Protein–RNA interactions for Protein: B1AZQ8

Cldn34b1, Claudin 34B1, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b1B1AZQ8 Wnk3-205ENSMUST00000184392 5394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
Cldn34b1B1AZQ8 AC137842.3-201ENSMUST00000228855 2397 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Cldn34b1B1AZQ8 Vmn2r42-205ENSMUST00000146278 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Cldn34b1B1AZQ8 Gm14987-201ENSMUST00000117820 676 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Cldn34b1B1AZQ8 Gm14837-201ENSMUST00000119688 206 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Cldn34b1B1AZQ8 Gm14687-201ENSMUST00000120206 363 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Cldn34b1B1AZQ8 Gm15037-201ENSMUST00000120358 259 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Cldn34b1B1AZQ8 Gm11849-201ENSMUST00000121293 261 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Cldn34b1B1AZQ8 Gm14638-201ENSMUST00000121338 216 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Cldn34b1B1AZQ8 Uqcrh-ps2-201ENSMUST00000121613 269 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Cldn34b1B1AZQ8 Gm22434-201ENSMUST00000158549 122 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Cldn34b1B1AZQ8 Gm10075-201ENSMUST00000162030 545 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Cldn34b1B1AZQ8 Gm17119-201ENSMUST00000163943 280 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Cldn34b1B1AZQ8 Snord116l14-201ENSMUST00000179875 94 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Cldn34b1B1AZQ8 Gm27385-201ENSMUST00000184747 104 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Cldn34b1B1AZQ8 4930404A12Rik-201ENSMUST00000199356 726 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
Cldn34b1B1AZQ8 Gm18854-201ENSMUST00000211196 329 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Cldn34b1B1AZQ8 Gm17990-201ENSMUST00000211728 553 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Cldn34b1B1AZQ8 Gm20102-201ENSMUST00000222445 220 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Cldn34b1B1AZQ8 AC124549.2-201ENSMUST00000224243 222 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Cldn34b1B1AZQ8 Defb8-201ENSMUST00000033854 287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
Cldn34b1B1AZQ8 Cd52-201ENSMUST00000000696 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
Cldn34b1B1AZQ8 Gm23932-201ENSMUST00000082914 107 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
Cldn34b1B1AZQ8 Gm9747-201ENSMUST00000023262 2822 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Cldn34b1B1AZQ8 Olfr715-202ENSMUST00000214919 5114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Cldn34b1B1AZQ8 Gm14288-201ENSMUST00000109020 3438 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
Cldn34b1B1AZQ8 Olfr1448-204ENSMUST00000216888 4064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Cldn34b1B1AZQ8 Cbll1-201ENSMUST00000064240 3937 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
Cldn34b1B1AZQ8 AC132237.1-201ENSMUST00000220950 4475 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cldn34b1B1AZQ8 Gm23256-201ENSMUST00000102235 110 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cldn34b1B1AZQ8 Gm26140-201ENSMUST00000103807 110 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cldn34b1B1AZQ8 Mir294-201ENSMUST00000104710 84 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cldn34b1B1AZQ8 2610042L04Rik-201ENSMUST00000112778 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Cldn34b1B1AZQ8 Gm12902-201ENSMUST00000118389 322 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cldn34b1B1AZQ8 Gm12294-201ENSMUST00000119723 490 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cldn34b1B1AZQ8 Gm12640-201ENSMUST00000120097 310 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cldn34b1B1AZQ8 Gm6762-201ENSMUST00000121769 289 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cldn34b1B1AZQ8 n-R5s179-201ENSMUST00000122564 118 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cldn34b1B1AZQ8 Gm16351-201ENSMUST00000142008 250 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Cldn34b1B1AZQ8 Gm16311-201ENSMUST00000161939 702 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Cldn34b1B1AZQ8 Obox4-ps35-201ENSMUST00000173825 680 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Cldn34b1B1AZQ8 Vmn2r-ps70-201ENSMUST00000174636 302 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cldn34b1B1AZQ8 Gm22908-201ENSMUST00000177620 110 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cldn34b1B1AZQ8 Ifi213-205ENSMUST00000180215 643 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
