Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm42781-201ENSMUST00000201317 2719 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Ugt2b35-201ENSMUST00000031186 3359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Gm22020-201ENSMUST00000104358 136 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Gm14560-201ENSMUST00000118672 375 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Gm6025-201ENSMUST00000121517 201 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Gm15735-201ENSMUST00000136187 514 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Gm26153-201ENSMUST00000157433 127 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Gm23534-201ENSMUST00000157539 97 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Gm25865-201ENSMUST00000158247 104 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Gm26360-201ENSMUST00000158872 103 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Gm44524-201ENSMUST00000203899 271 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Gm44784-201ENSMUST00000207396 460 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 AC161256.1-201ENSMUST00000217312 213 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 AC153553.1-201ENSMUST00000218257 684 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 AC124420.1-201ENSMUST00000219779 791 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Sprr2e-201ENSMUST00000068399 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Gm23796-201ENSMUST00000084011 160 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Slfn10-ps-201ENSMUST00000100716 3621 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Olfr877-202ENSMUST00000213956 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 St18-210ENSMUST00000150761 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Flrt2-201ENSMUST00000057324 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Tcf7l2-202ENSMUST00000061496 4053 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Vmn1r6-202ENSMUST00000226689 8453 ntAPPRIS P2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Atp12a-201ENSMUST00000007340 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Gm45093-201ENSMUST00000206859 2463 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Zfp788-202ENSMUST00000098508 3775 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Gm10165-201ENSMUST00000217666 2380 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Zfp369-202ENSMUST00000126879 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Gm10471-201ENSMUST00000094946 2967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 4931408C20Rik-201ENSMUST00000097801 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Gm9218-201ENSMUST00000121068 2694 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Olfr417-203ENSMUST00000220394 6080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Olfr432-202ENSMUST00000213211 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Gtpbp4-204ENSMUST00000222098 8783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Otc-202ENSMUST00000115528 2997 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Prom1-206ENSMUST00000171543 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Xpo7-203ENSMUST00000226448 3663 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 AC154755.2-201ENSMUST00000224384 2857 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Naip2-203ENSMUST00000167986 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Gm25096-201ENSMUST00000104043 129 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Gm22031-201ENSMUST00000116945 126 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Gm25112-201ENSMUST00000122680 104 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Mir1947-201ENSMUST00000158235 85 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Parp4-201ENSMUST00000161553 6387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Gm3211-201ENSMUST00000172721 304 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Gm18546-201ENSMUST00000197245 676 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Gm45080-201ENSMUST00000206648 283 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Snord61-201ENSMUST00000083176 71 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Gm23453-201ENSMUST00000083326 106 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Gm22826-201ENSMUST00000083774 165 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Gm26175-201ENSMUST00000083794 131 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Ptprj-202ENSMUST00000111495 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Gria4-204ENSMUST00000212533 5207 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Il2ra-201ENSMUST00000028111 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Kcnma1-202ENSMUST00000074983 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Elmod1-202ENSMUST00000166580 2243 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Dnhd1-203ENSMUST00000145988 14536 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Vmn2r6-201ENSMUST00000165012 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Vmn2r7-203ENSMUST00000168072 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Vmn1r171-202ENSMUST00000226128 3063 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Vmn2r89-202ENSMUST00000159734 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 1500005C15Rik-201ENSMUST00000199867 2394 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Gm43009-201ENSMUST00000199979 3566 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Gm29221-201ENSMUST00000186092 2894 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Cdh6-201ENSMUST00000036439 8167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Lcp2-201ENSMUST00000052413 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Atp2b4-206ENSMUST00000143567 11725 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Gm8473-201ENSMUST00000176697 1885 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Gm15583-201ENSMUST00000116191 3510 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 4732496C06Rik-201ENSMUST00000206533 2500 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Igkv10-94-201ENSMUST00000103330 347 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Gm13149-201ENSMUST00000122071 339 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Hba-ps4-201ENSMUST00000128900 447 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Gm24552-201ENSMUST00000158646 103 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Igkv3-12-1-201ENSMUST00000197093 351 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Gm45422-201ENSMUST00000211476 246 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 mt-Ta-201ENSMUST00000082398 69 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Mir21a-201ENSMUST00000083521 92 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Gm26168-201ENSMUST00000083787 112 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Rsrc2-203ENSMUST00000111515 4223 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Vmn2r106-201ENSMUST00000167464 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Vmn2r88-204ENSMUST00000228139 3227 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Gm37777-201ENSMUST00000195546 3366 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Olfr18-203ENSMUST00000212943 2896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Vmn1r175-202ENSMUST00000228383 2878 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Olfr983-202ENSMUST00000213087 6196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Vmn1r34-204ENSMUST00000226999 3048 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Pola1-201ENSMUST00000006856 5346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Gbp7-201ENSMUST00000045097 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Gm22266-201ENSMUST00000104011 138 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 S100a5-201ENSMUST00000001049 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 S100a5-202ENSMUST00000107329 431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Gm12328-201ENSMUST00000118611 197 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Gm11325-201ENSMUST00000119967 469 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 n-R5s61-201ENSMUST00000122711 118 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 2210408F21Rik-203ENSMUST00000133510 429 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Gm23121-201ENSMUST00000157653 173 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Gm25605-201ENSMUST00000158364 124 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 Gm3143-201ENSMUST00000196308 580 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
Sox12Q04890 4930487D11Rik-201ENSMUST00000201983 295 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.2 ms