Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Gm24061-201ENSMUST00000157489 120 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Vmn1r77-201ENSMUST00000164446 921 ntAPPRIS P2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Gm18982-201ENSMUST00000198118 529 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Gm31752-201ENSMUST00000199456 856 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Gm34701-202ENSMUST00000204685 360 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Gm45742-201ENSMUST00000212400 433 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Cenpk-201ENSMUST00000022227 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Spata45-201ENSMUST00000077889 432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Olfr191-201ENSMUST00000078517 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Gm25005-201ENSMUST00000083812 156 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Gm44438-201ENSMUST00000204388 3236 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Gm36669-201ENSMUST00000201757 3650 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Vmn1r178-202ENSMUST00000226450 2880 ntAPPRIS P1 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Gm11438-201ENSMUST00000121582 189 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Esp8-201ENSMUST00000171813 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Gm20386-201ENSMUST00000174010 132 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Mir6950-201ENSMUST00000184438 73 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Gm29754-201ENSMUST00000206269 358 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Olfr1156-201ENSMUST00000099842 1076 ntAPPRIS P1 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Olfr805-204ENSMUST00000217219 3314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Gm15526-201ENSMUST00000112504 204 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Gm12934-201ENSMUST00000119221 343 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Mup-ps12-201ENSMUST00000126217 549 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Mir7063-201ENSMUST00000184158 91 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Gm28730-201ENSMUST00000185939 702 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Gm28710-201ENSMUST00000186866 489 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Gm28802-201ENSMUST00000188624 944 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 1700112D23Rik-202ENSMUST00000193387 299 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 AC132881.2-201ENSMUST00000225474 709 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Gm14988-201ENSMUST00000117224 1548 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Olfr1218-204ENSMUST00000215054 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Omd-201ENSMUST00000065494 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Gm15951-201ENSMUST00000118377 400 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Gm45368-201ENSMUST00000209323 703 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 C130026I21Rik-207ENSMUST00000162421 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Gm27580-201ENSMUST00000183666 149 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 4921527H02Rik-202ENSMUST00000196005 947 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Gm6590-201ENSMUST00000203343 687 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Gm3848-201ENSMUST00000136693 299 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Vmn2r-ps76-201ENSMUST00000173876 739 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Gm14815-201ENSMUST00000120060 488 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Gm23585-201ENSMUST00000157656 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Vmn1r-ps141-201ENSMUST00000176293 753 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 1700040F17Rik-201ENSMUST00000187158 817 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Gm44989-201ENSMUST00000204749 217 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 AC211878.4-201ENSMUST00000220970 262 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 AC126554.1-201ENSMUST00000222161 271 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Gm25378-201ENSMUST00000104333 129 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Sel1l2-201ENSMUST00000120133 579 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Gm25108-201ENSMUST00000122473 78 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Gm27980-201ENSMUST00000184094 169 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Gm36929-201ENSMUST00000195152 166 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Gm43619-201ENSMUST00000197267 914 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Sult1c2-ps1-201ENSMUST00000200231 164 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Gm16351-202ENSMUST00000209660 337 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 AC154270.1-201ENSMUST00000227226 426 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Olfr787-201ENSMUST00000077836 939 ntAPPRIS P1 BASIC1.05□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Gm24793-201ENSMUST00000104289 132 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Gm14039-201ENSMUST00000118705 101 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Gm22583-201ENSMUST00000178031 107 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Gm20948-201ENSMUST00000211091 449 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Gm26168-201ENSMUST00000083787 112 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Olfr172-201ENSMUST00000095991 1089 ntAPPRIS P1 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Olfr165-202ENSMUST00000206110 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Gm13419-201ENSMUST00000121711 271 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Gm24770-201ENSMUST00000158505 92 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Gm22074-201ENSMUST00000158595 113 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Gm44578-201ENSMUST00000207236 3835 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Gm45687-201ENSMUST00000209454 155 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Olfr8-201ENSMUST00000081571 933 ntAPPRIS P1 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Olfr57-201ENSMUST00000082244 1080 ntAPPRIS P1 BASIC1.04□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Gm14405-201ENSMUST00000117808 2330 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Gm13577-201ENSMUST00000121365 205 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Vmn1r-ps15-201ENSMUST00000177365 910 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Gm28850-201ENSMUST00000189058 622 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Gm38044-201ENSMUST00000192964 487 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Gm44254-201ENSMUST00000204184 322 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Olfr58-202ENSMUST00000215112 2454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.03□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Gm42448-201ENSMUST00000197122 2644 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Olfr820-202ENSMUST00000214917 4701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Olfr799-205ENSMUST00000217364 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Gm24280-201ENSMUST00000104237 134 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Gm6461-201ENSMUST00000120015 633 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Vmn1r-ps48-201ENSMUST00000176352 886 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Gm36994-201ENSMUST00000192941 492 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 AC098718.1-201ENSMUST00000226166 175 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Vmn1r20-201ENSMUST00000226808 912 ntAPPRIS P1 BASIC1.03□□□□□ -2.24
Usp9yF8VPU6 Gm15443-201ENSMUST00000118947 820 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Vmn1r-ps135-201ENSMUST00000120909 595 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Gm23122-201ENSMUST00000157645 103 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Gm6788-201ENSMUST00000166459 270 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Gm23813-201ENSMUST00000175153 77 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Gm43925-201ENSMUST00000203498 206 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Gm43954-201ENSMUST00000204634 544 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Mucl1-202ENSMUST00000226484 758 ntAPPRIS P5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Olfr729-201ENSMUST00000061020 972 ntAPPRIS P1 BASIC1.02□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Eif3s6-ps4-201ENSMUST00000202873 1388 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Vmn1r78-203ENSMUST00000228664 8100 ntAPPRIS P1 BASIC1.02□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Gm8251-201ENSMUST00000168641 5985 ntAPPRIS P1 BASIC1.02□□□□□ -2.25
Usp9yF8VPU6 Snord65-201ENSMUST00000104269 72 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
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