Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Olfr389-201ENSMUST00000122224 3057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Esp34-201ENSMUST00000173055 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Esp34-202ENSMUST00000178654 1413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Olfr1093-202ENSMUST00000213354 2240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm11009-201ENSMUST00000108961 417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Igkv13-87-201ENSMUST00000114214 286 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm13614-201ENSMUST00000117306 503 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm13122-201ENSMUST00000118380 453 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm24901-201ENSMUST00000158125 110 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm26215-201ENSMUST00000158584 139 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Mir3470b-201ENSMUST00000175563 126 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Mir5136-201ENSMUST00000175573 76 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Pnrc2-203ENSMUST00000180300 171 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gtpbp4-ps4-201ENSMUST00000184813 258 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm28781-201ENSMUST00000185760 696 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm7329-201ENSMUST00000185915 210 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm29574-201ENSMUST00000186226 696 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm28828-201ENSMUST00000186601 696 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm21673-201ENSMUST00000186640 436 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm29307-201ENSMUST00000187367 696 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm21135-201ENSMUST00000189023 436 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm28151-201ENSMUST00000189404 951 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm29339-201ENSMUST00000189613 696 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm28954-201ENSMUST00000190031 437 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm19193-201ENSMUST00000190263 590 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm28159-201ENSMUST00000190296 696 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Ly96-202ENSMUST00000190366 429 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm29407-201ENSMUST00000191468 696 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm31942-202ENSMUST00000195375 437 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Crs-ps-201ENSMUST00000203723 760 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm44910-201ENSMUST00000208451 396 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm45341-201ENSMUST00000210850 1104 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Olfr861-ps1-201ENSMUST00000212783 928 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm39380-201ENSMUST00000214710 192 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm18113-201ENSMUST00000220630 303 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 AC134420.1-201ENSMUST00000227027 289 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Olfr820-201ENSMUST00000059244 1061 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 AC154386.1-201ENSMUST00000222753 2871 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Ifi213-202ENSMUST00000150649 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Olfr513-202ENSMUST00000214670 2029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Chst9-201ENSMUST00000053017 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Gm42801-201ENSMUST00000202562 2865 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Plek-202ENSMUST00000102881 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 Olfr116-202ENSMUST00000216128 4477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
Opn1mwO35599 AC153887.2-201ENSMUST00000219160 3838 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Opn1mwO35599 Olfr469-202ENSMUST00000213252 3164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Opn1mwO35599 Olfr107-202ENSMUST00000215894 2512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Opn1mwO35599 Vmn1r71-208ENSMUST00000228374 3717 ntAPPRIS P2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Opn1mwO35599 Rps24-201ENSMUST00000112384 468 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Opn1mwO35599 Gm15936-201ENSMUST00000118706 460 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Opn1mwO35599 Gm14100-201ENSMUST00000125575 651 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Opn1mwO35599 Ssxb6-201ENSMUST00000138642 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Opn1mwO35599 Gm22322-201ENSMUST00000157151 111 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Opn1mwO35599 Gm26041-201ENSMUST00000158148 108 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Opn1mwO35599 Gm22766-201ENSMUST00000158372 99 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Opn1mwO35599 Gm26214-201ENSMUST00000158581 107 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Opn1mwO35599 Gm27660-201ENSMUST00000184028 208 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Opn1mwO35599 Gm7858-201ENSMUST00000190177 622 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Opn1mwO35599 Gm18964-201ENSMUST00000193013 563 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Opn1mwO35599 1700108N06Rik-201ENSMUST00000196572 681 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Opn1mwO35599 4930437M23Rik-201ENSMUST00000197456 968 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Opn1mwO35599 Gm6135-201ENSMUST00000198726 372 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Opn1mwO35599 Gm43358-201ENSMUST00000199217 970 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Opn1mwO35599 Gm43131-201ENSMUST00000200042 969 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Opn1mwO35599 Gm40292-201ENSMUST00000202383 553 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Opn1mwO35599 Gm35931-201ENSMUST00000203931 448 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Opn1mwO35599 Gm44128-201ENSMUST00000204909 219 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Opn1mwO35599 Gm45101-201ENSMUST00000208327 232 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Opn1mwO35599 AC166830.1-201ENSMUST00000224201 533 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Opn1mwO35599 AC154329.2-201ENSMUST00000225257 383 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Opn1mwO35599 AC124746.2-201ENSMUST00000226594 427 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Opn1mwO35599 Olfr823-201ENSMUST00000081469 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Opn1mwO35599 Gm25859-201ENSMUST00000083710 91 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
Opn1mwO35599 Fnd3c2-201ENSMUST00000091282 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Opn1mwO35599 Olfr986-203ENSMUST00000216720 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Opn1mwO35599 Vmn1r46-203ENSMUST00000226715 10861 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Opn1mwO35599 Vmn1r46-205ENSMUST00000228349 10861 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
Opn1mwO35599 Vmn2r37-201ENSMUST00000072787 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
Opn1mwO35599 Lztfl1-201ENSMUST00000026274 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
Opn1mwO35599 Depdc1a-201ENSMUST00000029825 2920 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
Opn1mwO35599 Olfr679-204ENSMUST00000215704 5018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Opn1mwO35599 Gm15097-202ENSMUST00000112741 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Opn1mwO35599 Pkhd1l1-202ENSMUST00000166957 12747 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Opn1mwO35599 Pkhd1l1-201ENSMUST00000038336 12741 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
Opn1mwO35599 Olfr1434-201ENSMUST00000207186 2714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Opn1mwO35599 Trav14d-2-201ENSMUST00000103597 276 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Opn1mwO35599 Trav14n-2-201ENSMUST00000103623 276 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Opn1mwO35599 n-R5s52-201ENSMUST00000104614 113 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Opn1mwO35599 Gm12793-201ENSMUST00000119268 292 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Opn1mwO35599 AA413626-201ENSMUST00000121125 494 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Opn1mwO35599 Gm11849-201ENSMUST00000121293 261 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Opn1mwO35599 Gm11471-201ENSMUST00000121824 198 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Opn1mwO35599 Gm9225-201ENSMUST00000121921 836 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Opn1mwO35599 Gm14578-201ENSMUST00000122166 391 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Opn1mwO35599 Gm15077-201ENSMUST00000122344 362 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Opn1mwO35599 Gm23124-201ENSMUST00000157650 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Opn1mwO35599 Gm23068-201ENSMUST00000158239 293 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Opn1mwO35599 Gm22631-201ENSMUST00000179656 94 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Opn1mwO35599 Gm22633-201ENSMUST00000179834 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
Opn1mwO35599 Gm27921-201ENSMUST00000183968 108 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
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