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Cldn34b1B1AZQ8 Gm45387-201ENSMUST00000209792 632 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
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Cldn34b1B1AZQ8 CT009604.2-201ENSMUST00000225531 377 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
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Cldn34b1B1AZQ8 Gm37879-201ENSMUST00000193112 1995 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
Cldn34b1B1AZQ8 Cfh-206ENSMUST00000192880 3746 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
Cldn34b1B1AZQ8 D030040B21Rik-201ENSMUST00000181371 2788 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
Cldn34b1B1AZQ8 Zfp442-202ENSMUST00000185796 1833 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Cldn34b1B1AZQ8 Gm3956-201ENSMUST00000164882 2560 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cldn34b1B1AZQ8 Vmn2r36-201ENSMUST00000170402 2561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Cldn34b1B1AZQ8 Depdc1a-201ENSMUST00000029825 2920 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Cldn34b1B1AZQ8 Gm42446-201ENSMUST00000199783 3284 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cldn34b1B1AZQ8 Gm13266-201ENSMUST00000141869 579 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
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Cldn34b1B1AZQ8 Gm29044-201ENSMUST00000188916 283 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
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Cldn34b1B1AZQ8 Tprkb-214ENSMUST00000202803 716 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
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Cldn34b1B1AZQ8 Gm5322-201ENSMUST00000206142 699 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cldn34b1B1AZQ8 Gm36368-201ENSMUST00000212026 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Cldn34b1B1AZQ8 Gm7692-201ENSMUST00000213534 409 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cldn34b1B1AZQ8 Gm18252-201ENSMUST00000214814 527 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Cldn34b1B1AZQ8 CT030247.1-201ENSMUST00000216810 267 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cldn34b1B1AZQ8 AC101945.3-201ENSMUST00000226568 153 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cldn34b1B1AZQ8 Gm25579-201ENSMUST00000083407 106 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cldn34b1B1AZQ8 Tfpi-204ENSMUST00000111714 3614 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Cldn34b1B1AZQ8 Olfr1370-203ENSMUST00000215357 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Cldn34b1B1AZQ8 Gm8473-201ENSMUST00000176697 1885 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Cldn34b1B1AZQ8 Olfr729-203ENSMUST00000215327 4220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Cldn34b1B1AZQ8 Olfr729-204ENSMUST00000215451 4236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Cldn34b1B1AZQ8 Inpp4b-201ENSMUST00000042529 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
Cldn34b1B1AZQ8 Olfr577-203ENSMUST00000215237 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
Cldn34b1B1AZQ8 Mier1-201ENSMUST00000030247 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
Cldn34b1B1AZQ8 Clhc1-204ENSMUST00000208530 2062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.89
Cldn34b1B1AZQ8 Olfr617-202ENSMUST00000215755 3000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.27□□□□□ -1.89
Cldn34b1B1AZQ8 Mctp1-202ENSMUST00000109589 1653 ntTSL 1 (best) BASIC3.27□□□□□ -1.89
Cldn34b1B1AZQ8 Gm5362-201ENSMUST00000211968 3085 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Cldn34b1B1AZQ8 n-R5s219-201ENSMUST00000104328 132 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Cldn34b1B1AZQ8 Gm12805-201ENSMUST00000117305 1048 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Cldn34b1B1AZQ8 Gm14355-201ENSMUST00000117352 264 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Cldn34b1B1AZQ8 Gm14657-201ENSMUST00000117461 302 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Cldn34b1B1AZQ8 Gm6274-201ENSMUST00000118173 797 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Cldn34b1B1AZQ8 Gm14119-201ENSMUST00000119511 235 ntBASIC3.27□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 118.4 ms