Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm28283-201ENSMUST00000185509 178 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm8242-202ENSMUST00000193056 475 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Eif4e-205ENSMUST00000200100 729 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm45455-202ENSMUST00000211156 630 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Olfr1088-ps1-201ENSMUST00000213686 863 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 AC101677.1-201ENSMUST00000218590 158 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 AC154484.1-201ENSMUST00000227311 771 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 CT030238.4-201ENSMUST00000228579 801 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
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Ccl20O89093 Olfr395-201ENSMUST00000072991 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm24035-201ENSMUST00000082867 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm813-201ENSMUST00000099663 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Chst9-201ENSMUST00000053017 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 E430014B02Rik-201ENSMUST00000194215 3156 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
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Ccl20O89093 Cyp3a41b-201ENSMUST00000075837 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Olfr785-201ENSMUST00000204402 2014 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm17146-201ENSMUST00000108464 372 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
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Ccl20O89093 Gm14292-201ENSMUST00000118761 456 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm12819-201ENSMUST00000122223 629 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Zfp950-205ENSMUST00000148569 192 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm15969-201ENSMUST00000151967 236 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm25283-201ENSMUST00000157272 77 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm25391-201ENSMUST00000157342 134 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm7568-203ENSMUST00000161626 415 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm22853-201ENSMUST00000174974 131 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm4076-201ENSMUST00000179230 965 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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Ccl20O89093 Gm29641-201ENSMUST00000188955 259 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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Ccl20O89093 Gm37417-201ENSMUST00000195257 454 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm42425-201ENSMUST00000197756 565 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm43264-201ENSMUST00000202284 325 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm34701-202ENSMUST00000204685 360 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm44520-201ENSMUST00000205447 802 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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Ccl20O89093 AC132918.1-201ENSMUST00000227877 925 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
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Ccl20O89093 S100a11-201ENSMUST00000029515 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
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Ccl20O89093 Sly-201ENSMUST00000189109 797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
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Ccl20O89093 Gm28504-201ENSMUST00000190977 666 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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Ccl20O89093 Gm38044-201ENSMUST00000192964 487 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm31511-201ENSMUST00000193134 657 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm35843-201ENSMUST00000193716 666 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
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Ccl20O89093 Gm45226-201ENSMUST00000206602 288 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm45232-201ENSMUST00000207811 162 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm45522-201ENSMUST00000210784 166 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Olfr837-201ENSMUST00000212482 1040 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 AL731706.1-202ENSMUST00000226652 180 ntAPPRIS P5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Olfr305-201ENSMUST00000069236 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Olfr1095-201ENSMUST00000099874 927 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Tlr7-202ENSMUST00000112161 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Olfr799-202ENSMUST00000213820 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm14657-201ENSMUST00000117461 302 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Rpl31-ps22-201ENSMUST00000117961 337 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
Ccl20O89093 Gm14411-201ENSMUST00000121798 914 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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