gm37754-201ENSMUST00000194406 452 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Gm37063-201ENSMUST00000194678 3520 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Gm43896-201ENSMUST00000203440 2032 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Gm44332-201ENSMUST00000203712 433 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 4930595L18Rik-201ENSMUST00000204069 506 ntTSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Gm44520-201ENSMUST00000205447 802 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Gm2446-201ENSMUST00000220144 772 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 AC131085.1-201ENSMUST00000224746 656 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 AC109172.1-201ENSMUST00000227503 187 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 AC115357.1-201ENSMUST00000227575 466 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 AC168062.2-201ENSMUST00000228907 422 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Efcab9-201ENSMUST00000054327 754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Tas2r124-201ENSMUST00000076150 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Gm25008-201ENSMUST00000083809 81 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Olfr1040-201ENSMUST00000099909 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.55□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Olfr785-201ENSMUST00000204402 2014 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Hif1a-202ENSMUST00000110461 4385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Ifi214-203ENSMUST00000139092 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Zfp984-201ENSMUST00000105734 2729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Rps13-ps8-201ENSMUST00000118906 401 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Gm12368-201ENSMUST00000122251 434 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Gm22390-201ENSMUST00000157588 325 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Gm22093-201ENSMUST00000158980 111 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Vmn2r-ps77-201ENSMUST00000174505 320 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Olfr306-ps1-201ENSMUST00000174677 743 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Gm26622-201ENSMUST00000180520 298 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Gm6801-201ENSMUST00000190697 339 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Trbv7-201ENSMUST00000193339 402 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Mir3069-201ENSMUST00000198802 65 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Olfr428-ps1-201ENSMUST00000201135 466 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Gm45438-201ENSMUST00000210242 564 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 AC152951.1-201ENSMUST00000218907 266 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 AC140285.1-201ENSMUST00000220472 452 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Vmn2r-ps99-201ENSMUST00000221276 1203 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Olfr802-201ENSMUST00000074713 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Gm23096-201ENSMUST00000083447 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Ifi203-205ENSMUST00000129829 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Gm43663-201ENSMUST00000198643 1505 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Gm22936-201ENSMUST00000103955 126 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Gm6664-201ENSMUST00000119138 468 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Gm15452-201ENSMUST00000119877 240 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Gm13751-201ENSMUST00000120280 752 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Gm11430-201ENSMUST00000121317 217 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Gm23033-201ENSMUST00000157996 134 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Gm23034-201ENSMUST00000158001 147 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Gm24358-201ENSMUST00000158424 288 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Gm20450-201ENSMUST00000173652 147 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r-ps57-201ENSMUST00000174879 288 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Gm8676-201ENSMUST00000184206 637 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Gm18982-201ENSMUST00000198118 529 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Gm44657-201ENSMUST00000208568 450 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 AC159476.2-201ENSMUST00000216221 418 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Gm18729-201ENSMUST00000217230 621 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 4930520P13Rik-201ENSMUST00000222622 505 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 AC156574.2-201ENSMUST00000228023 282 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Gm25856-201ENSMUST00000082786 75 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Gm22740-201ENSMUST00000083439 109 ntBASIC2.53□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Olfr893-201ENSMUST00000093867 942 ntAPPRIS P2 BASIC2.53□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 Adgrg4-205ENSMUST00000154818 8857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
Traf3ip1Q149C2 AC154511.1-201ENSMUST00000222578 1587 ntBASIC2.53□□□□□ -2.01
Traf3ip1Q149C2 A330044P14Rik-201ENSMUST00000176108 2706 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Traf3ip1Q149C2 Gm45844-205ENSMUST00000210333 3861 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
Traf3ip1Q149C2 Gm26342-201ENSMUST00000104557 129 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Traf3ip1Q149C2 n-R5s26-201ENSMUST00000104601 122 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Traf3ip1Q149C2 Mir467h-201ENSMUST00000116759 121 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Traf3ip1Q149C2 Gm14128-201ENSMUST00000119514 1011 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.1 ms